ハプログループA (Y染色体)

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ハプログループA (Y染色体)

出典: フリー百科事典『ウィキペディア（Wikipedia）』 (2024/03/26 08:27 UTC 版)

ハプログループAの分布図

ハプログループA (Y染色体)（ハプログループA Yせんしょくたい、英: Haplogroup A (Y-DNA)）とは分子人類学において人類の父系を示すY染色体ハプログループ（型集団）の分類である。他のY染色体ハプログループと異なり、特定の変異で定義されるものではなく、ハプログループの系統樹の最も根に近いグループを側系統としてまとめたものである。27万年前^[1][2]にアフリカで誕生した。

頻度

コイサン語族話者や東アフリカのナイロートなどに高頻度である。

• Tsumkwe San　66%^[3]
• ナマ人　64%^[3]
• ディンカ族　62%^[4]
• シルック族　53%^[4]
• ヌバ族　46%^[4]
• コイサン人　44%^[5]
• エチオピアユダヤ人　41%^[6][7]
• ǃKung ~40% ^[3][6]　
• Borgu　35%^[8]
• ヌエル族　33%^[8]
• フール人　31%^[8]
• マサイ族　27%^[8]
• ナラ人　20%^[9]

など

系統樹

Y-Chromosome Consortium (YCC) Tree,^[10] the ISOGG Y-DNA Haplogroup Tree,^[11]などによる。

Y染色体アダム

• A0 (formerly A1b) (P305, V148, V149, V154, V164, V166, V172, V173, V177, V190, V196, V223, V225, V229, V233, V239)
• A1 (A1a-T according to Cruciani 2011) (L985, L989, L990, L1002, L1003, L1004, L1009, L1013, L1053, V161, V168, V171, V174, V203, V238, V241, V250, V238, V241, V250)
  • A1a (M31, P82, V4, V14, V15, V25, V26, V28, V30, V40, V48, V53, V57, V58, V63, V76, V191, V201, V204, V214, V215, V236)
  • A1b (A2-T according to Cruciani 2011) (P108, V221)
    • A1b1 (L419)
      • A1b1a (V50, V82, V198, V224)
        • A1b1a1 formerly A2 (M14, M23, L968/M29/P3/PN3, M71, M135, M141, M206, M276/P247, M277/P248, MEH1, P4, P5, P36.1, Page71, Page87, Page95)
          • A1b1a1a (M6, M196)　カポイド（コイサン諸語）
            • A1b1a1a1 (M212)
              • A1b1a1a1a formerly A2a (M114)
              • A1b1a1a1b formerly A2b (P28)
              • A1b1a1a1c formerly A2c (P262)
      • A1b1b formerly A3 (M32)
        • A1b1b1 formerly A3a (M28, M59)
        • A1b1b2 formerly A3b (M144, M190, M220, P289)
          • A1b1b2a formerly A3b1 (M51, P100, P291)　カポイド（コイサン諸語）
            • A1b1b2a1 formerly A3b1a (P71, P102)
          • A1b1b2b formerly A3b2 (M13, M127, M202, M219, M305) 　ナイロート（ナイル・サハラ語族）
            • A1b1b2b1 (M118)
    • BT (M42, M94, M139, M299, M60, M181/Page32, P85, P90, P97, Page65.1/SRY1532.1/SRY10831.1, V21, V29, V31, V59, V64, V102, V187, V202, V216, V235)

A00

ハプログループAの移動

2013年、Family Tree DNA社が米国サウスカロライナ州出身のアフリカ系アメリカ人の子孫のY染色体を解析したところ、33万8千年前に遡る系統^[12]であることが明らかとなり、新たにハプログループA00と名付けられた^[13][14]。この発見によりアフリカ人のY染色体系統が再調査された結果、カメルーンの村でも類似のY染色体のハプロタイプが発見された^[15]。これらの結果により、Y染色体アダムの年代が大きく遡ることとなった^[16][17]。後の研究で、この分岐年代を若干補正する研究もされており、これによるとA00は20万8300年前(もっとも古い見積もりでも26万200年前)に分岐した系統であるとされる^[18]。この新たな数値は、従来Y染色体アダムが存在したと考えられてきた時期と矛盾しないことになる。その後2015年の研究ではA00は27万年前まで遡るとされている^[1][2]。

起源地

Scozzari et al. (2012) はハプログループA1bの起源地をアフリカ中部～北西部と推定している^[19]。実際にモロッコの地層から発見された現生人類（ホモ・サピエンス）の頭蓋骨及びその同年代のもの思われる複数の石器が、現生人類の痕跡としては最古の約30万年前のものであると結論づけられており、ホモ・サピエンスの原郷が中～北西アフリカにあった可能性を示唆している。

旧石器時代のヨーロッパへ

ハプログループA1aはヨーロッパ北西部でわずかに観察されている。これは旧石器時代にアフリカからジブラルタル海峡を渡ってやってきたものと解釈されている^[20]。

ヒトのY染色体ハプログループの系統樹
	Y染色体アダム (Y-MRCA)
		A0	A1
			A1a		A1b
					A1b1	BT
						B			CT
											DE		CF
										D	E		C		F
																G	H		IJK
																				IJ					K
																			I		J												K1		K2
																																L	T		MS	NO	P	K2*
																																					N	O		Q	R
Y染色体の民族別構成（英語） 民族別構成 (東アジア) 日本人のY-DNA 言語分布との関係

