サイクリン依存性キナーゼ9とは？わかりやすく解説

CDK9
PDBに登録されている構造
PDB	オルソログ検索: RCSB PDBe PDBj
PDBのIDコード一覧
	3BLH, 3BLQ, 3BLR, 3LQ5, 3MI9, 3MIA, 3MY1, 3TN8, 3TNH, 3TNI, 4BCF, 4BCG, 4BCH, 4BCI, 4BCJ, 4EC8, 4EC9, 4IMY, 4OGR, 4OR5
識別子
記号	CDK9, C-2k, CDC2L4, CTK1, PITALRE, TAK, cyclin-dependent kinase 9, cyclin dependent kinase 9
外部ID	OMIM: 603251 MGI: 1328368 HomoloGene: 55566 GeneCards: CDK9
遺伝子の位置 (ヒト)
染色体	9番染色体 (ヒト)
終点	127,790,792 bp
遺伝子の位置 (マウス)
染色体	2番染色体 (マウス)
終点	32,603,088 bp
RNA発現パターン
	さらなる参照発現データ
遺伝子オントロジー
分子機能	• ヌクレオチド結合; • transferase activity; • protein kinase activity; • 7SK snRNA binding; • transcription coactivator binding; • snRNA binding; • ATP binding; • RNA polymerase II core promoter sequence-specific DNA binding; • DNA結合; • 転写因子結合; • 血漿タンパク結合; • protein serine/threonine kinase activity; • クロマチン結合; • キナーゼ活性; • cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity; • RNA polymerase II CTD heptapeptide repeat kinase activity; • プロテインキナーゼ結合; • cyclin binding; • RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding;
細胞の構成要素	• 細胞質; • 細胞核; • 膜; • 核質; • transcription elongation factor complex; • P-TEFb; • PML body; • 染色体; • cytoplasmic ribonucleoprotein granule; • cyclin-dependent protein kinase holoenzyme complex;
生物学的プロセス	• positive regulation of cardiac muscle hypertrophy; • positive regulation of mRNA 3'-UTR binding; • regulation of muscle cell differentiation; • negative regulation of mRNA polyadenylation; • DNA修復; • cellular response to cytokine stimulus; • positive regulation of viral transcription; • replication fork processing; • タンパク質リン酸化; • regulation of histone modification; • regulation of mitotic cell cycle; • cellular response to DNA damage stimulus; • transcription initiation from RNA polymerase II promoter; • regulation of DNA repair; • regulation of transcription, DNA-templated; • 細胞増殖; • transcription by RNA polymerase II; • リン酸化; • positive regulation of histone H2B ubiquitination; • positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • transcription, DNA-templated; • snRNA transcription by RNA polymerase II; • transcription elongation from RNA polymerase II promoter; • phosphorylation of RNA polymerase II C-terminal domain; • positive regulation of transcription elongation from RNA polymerase II promoter;
	出典:Amigo / QuickGO
オルソログ
	1025
	107951
	ENSG00000136807
	ENSMUSG00000009555
	P50750,A0A024R880
	Q99J95
	NM_001261
	NM_130860
	NP_001252; NP_001252.1
	NP_570930
	ウィキデータ
閲覧/編集ヒト	閲覧/編集マウス

サイクリン依存性キナーゼ9（サイクリンいぞんせいキナーゼ9、英: cyclin-dependent kinase 9、略称: CDK9）は、P-TEFbの構成要素となるサイクリン依存性キナーゼである。

機能

CDK9遺伝子にコードされるCDK9タンパク質は、サイクリン依存性キナーゼ（CDK）ファミリーの一員である。CDKファミリーのメンバーは、出芽酵母Saccharomyces cerevisiaeのcdc28や、分裂酵母Schizosaccharomyces pombeのcdc2遺伝子の産物と高度に類似しており、細胞周期の重要な調節因子であることが知られている。このキナーゼは、TAK/P-TEFb複合体の構成要素であることが知られている。この複合体はRNAポリメラーゼIIによる転写の伸長因子であり、RNAポリメラーゼIIの大サブユニットのC末端ドメインをリン酸化することで機能する。このタンパク質は調節サブユニットであるサイクリンT（英語版）またはサイクリンK（英語版）と複合体を形成し、その調節を受ける。HIV-1のTat（英語版）タンパク質がこのタンパク質ならびにサイクリンTと相互作用することが知られており、そのためCDK9はAIDSに関与している可能性が示唆されている^[5]。

