サイクリン依存性キナーゼ9とは? わかりやすく解説

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サイクリン依存性キナーゼ9

(Cdk9 から転送)

出典: フリー百科事典『ウィキペディア(Wikipedia)』 (2023/09/15 09:37 UTC 版)

CDK9
PDBに登録されている構造
PDB オルソログ検索: RCSB PDBe PDBj
PDBのIDコード一覧

3BLH, 3BLQ, 3BLR, 3LQ5, 3MI9, 3MIA, 3MY1, 3TN8, 3TNH, 3TNI, 4BCF, 4BCG, 4BCH, 4BCI, 4BCJ, 4EC8, 4EC9, 4IMY, 4OGR, 4OR5

識別子
記号 CDK9, C-2k, CDC2L4, CTK1, PITALRE, TAK, cyclin-dependent kinase 9, cyclin dependent kinase 9
外部ID OMIM: 603251 MGI: 1328368 HomoloGene: 55566 GeneCards: CDK9
遺伝子の位置 (ヒト)
染色体 9番染色体 (ヒト)[1]
バンド データ無し 開始点 127,785,679 bp[1]
終点 127,790,792 bp[1]
遺伝子の位置 (マウス)
染色体 2番染色体 (マウス)[2]
バンド データ無し 開始点 32,595,796 bp[2]
終点 32,603,088 bp[2]
RNA発現パターン
さらなる参照発現データ
遺伝子オントロジー
分子機能 ヌクレオチド結合
transferase activity
protein kinase activity
7SK snRNA binding
transcription coactivator binding
snRNA binding
ATP binding
RNA polymerase II core promoter sequence-specific DNA binding
DNA結合
転写因子結合
血漿タンパク結合
protein serine/threonine kinase activity
クロマチン結合
キナーゼ活性
cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity
RNA polymerase II CTD heptapeptide repeat kinase activity
プロテインキナーゼ結合
cyclin binding
RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
細胞の構成要素 細胞質
細胞核

核質
transcription elongation factor complex
P-TEFb
PML body
染色体
cytoplasmic ribonucleoprotein granule
cyclin-dependent protein kinase holoenzyme complex
生物学的プロセス positive regulation of cardiac muscle hypertrophy
positive regulation of mRNA 3'-UTR binding
regulation of muscle cell differentiation
negative regulation of mRNA polyadenylation
DNA修復
cellular response to cytokine stimulus
positive regulation of viral transcription
replication fork processing
タンパク質リン酸化
regulation of histone modification
regulation of mitotic cell cycle
cellular response to DNA damage stimulus
transcription initiation from RNA polymerase II promoter
regulation of DNA repair
regulation of transcription, DNA-templated
細胞増殖
transcription by RNA polymerase II
リン酸化
positive regulation of histone H2B ubiquitination
positive regulation of transcription by RNA polymerase II
transcription, DNA-templated
snRNA transcription by RNA polymerase II
transcription elongation from RNA polymerase II promoter
phosphorylation of RNA polymerase II C-terminal domain
positive regulation of transcription elongation from RNA polymerase II promoter
出典:Amigo / QuickGO
オルソログ
ヒト マウス
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq
(mRNA)

NM_001261

NM_130860

RefSeq
(タンパク質)

NP_001252
NP_001252.1

NP_570930

場所
(UCSC)
Chr 9: 127.79 – 127.79 Mb Chr 9: 32.6 – 32.6 Mb
PubMed検索 [3] [4]
ウィキデータ
閲覧/編集 ヒト 閲覧/編集 マウス

サイクリン依存性キナーゼ9(サイクリンいぞんせいキナーゼ9、: cyclin-dependent kinase 9、略称: CDK9)は、P-TEFbの構成要素となるサイクリン依存性キナーゼである。

機能

CDK9遺伝子にコードされるCDK9タンパク質は、サイクリン依存性キナーゼ(CDK)ファミリーの一員である。CDKファミリーのメンバーは、出芽酵母Saccharomyces cerevisiaecdc28や、分裂酵母Schizosaccharomyces pombecdc2遺伝子の産物と高度に類似しており、細胞周期の重要な調節因子であることが知られている。このキナーゼは、TAK/P-TEFb複合体の構成要素であることが知られている。この複合体はRNAポリメラーゼIIによる転写の伸長因子であり、RNAポリメラーゼIIの大サブユニットのC末端ドメインをリン酸化することで機能する。このタンパク質は調節サブユニットであるサイクリンT英語版またはサイクリンK英語版と複合体を形成し、その調節を受ける。HIV-1Tat英語版タンパク質がこのタンパク質ならびにサイクリンTと相互作用することが知られており、そのためCDK9はAIDSに関与している可能性が示唆されている[5]