脚注

[脚注の使い方]

1. ^ ^{a b} Karmin, M.; Saag; Vicente; Wilson Sayres (2015). “A recent bottleneck of Y chromosome diversity coincides with a global change in culture”. Genome Research 25 (4): 459–66. doi:10.1101/gr.186684.114. PMC 4381518. PMID 25770088. http://genome.cshlp.org/content/25/4/459.long. 
2. ^ ^{a b} Trombetta, B.; D'Atanasio; Massaia; Myres; Scozzari; Cruciani; Novelletto (2015). “Regional Differences in the Accumulation of SNPs on the Male-Specific Portion of the Human Y Chromosome Replicate Autosomal Patterns: Implications for Genetic Dating”. PLOS ONE 10 (7): e0134646. doi:10.1371/journal.pone.0134646. PMC 4520482. PMID 26226630. http://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0134646. 
3. ^ ^{a b c} Wood ET, Stover DA, Ehret C et al. (July 2005). "Contrasting patterns of Y chromosome and mtDNA variation in Africa: evidence for sex-biased demographic processes". Eur. J. Hum. Genet. 13 (7): 867–76. doi:10.1038/sj.ejhg.5201408. PMID 15856073.
4. ^ ^{a b c} 28/53 (Dinka, Nuer, and Shilluk), Hassan HY, Underhill PA, Cavalli-Sforza LL, Ibrahim ME (November 2008). "Y-chromosome variation among Sudanese: restricted gene flow, concordance with language, geography, and history" (PDF). Am. J. Phys. Anthropol. 137 (3): 316–23. doi:10.1002/ajpa.20876. PMID 18618658.
5. ^ Underhill PA, Shen P, Lin AA et al. (November 2000). "Y chromosome sequence variation and the history of human populations". Nat. Genet. 26 (3): 358–61. doi:10.1038/81685. PMID 11062480.
6. ^ ^{a b} Cruciani F, Santolamazza P, Shen P et al. (May 2002). "A back migration from Asia to sub-Saharan Africa is supported by high-resolution analysis of human Y-chromosome haplotypes". Am. J. Hum. Genet. 70 (5): 1197–214. doi:10.1086/340257. PMC 447595. PMID 11910562.
7. ^ Shen P, Lavi T, Kivisild T et al. (September 2004). "Reconstruction of patrilineages and matrilineages of Samaritans and other Israeli populations from Y-chromosome and mitochondrial DNA sequence variation". Hum. Mutat. 24 (3): 248–60. doi:10.1002/humu.20077. PMID 15300852.
8. ^ ^{a b c d} 28/53 (Dinka, Nuer, and Shilluk), Hassan HY, Underhill PA, Cavalli-Sforza LL, Ibrahim ME (November 2008). "Y-chromosome variation among Sudanese: restricted gene flow, concordance with language, geography, and history" (PDF). Am. J. Phys. Anthropol. 137 (3): 316–23. doi:10.1002/ajpa.20876. PMID 18618658.
9. ^ Cruciani F, Trombetta B, Sellitto D et al. (July 2010). "Human Y chromosome haplogroup R-V88: a paternal genetic record of early mid Holocene trans-Saharan connections and the spread of Chadic languages". Eur. J. Hum. Genet. 18 (7): 800–7. doi:10.1038/ejhg.2009.231. PMC 2987365. PMID 20051990.
10. ^ Krahn, Thomas. “YCC Tree”. Houston, Texas: FTDNA. 2014年4月13日時点のオリジナルよりアーカイブ。2011年5月16日閲覧。
11. ^ International Society of Genetic Genealogy. “Y-DNA Haplogroup Tree”. 2018年5月13日閲覧。
12. ^ “The New Root – Haplogroup A00”. Roberta Estes (2012年11月16日). 2015年5月閲覧。
13. ^ “The Root of the Tree of our Fathers”. Y-HAPLOGROUP A (2013年3月8日). 2015年5月閲覧。
14. ^ “Y-Haplogroup A Project”. Family Tree DNA (2013年3月1日). 2015年5月閲覧。
15. ^ “Cameroonian Y-DNA lineage A00 is older than Homo sapiens(カメルーンのY-DNA系統A00は、ホモサピエンスよりも古い)”. Prehistory, Anthropology and Genetics (2013年3月2日). 2015年5月閲覧。
16. ^ “Y-ADAM” (2013年3月14日). 2015年5月閲覧。
17. ^ “Descendant of Adam Found in South Carolina: Why This Could Re-Write History”. PolicyMic (2013年3月25日). 2015年5月閲覧。
18. ^ “The 'extremely ancient’chromosome that isn’t: a forensic bioinformatic investigation of Albert Perry’s X-degenerate portion of the Y chromosome”. Eran Elhaik, Tatiana V Tatarinova, Anatole A Klyosov, Dan Graur (2014年1月22日). 2015年6月閲覧。但し発見当初の推定でも、新しいほうの見積もりは23万7000年前であり、新たな報告と重なる部分もあった
19. ^ “Molecular dissection of the basal clades in the human Y chromosome phylogenetic tree”. PLOS ONE 7 (11): e49170. (2012). doi:10.1371/journal.pone.0049170. PMC 3492319. PMID 23145109. http://dx.plos.org/10.1371/journal.pone.0049170. 
20. ^ Eupedia