非リボソームペプチド
出典: フリー百科事典『ウィキペディア（Wikipedia）』 (2019/09/10 14:13 UTC 版)
基質特異性
多くのドメインは基質特異性が非常に緩く、Aドメインでアミノ酸配列を決定しているだけである。すなわちAドメインがリボソームペプチド合成のコドンに相当する部位に当たる。ただしCドメインは同一モジュール内のドメインによっては高い特異性を示す場合がある[10]。誤ったアミノ酸がAドメインに活性化されPCPドメインへと結合した場合、タイプII TEドメインの触媒する加水分解によって、PCPドメインは何も結合していない状態へと戻される[11]。
ポリケチドとの関連
ポリケチド合成酵素（英：polyketide synthetases、PKS）とNRPSは似ているため、NRPとポリケチド（PK）とが融合した構造の二次代謝産物も多数存在する。これはNRPSモジュールとPKSモジュールとが連続できることを意味している。両酵素のPCPドメイン（PKSではACPドメイン）の構造が似ているために連続反応が可能なのであるが、縮合機構は全く異なる[6]。
例
関連項目
- ^ a b c d e f g h i j Dirk Schwarzer, Robert Finking, and Mohamed A. Marahiel (2003). “Nonribosomal peptides: from genes to products”. Nat. Prod. Rep. 20 (3): 275-287. doi:10.1039/b111145k.
- ^ Dai, Li-Xin (2012). Ding, Kuiling. ed. Organic chemistry : breakthroughs and perspectives. Weinheim, Germany: Wiley-VCH. ISBN 9783527333776.
- ^ Ségolène Caboche, Maude Pupin, Valérie Leclère, Arnaud Fontaine, Philippe Jacques, and Gregory Kucherov (2008). “NORINE: a database of nonribosomal peptides”. Nucleic Acids Res. 36: D326–D331. doi:10.1093/nar/gkm792.
- ^ “Harnessing the potential of communication-mediating domains for the biocombinatorial synthesis of nonribosomal peptides”. Proceedings of the National Academy of Sciences 103 (2): 275–280. (2006). doi:10.1073/pnas.0508409103.
- ^ Robert Finking and Mohamed A. Marahiel (2004). “Biosynthesis of Nonribosomal Peptides”. Annu. Rev. Microbiol. 58: 453–488. doi:10.1146/annurev.micro.58.030603.123615.
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- ^ Elizabeth A. Felnagle, John J. Barkei, Hyunjun Park, Angela M. Podevels, Matthew D. McMahon, Donald W. Drott, and Michael G. Thomas (2010). “MbtH-Like Proteins as Integral Components of Bacterial Nonribosomal Peptide Synthetases”. Biochemistry 49: 8815–8817. doi:10.1021/bi1012854.
- ^ Wenjun Zhang, John R. Heemstra Jr., Christopher T. Walsh, and Heidi J. Imker (2010). “Activation of the Pacidamycin PacL Adenylation Domain by MbtH-like Proteins”. Biochemistry 49: 9946–9947. doi:10.1021/bi101539b.
- ^ Luis E. N. Quadri, Paul H. Weinreb, Ming Lei, Michiko M. Nakano, Peter Zuber, and Christopher T. Walsh (1998). “Characterization of Sfp, a Bacillus subtilis phosphopantetheinyl transferase for peptidyl carrier protein domains in peptide synthetases”. Biochemsitry 37 (6): 1585-1595. doi:10.1021/bi9719861.
- ^ Sylvie Lautru and Gregory L. Challis (2004). “Substrate recognition by nonribosomal peptide synthetase multi-enzymes”. Microbiology 150: 1629–1636. doi:10.1099/mic.0.26837-0.
- ^ “Regeneration of misprimed nonribosomal peptide synthetases by type II thioesterases”. Proceedings of the National Academy of Sciences 99 (22): 14083–14088. (2002). doi:10.1099/mic.0.26837-0.
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