第X因子

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出典: フリー百科事典『ウィキペディア（Wikipedia）』 (2021/05/09 22:49 UTC 版)

生理学

第X因子は肝臓でビタミンK依存的に合成される。

第X因子は、いずれもセリンプロテアーゼである内因系テンナーゼ(intrinsic Xase)または外因系テンナーゼ(extrinsic Xase)によって活性化されて第Xa因子となる。内因系テンナーゼとは、第IX因子と、その補因子である第VIII因子などが複合体を形成したものである。一方、外因系テンナーゼとは第VII因子と、その補因子である組織因子が複合体を形成したものである。したがって、第X因子は外因系と内因系の共通経路の開始点である。

第X因子はプロトロンビンを2箇所で切断する。1箇所はArg-Thrの結合であり、もう1箇所はArg-Ileの結合である。これにより、プロトロンビンは活性型のトロンビンとなる。この過程は、第Xa因子が補因子である第Va因子と共にプロトロンビナーゼ複合体を形成することで速やかに進行する。

第Xa因子は、セリンプロテアーゼインヒビターであるプロテインZ依存性プロテアーゼインヒビター(英語)(ZPI)によって不活化される。ZPIの第Xa因子に対する親和性は、プロテインZ(英語)存在下で1000倍以上になるが、第XI因子の不活化についてはプロテインZに非依存的である。プロテインZ欠損症においては第Xa因子の活性が亢進し、血栓形成傾向になる。

第X因子の半減期は40時間から45時間ほどである。

第Xa因子の構造

ヒト第Xa因子の結晶構造が最初に報告されたのは1993年である。今日では、第Xa因子と様々な阻害因子の複合体について191通りの結晶構造がタンパク質データバンクに蓄積されている。

第Xa因子の活性部位は4つのサブポケットから成り、S1, S2, S3, S4と呼ばれている。S1サブポケットは基質の選択性や基質との結合を担う部位である。S2サブポケットは小さく浅い部分であり、形態はよくわかっていないが、S4と一体化するらしい。S3サブポケットはS1の辺縁にあり、溶媒に対して露出している。S4サブポケットには3つのリガンド結合部位があり、"hydrophobic box", "cationic hole" および the water site である。

多くの第Xa因子阻害因子はL字型の構造をしている。一方の部位がS1のAsp189, Ser195, Tyr228の陰性アミノ酸残基の部位を占め、他方がS4のTyr99, Phe174, Trp215の芳香族アミノ酸残基の部分を占める。そして典型的には、両者を強固なリンカーが橋渡ししている^[5]。