CDK9はTRAF2英語版など他のタンパク質とも相互作用することが知られており、骨格筋の分化に関与している[6]

相互作用

CDK9は次に挙げる因子と相互作用することが示されている。

出典

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000136807 - Ensembl, May 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000009555 - Ensembl, May 2017
  3. ^ Human PubMed Reference:
  4. ^ Mouse PubMed Reference:
  5. ^ Entrez Gene: CDK9 cyclin-dependent kinase 9 (CDC2-related kinase)”. 2023年9月15日閲覧。
  6. ^ “Binding of CDK9 to TRAF2”. J. Cell. Biochem. 71 (4): 467–78. (1998). doi:10.1002/(SICI)1097-4644(19981215)71:4<467::AID-JCB2>3.0.CO;2-G. PMID 9827693. 
  7. ^ “Androgen receptor interacts with the positive elongation factor P-TEFb and enhances the efficiency of transcriptional elongation”. J. Biol. Chem. 276 (13): 9978–84. (March 2001). doi:10.1074/jbc.M002285200. PMID 11266437. 
  8. ^ a b c “Interaction between cyclin T1 and SCF(SKP2) targets CDK9 for ubiquitination and degradation by the proteasome”. Mol. Cell. Biol. 21 (23): 7956–70. (December 2001). doi:10.1128/MCB.21.23.7956-7970.2001. PMC 99964. PMID 11689688. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC99964/. 
  9. ^ a b “Cyclin K functions as a CDK9 regulatory subunit and participates in RNA polymerase II transcription”. J. Biol. Chem. 274 (49): 34527–30. (December 1999). doi:10.1074/jbc.274.49.34527. PMID 10574912. 
  10. ^ a b “Identification of multiple cyclin subunits of human P-TEFb”. Genes Dev. 12 (5): 755–62. (March 1998). doi:10.1101/gad.12.5.755. PMC 316581. PMID 9499409. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC316581/. 
  11. ^ “BRCA1 cooperates with NUFIP and P-TEFb to activate transcription by RNA polymerase II”. Oncogene 23 (31): 5316–29. (July 2004). doi:10.1038/sj.onc.1207684. PMID 15107825. 
  12. ^ “The human I-mfa domain-containing protein, HIC, interacts with cyclin T1 and modulates P-TEFb-dependent transcription”. Mol. Cell. Biol. 23 (18): 6373–84. (September 2003). doi:10.1128/MCB.23.18.6373-6384.2003. PMC 193714. PMID 12944466. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC193714/. 
  13. ^ “MAQ1 and 7SK RNA interact with CDK9/cyclin T complexes in a transcription-dependent manner”. Mol. Cell. Biol. 23 (14): 4859–69. (July 2003). doi:10.1128/MCB.23.14.4859-4869.2003. PMC 162212. PMID 12832472. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC162212/. 
  14. ^ “The growth factor granulin interacts with cyclin T1 and modulates P-TEFb-dependent transcription”. Mol. Cell. Biol. 23 (5): 1688–702. (March 2003). doi:10.1128/MCB.23.5.1688-1702.2003. PMC 151712. PMID 12588988. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC151712/. 
  15. ^ a b “Physical interaction between CDK9 and B-Myb results in suppression of B-Myb gene autoregulation”. Oncogene 19 (3): 373–9. (January 2000). doi:10.1038/sj.onc.1203305. PMID 10656684. 
  16. ^ a b “CDK9 autophosphorylation regulates high-affinity binding of the human immunodeficiency virus type 1 tat-P-TEFb complex to TAR RNA”. Mol. Cell. Biol. 20 (18): 6958–69. (September 2000). doi:10.1128/MCB.20.18.6958-6969.2000. PMC 88771. PMID 10958691. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC88771/. 
  17. ^ “Interplay between cdk9 and NF-kappaB factors determines the level of HIV-1 gene transcription in astrocytic cells”. Oncogene 21 (37): 5797–803. (August 2002). doi:10.1038/sj.onc.1205754. PMID 12173051. 
  18. ^ “Physical interaction between pRb and cdk9/cyclinT2 complex”. Oncogene 21 (26): 4158–65. (June 2002). doi:10.1038/sj.onc.1205511. PMID 12037672. 
  19. ^ “Phosphorylation of the RNA Polymerase II Carboxyl-Terminal Domain by CDK9 Is Directly Responsible for Human Immunodeficiency Virus Type 1 Tat-Activated Transcriptional Elongation”. Mol Cell Biol 22 (13): 4622–4637. (July 2002). doi:10.1128/MCB.22.13.4622-4637.2002. PMC 133925. PMID 12052871. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC133925/. 

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