ゲルシフトアッセイ

生物学用語辞典

ゲルシフト分析

同義/類義語：ゲルシフト法, ゲルシフトアッセイ,
英訳・(英)同義/類義語：gel mobility shift assay, gel retardation assay, gel shift assay, Gel-mobility shift assay

タンパク質が修飾を受けたり、他の化合物と結合すると、ゲル電気泳動時の移動度が本来のタンパク質とは変化することがる。その変化を指標としてタンパクの結合活性検出する実験手法。

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ゲルシフトアッセイ

出典: フリー百科事典『ウィキペディア（Wikipedia）』 (2023/01/10 03:25 UTC 版)

ゲルシフトアッセイとは特定の塩基配列をもつ核酸断片とタンパク質の結合を調べる実験系。転写因子の結合配列の解析に広く用いられる。EMSA (Electrophoresis Mobility Shift Assay) とも呼ばれる。

原理は核酸断片にタンパク質が結合すると核酸断片のみの場合よりも総体として分子量が大きくなるということで、この結果電気泳動で遅く流れること（移動度 mobility の違い）を利用して可視化する。

具体的な例としては、リンの放射性同位体でDNA断片を標識し、タンパク質と混合したのち、ポリアクリルアミドゲルで展開し、オートラジオグラフィーによって分析する。遊離しているDNA断片は早く流れるため下部にくるが、タンパク質が結合した断片はゆっくり流れるために上部にバンドとしてあらわれる。