CDK9はTRAF2（英語版）など他のタンパク質とも相互作用することが知られており、骨格筋の分化に関与している^[6]。

相互作用

CDK9は次に挙げる因子と相互作用することが示されている。

AR^[7]
CDC34（英語版）^[8]
CCNK（英語版）^[9]
CCNT1（英語版）^[9]^[10]^[11]^[12]^[13]^[14]^[8]^[15]^[16]
CCNT2（英語版）^[10]
MYBL2（英語版）^[15]
RELA（英語版）^[17]
RB1^[18]
SKP1A（英語版）^[8]
SUPT5H（英語版）^[16]
RNAポリメラーゼII^[19]

出典

^ ^a ^b ^c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000136807 - Ensembl, May 2017
^ ^a ^b ^c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000009555 - Ensembl, May 2017
^ Human PubMed Reference:
^ Mouse PubMed Reference:
^ “Entrez Gene: CDK9 cyclin-dependent kinase 9 (CDC2-related kinase)”. 2023年9月15日閲覧。
^ “Binding of CDK9 to TRAF2”. J. Cell. Biochem. 71 (4): 467–78. (1998). doi:10.1002/(SICI)1097-4644(19981215)71:4<467::AID-JCB2>3.0.CO;2-G. PMID 9827693.
^ “Androgen receptor interacts with the positive elongation factor P-TEFb and enhances the efficiency of transcriptional elongation”. J. Biol. Chem. 276 (13): 9978–84. (March 2001). doi:10.1074/jbc.M002285200. PMID 11266437.
^ ^a ^b ^c “Interaction between cyclin T1 and SCF(SKP2) targets CDK9 for ubiquitination and degradation by the proteasome”. Mol. Cell. Biol. 21 (23): 7956–70. (December 2001). doi:10.1128/MCB.21.23.7956-7970.2001. PMC 99964. PMID 11689688.
^ ^a ^b “Cyclin K functions as a CDK9 regulatory subunit and participates in RNA polymerase II transcription”. J. Biol. Chem. 274 (49): 34527–30. (December 1999). doi:10.1074/jbc.274.49.34527. PMID 10574912.
^ ^a ^b “Identification of multiple cyclin subunits of human P-TEFb”. Genes Dev. 12 (5): 755–62. (March 1998). doi:10.1101/gad.12.5.755. PMC 316581. PMID 9499409.
^ “BRCA1 cooperates with NUFIP and P-TEFb to activate transcription by RNA polymerase II”. Oncogene 23 (31): 5316–29. (July 2004). doi:10.1038/sj.onc.1207684. PMID 15107825.
^ “The human I-mfa domain-containing protein, HIC, interacts with cyclin T1 and modulates P-TEFb-dependent transcription”. Mol. Cell. Biol. 23 (18): 6373–84. (September 2003). doi:10.1128/MCB.23.18.6373-6384.2003. PMC 193714. PMID 12944466.
^ “MAQ1 and 7SK RNA interact with CDK9/cyclin T complexes in a transcription-dependent manner”. Mol. Cell. Biol. 23 (14): 4859–69. (July 2003). doi:10.1128/MCB.23.14.4859-4869.2003. PMC 162212. PMID 12832472.
^ “The growth factor granulin interacts with cyclin T1 and modulates P-TEFb-dependent transcription”. Mol. Cell. Biol. 23 (5): 1688–702. (March 2003). doi:10.1128/MCB.23.5.1688-1702.2003. PMC 151712. PMID 12588988.
^ ^a ^b “Physical interaction between CDK9 and B-Myb results in suppression of B-Myb gene autoregulation”. Oncogene 19 (3): 373–9. (January 2000). doi:10.1038/sj.onc.1203305. PMID 10656684.
^ ^a ^b “CDK9 autophosphorylation regulates high-affinity binding of the human immunodeficiency virus type 1 tat-P-TEFb complex to TAR RNA”. Mol. Cell. Biol. 20 (18): 6958–69. (September 2000). doi:10.1128/MCB.20.18.6958-6969.2000. PMC 88771. PMID 10958691.
^ “Interplay between cdk9 and NF-kappaB factors determines the level of HIV-1 gene transcription in astrocytic cells”. Oncogene 21 (37): 5797–803. (August 2002). doi:10.1038/sj.onc.1205754. PMID 12173051.
^ “Physical interaction between pRb and cdk9/cyclinT2 complex”. Oncogene 21 (26): 4158–65. (June 2002). doi:10.1038/sj.onc.1205511. PMID 12037672.
^ “Phosphorylation of the RNA Polymerase II Carboxyl-Terminal Domain by CDK9 Is Directly Responsible for Human Immunodeficiency Virus Type 1 Tat-Activated Transcriptional Elongation”. Mol Cell Biol 22 (13): 4622–4637. (July 2002). doi:10.1128/MCB.22.13.4622-4637.2002. PMC 133925. PMID 12052871.

