ＥｃｏＲ１

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EcoRI

出典: フリー百科事典『ウィキペディア（Wikipedia）』 (2020/08/17 02:27 UTC 版)

EcoRIの構造

EcoRI（えこあーるわん）は、II型の制限酵素の一種で、制限酵素としては最も代表的なものである。

歴史

1972年、カリフォルニア大学のハーバート・ボイヤーの研究室で大腸菌から単離された。大腸菌（Escherichia coli）のRY13株から見つかった1番目の制限酵素ということで、「EcoRI」と命名された。

1986年、制限酵素として初めて結晶構造が報告された。

作用

EcoRIはIIP型に分類される制限酵素であり、DNA中の　5'-GAATTC-3'　というパリンドロームになっている6塩基配列を認識し、GとAの間に切れ目を入れ、切り口に付着末端を作り出す。この時、酵素との結合部でDNAを直角に屈曲させることが分かっている。なお、大腸菌自身の遺伝子は、この配列の部分がメチル化されているため、切断される心配はない。

EcoRIの切断パターン

 切断前の配列   　　　切断後の配列
 5'-GAATTC-3'    5'-G　AATTC-3'
 3'-CTTAAG-5'    3'-CTTAA　G-5'

構造

一次構造

他の多くの制限酵素と同様に活性部位にPD...D/ExKモチーフを持つ。

三次・四次構造

約31kDaのサブユニットがホモ2量体を形成し、α/β構造である球状ドメインでDNAと結合する。

球状ドメインから飛び出しているループ領域はDNAを包むように結合し、認識配列の外のDNA骨格と結合する。この結合が、認識配列近傍のDNA配列がEcoRIの活性に影響を与えている原因であると考えられている。

それぞれのサブユニットの2つのαヘリックスは4ヘリックスバンドルを構成し、DNAの主溝に入り込み結合する。βストランドにはヌクレアーゼ活性に必要なアミノ酸残基が含まれている。

関連項目

• 制限酵素
• ヌクレアーゼ
• EcoRV

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「Eco R1」の例文・使い方・用例・文例

• 大阪大学の石(いし)黒(ぐろ)浩(ひろし)教授と彼の共同研究チームが先日，新型ロボット｢テレノイドR1｣を発表した。
• テレノイドR1は人間のような顔を持ち，体はシリコン製で柔らかい。
• 石黒教授は「遠くにいる孫と話している間，お年寄りはテレノイドR1を抱きしめることができる。テレビ電話をかけるときよりも話している相手をずっと身近に感じるはず。」と語った。
• テレノイドR1は研究，教育，介護目的で10月に発売される。