構造トポロジーとは? わかりやすく解説

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構造トポロジー

出典: フリー百科事典『ウィキペディア(Wikipedia)』 (2021/04/21 18:16 UTC 版)

βシート」の記事における「構造トポロジー」の解説

βシートトポロジーは、骨格沿って水素結合しているβストランド順序を表す。たとえば、フラボドキシンフォールドは、5本ストランドからなるトポロジー21345の平行βシート持っている。したがって端部ストランドは、骨格沿ってβストランド2とβストランド5になる。明示的に綴ると、βストランド2はβストランド1とH結合しβストランド3とH結合しβストランド4とH結合しβストランド5とH結合しその他の端部ストランド結合する同系統で、上述グリークキー・モチーフは、4123のトポロジー持っているβシート二次構造は、ストランドの数、それらのトポロジー、およびそれらの水素結合が平行か逆平行かで大まかに説明できるβシートには、開いている(2本の端部ストランドを持つ)ものと(例:フラボドキシンフォールド免疫グロブリンフォールド)、閉じているβバレルがある(例:TIMバレルなど)。βバレルは、しばしばそれらのずれや傾斜用いて表現される開いたβシート中には、非常に湾曲していて折り重なるものや(例:SH3ドメイン英語版))、馬蹄型をしているものもある(例:リボヌクレアーゼ阻害剤)。開いたβシートは、面と面を合わせても(例:βプロペラドメイン免疫グロブリンフォールド)、端と端を合わせても、一つ大きなβシート形成することができる。

※この「構造トポロジー」の解説は、「βシート」の解説の一部です。
「構造トポロジー」を含む「βシート」の記事については、「βシート」の概要を参照ください。

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