外部リンク

Cyclin-Dependent Kinase 9 - MeSH・アメリカ国立医学図書館・生命科学用語シソーラス（英語）
Drosophila Cyclin dependent kinase 9 - The Interactive Fly

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000136807 - Ensembl, May 2017

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000009555 - Ensembl, May 2017

[3] Human PubMed Reference:

[4] Mouse PubMed Reference:

[:0-5] “Entrez Gene: CDK9 cyclin-dependent kinase 9 (CDC2-related kinase)”. 2023年9月15日閲覧。

[pmid9827693-6] “Binding of CDK9 to TRAF2”. J. Cell. Biochem. 71 (4): 467–78. (1998). doi:10.1002/(SICI)1097-4644(19981215)71:4<467::AID-JCB2>3.0.CO;2-G. PMID 9827693.

[pmid11266437-7] “Androgen receptor interacts with the positive elongation factor P-TEFb and enhances the efficiency of transcriptional elongation”. J. Biol. Chem. 276 (13): 9978–84. (March 2001). doi:10.1074/jbc.M002285200. PMID 11266437.

[pmid11689688-8] “Interaction between cyclin T1 and SCF(SKP2) targets CDK9 for ubiquitination and degradation by the proteasome”. Mol. Cell. Biol. 21 (23): 7956–70. (December 2001). doi:10.1128/MCB.21.23.7956-7970.2001. PMC 99964. PMID 11689688.

[pmid10574912-9] “Cyclin K functions as a CDK9 regulatory subunit and participates in RNA polymerase II transcription”. J. Biol. Chem. 274 (49): 34527–30. (December 1999). doi:10.1074/jbc.274.49.34527. PMID 10574912.

[pmid9499409-10] “Identification of multiple cyclin subunits of human P-TEFb”. Genes Dev. 12 (5): 755–62. (March 1998). doi:10.1101/gad.12.5.755. PMC 316581. PMID 9499409.

[pmid15107825-11] “BRCA1 cooperates with NUFIP and P-TEFb to activate transcription by RNA polymerase II”. Oncogene 23 (31): 5316–29. (July 2004). doi:10.1038/sj.onc.1207684. PMID 15107825.

[pmid12944466-12] “The human I-mfa domain-containing protein, HIC, interacts with cyclin T1 and modulates P-TEFb-dependent transcription”. Mol. Cell. Biol. 23 (18): 6373–84. (September 2003). doi:10.1128/MCB.23.18.6373-6384.2003. PMC 193714. PMID 12944466.

[pmid12832472-13] “MAQ1 and 7SK RNA interact with CDK9/cyclin T complexes in a transcription-dependent manner”. Mol. Cell. Biol. 23 (14): 4859–69. (July 2003). doi:10.1128/MCB.23.14.4859-4869.2003. PMC 162212. PMID 12832472.

[pmid12588988-14] “The growth factor granulin interacts with cyclin T1 and modulates P-TEFb-dependent transcription”. Mol. Cell. Biol. 23 (5): 1688–702. (March 2003). doi:10.1128/MCB.23.5.1688-1702.2003. PMC 151712. PMID 12588988.

[pmid10656684-15] “Physical interaction between CDK9 and B-Myb results in suppression of B-Myb gene autoregulation”. Oncogene 19 (3): 373–9. (January 2000). doi:10.1038/sj.onc.1203305. PMID 10656684.

[pmid10958691-16] “CDK9 autophosphorylation regulates high-affinity binding of the human immunodeficiency virus type 1 tat-P-TEFb complex to TAR RNA”. Mol. Cell. Biol. 20 (18): 6958–69. (September 2000). doi:10.1128/MCB.20.18.6958-6969.2000. PMC 88771. PMID 10958691.

[pmid12173051-17] “Interplay between cdk9 and NF-kappaB factors determines the level of HIV-1 gene transcription in astrocytic cells”. Oncogene 21 (37): 5797–803. (August 2002). doi:10.1038/sj.onc.1205754. PMID 12173051.

[pmid12037672-18] “Physical interaction between pRb and cdk9/cyclinT2 complex”. Oncogene 21 (26): 4158–65. (June 2002). doi:10.1038/sj.onc.1205511. PMID 12037672.

[19] “Phosphorylation of the RNA Polymerase II Carboxyl-Terminal Domain by CDK9 Is Directly Responsible for Human Immunodeficiency Virus Type 1 Tat-Activated Transcriptional Elongation”. Mol Cell Biol 22 (13): 4622–4637. (July 2002). doi:10.1128/MCB.22.13.4622-4637.2002. PMC 133925. PMID 12052871.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]

[16]

[17]

[18]

[19]

サイクリン依存性キナーゼ9とは？わかりやすく解説