遺伝子

ヒト第X因子の遺伝子は、13番染色体（13q34）にコードされている。

PDBギャラリー

1c5m: STRUCTURAL BASIS FOR SELECTIVITY OF A SMALL MOLECULE, S1-BINDING, SUB-MICROMOLAR INHIBITOR OF UROKINASE TYPE PLASMINOGEN ACTIVATOR
1ezq: CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN COAGULATION FACTOR XA COMPLEXED WITH RPR128515
1f0r: CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN COAGULATION FACTOR XA COMPLEXED WITH RPR208815
1f0s: Crystal Structure of Human Coagulation Factor XA Complexed with RPR208707
1fax: COAGULATION FACTOR XA INHIBITOR COMPLEX
1fjs: CRYSTAL STRUCTURE OF THE INHIBITOR ZK-807834 (CI-1031) COMPLEXED WITH FACTOR XA
1g2l: FACTOR XA INHIBITOR COMPLEX
1g2m: FACTOR XA INHIBITOR COMPLEX
1hcg: STRUCTURE OF HUMAN DES(1-45) FACTOR XA AT 2.2 ANGSTROMS RESOLUTION
1ioe: Human coagulation factor Xa in complex with M55532
1iqe: Human coagulation factor Xa in complex with M55590
1iqf: Human coagulation factor Xa in complex with M55165
1iqg: Human coagulation factor Xa in complex with M55159
1iqh: Human coagulation factor Xa in complex with M55143
1iqi: Human coagulation factor Xa in complex with M55125
1iqj: Human coagulation factor Xa in complex with M55124
1iqk: Human coagulation factor Xa in complex with M55113
1iql: Human coagulation factor Xa in complex with M54476
1iqm: Human coagulation factor Xa in complex with M54471
1iqn: Human coagulation factor Xa in complex with M55192
1ksn: Crystal Structure of Human Coagulation Factor XA Complexed with FXV673
1kye: Factor Xa in complex with (R)-2-(3-adamantan-1-yl-ureido)-3-(3-carbamimidoyl-phenyl)-N-phenethyl-propionamide
1lpg: CRYSTAL STRUCTURE OF FXA IN COMPLEX WITH 79.
1lpk: CRYSTAL STRUCTURE OF FXA IN COMPLEX WITH 125.
1lpz: CRYSTAL STRUCTURE OF FXA IN COMPLEX WITH 41.
1lqd: CRYSTAL STRUCTURE OF FXA IN COMPLEX WITH 45.
1mq5: Crystal Structure of 3-chloro-N-[4-chloro-2-[[(4-chlorophenyl)amino]carbonyl]phenyl]-4-[(4-methyl-1-piperazinyl)methyl]-2-thiophenecarboxamide Complexed with Human Factor Xa
1mq6: Crystal Structure of 3-chloro-N-[4-chloro-2-[[(5-chloro-2-pyridinyl)amino]carbonyl]-6-methoxyphenyl]-4-[[(4,5-dihydro-2-oxazolyl)methylamino]methyl]-2-thiophenecarboxamide Complexed with Human Factor Xa
1nfu: CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN COAGULATION FACTOR XA COMPLEXED WITH RPR132747
1nfw: CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN COAGULATION FACTOR XA COMPLEXED WITH RPR209685
1nfx: CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN COAGULATION FACTOR XA COMPLEXED WITH RPR208944
1nfy: CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN COAGULATION FACTOR XA COMPLEXED WITH RPR200095
1p0s: Crystal Structure of Blood Coagulation Factor Xa in Complex with Ecotin M84R
1v3x: Factor Xa in complex with the inhibitor 1-[6-methyl-4,5,6,7-tetrahydrothiazolo(5,4-c)pyridin-2-yl] carbonyl-2-carbamoyl-4-(6-chloronaphth-2-ylsulphonyl)piperazine
1wu1: Factor Xa in complex with the inhibitor 4-[(5-chloroindol-2-yl)sulfonyl]-2-(2-methylpropyl)-1-[[5-(pyridin-4-yl) pyrimidin-2-yl]carbonyl]piperazine
1xka: FACTOR XA COMPLEXED WITH A SYNTHETIC INHIBITOR FX-2212A,(2S)-(3'-AMIDINO-3-BIPHENYLYL)-5-(4-PYRIDYLAMINO)PENTANOIC ACID
1xkb: FACTOR XA COMPLEXED WITH A SYNTHETIC INHIBITOR FX-2212A,(2S)-(3'-AMIDINO-3-BIPHENYLYL)-5-(4-PYRIDYLAMINO)PENTANOIC ACID
1z6e: Crystal Structure of Factor Xa complexed to Razaxaban
2bmg: CRYSTAL STRUCTURE OF FACTOR XA IN COMPLEX WITH 50
2boh: CRYSTAL STRUCTURE OF FACTOR XA IN COMPLEX WITH COMPOUND ""1""
2bok: FACTOR XA - CATION
2bq6: CRYSTAL STRUCTURE OF FACTOR XA IN COMPLEX WITH 21
2bq7: CRYSTAL STRUCTURE OF FACTOR XA IN COMPLEX WITH 43
2bqw: CRYSTAL STRUCTURE OF FACTOR XA IN COMPLEX WITH COMPOUND 45
2cji: CRYSTAL STRUCTURE OF A HUMAN FACTOR XA INHIBITOR COMPLEX
2d1j: Factor Xa in complex with the inhibitor 2-[[4-[(5-chloroindol-2-yl)sulfonyl]piperazin-1-yl] carbonyl]thieno[3,2-b]pyridine n-oxide
2fzz: Factor Xa in complex with the inhibitor 1-(3-amino-1,2-benzisoxazol-5-yl)-6-(2'-(((3r)-3-hydroxy-1-pyrrolidinyl)methyl)-4-biphenylyl)-3-(trifluoromethyl)-1,4,5,6-tetrahydro-7h-pyrazolo[3,4-c]pyridin-7-one
2g00: Factor Xa in complex with the inhibitor 3-(6-(2'-((dimethylamino)methyl)-4-biphenylyl)-7-oxo-3-(trifluoromethyl)-4,5,6,7-tetrahydro-1H-pyrazolo[3,4-c]pyridin-1-yl)benzamide
2gd4: Crystal Structure of the Antithrombin-S195A Factor Xa-Pentasaccharide Complex
2h9e: Crystal Structure of FXa/selectide/NAPC2 ternary complex
2j2u: CRYSTAL STRUCTURE OF A HUMAN FACTOR XA INHIBITOR COMPLEX
2j34: CRYSTAL STRUCTURE OF A HUMAN FACTOR XA INHIBITOR COMPLEX
2j38: CRYSTAL STRUCTURE OF A HUMAN FACTOR XA INHIBITOR COMPLEX
2j4i: CRYSTAL STRUCTURE OF A HUMAN FACTOR XA INHIBITOR COMPLEX
2j94: CRYSTAL STRUCTURE OF A HUMAN FACTOR XA INHIBITOR COMPLEX
2j95: CRYSTAL STRUCTURE OF A HUMAN FACTOR XA INHIBITOR COMPLEX
2uwl: SELECTIVE AND DUAL ACTION ORALLY ACTIVE INHIBITORS OF THROMBIN AND FACTOR XA
2uwo: SELECTIVE AND DUAL ACTION ORALLY ACTIVE INHIBITORS OF THROMBIN AND FACTOR XA
2uwp: FACTOR XA INHIBITOR COMPLEX

タンパク質: 凝固系

凝固因子

一次止血	vWF platelet membrane glycoproteins: Ib (A B IX) IIb/IIIa (IIb IIIa) VI
内因系	HMWK/ブラジキニンプレカリクレイン/カリクレイン第XII因子第XI因子第IX因子第VIII因子
外因系	組織因子第VII因子
共通経路	第X因子第V因子トロンビンフィブリン第XIII因子

凝固阻害因子

アンチトロンビン
プロテインC
プロテインS
プロテインZ
Protein Z-related protease inhibitor
Tissue factor pathway inhibitor

線溶系

参考文献

^ ^a ^b ^c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000126218 - Ensembl, May 2017
^ ^a ^b ^c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000031444 - Ensembl, May 2017
^ Human PubMed Reference:
^ Mouse PubMed Reference:
^ Presentation on Direct Factor Xa Inhibitors
^ Mark Brooker (2008): "Registry of Clotting Factor Concentrates". Eighth Edition, 2008, World Federation of Hemophilia
^ BPL Announces: Strong progress on the world's first licensed Factor X product
^ Hoffman M; Monroe MM (2007). “Coagulation 2006: A Modern View of Hemostasis”. Hematology and Oncology Clinics of North America 21 (1): 1–11. doi:10.1016/j.hoc.2006.11.004. PMID 17258114.
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