選択的スプライシング
選択的スプライシング
出典: フリー百科事典『ウィキペディア（Wikipedia）』 (2023/04/30 14:06 UTC 版)
選択的スプライシング（せんたくてき－、Alternative Splicing）とは、DNAからの転写過程において特定のエクソンをとばしてスプライシングを行うことである。択一的スプライシングとも呼ばれる。
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[続きの解説]
「選択的スプライシング」の続きの解説一覧
- 1 選択的スプライシングとは
- 2 選択的スプライシングの概要
- 3 発見
- 4 形式
- 5 機構
- 6 適応的意義
- 7 疾患
- 8 ゲノムワイド解析
- 9 データベース
選択的スプライシング
出典: フリー百科事典『ウィキペディア（Wikipedia）』 (2020/12/27 02:09 UTC 版)
「RNA結合タンパク質」の記事における「選択的スプライシング」の解説
選択的スプライシングは、同一の遺伝子から異なる成熟mRNAが作り出される機構である。選択的スプライシングはどのエクソンがmRNAへ組み込まれるかを調節する機構であり、これによって1つの遺伝子から複数の関連タンパク質が産生されることとなり、ゲノムから可能なアウトプットが拡張される。RNA結合タンパク質はこの過程の調節に広く関与する。RNA結合タンパク質の一部は特定のセットのhnRNAの選択的スプライシングを制御し、その1つである神経細胞特異的RNA結合タンパク質NOVA1（英語版）はRNAの特定の配列（YCAY、YはUまたはC）を認識して結合することで制御を行う。これらのタンパク質はその後、スプライソソームタンパク質を標的部位へリクルートする。SRタンパク質は選択的スプライシングにおける役割がよく知られており、スプライソソームを形成するsnRNP、すなわちU1 snRNPとU2AF snRNPをリクルートする。スプライソソーム自身もRNA結合タンパク質を含んでいる。スプライソソームはsnRNAとタンパク質サブユニットからなる複合体であり、イントロンを除去して隣接するエクソンのライゲーションを行う。コアとなるスプライソソーム複合体に加えて、RNA結合タンパク質はエクソンの組み込みや除去に影響を与えるシス作用RNAエレメント部位にも結合する。これらの部位は、その存在位置や結合するタンパク質がスプライシングのサイレンサー（抑制因子）として機能するかエンハンサー（活性化因子）として機能するかに応じて、エクソン性スプライシングエンハンサー（ESE）、エクソン性スプライシングサイレンサー（ESS）、イントロン性スプライシングエンハンサー（ISE）、イントロン性スプライシングサイレンサー（ISS）と呼ばれる。
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選択的スプライシング
出典: フリー百科事典『ウィキペディア（Wikipedia）』 (2021/10/03 17:04 UTC 版)
「フィブロネクチン」の記事における「選択的スプライシング」の解説
フィブロネクチンの3か所で選択的スプライシングが起こることにより、数十種類の異なるフィブロネクチン・タンパク質アイソフォーム（一部だけが異なるタンパク質）が作られる。上記で、III型モジュールの個数を15〜17個と書いたのは、個数が曖昧だからではない。選択的スプライシングによって、III型モジュールが15個、16個、17個のフィブロネクチンが存在するからである。 III型モジュールの7番目と8番目の間のEIIIB（ヒトではEDB）、11番目と12番目の間のEIIIA（ヒトではEDA）、14番目と15番目の間のV領域（可変領域）のIIICS（スリーシーエスと読む）の3か所で、以下の選択的スプライシングが起こる。なお、「E」は「エクストラ（extra）」の「E」であり、「D」は「ドメイン（domain）」の「D」、「CS」は「コネクティング・セグメント（connecting segment）」の「CS」である。 EIIIB（EDB）は、全部翻訳されるか、全部翻訳されないかの2択。 EIIIA（EDA）も、全部翻訳されるか、全部翻訳されないかの2択。 IIICSは、3種類の部分的な翻訳と、全部翻訳されるか、全部翻訳されないかの、計5択。 細胞性フィブロネクチンにはEIIIBとEIIIAのどちらかまたは両方が存在する。血漿フィブロネクチンにはEIIIBとEIIIAのどちらも存在しない。V領域（可変領域、IIICS）ははα4β1インテグリンとの結合領域を含んでおり、ほとんどの細胞性フィブロネクチンに存在するが、血漿フィブロネクチンでは一方のサブユニット（A鎖）にしか存在しない。 構造的な変化として、フィブロネクチン単量体の長さに変異が生じるが、より重要なのは、このことによる機能の変化である。生体は選択的スプライシングを巧みに駆使することで、フィブロネクチン遺伝子は1つなのに、多様なタンパク質を作り、時間的・空間的に必要な機能調節を果たしていると推定される。
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選択的スプライシング
出典: フリー百科事典『ウィキペディア（Wikipedia）』 (2021/02/20 00:37 UTC 版)
「Pre-mRNA スプライシング」の記事における「選択的スプライシング」の解説
ある1つのmRNA前駆体からいくつか異なった組み合わせのエクソンを持つmRNAが作られることがある。このようなmRNAを生み出す機構は選択的スプライシング alternative splicing と呼ばれ、ヒトの遺伝子の半数程度に見られるという見積もりもある。これに対し、ただ1通りのエクソンの組み合わせのみのmRNAが作られる反応は構成的スプライシングと呼ばれる。選択的スプライシングによって、一つの遺伝子から複数種類のタンパク質（スプライスバリアント；splice variant）が作られる。また、発生段階や組織など環境に応じて、時間的・空間的に選択的スプライシングを制御することによってスプライスバリアントを作り分けている例も知られている。 例 mRNA前駆体 AAAAiiiiiiiiiiBBBBiiiiiiiiiiiiCCCCiiiiiiiiiiDDDD ↓ ↓ エクソンCを含まない エクソンCを含む ↓ ↓ mRNA AAAABBBBDDDD AAAABBBBCCCCDDDD ↓ ↓ タンパク質 XXXX ZZZZZ 活性型タンパク質 非活性型タンパク質 図9．選択的スプライシングの簡略図
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選択的スプライシング
出典: フリー百科事典『ウィキペディア（Wikipedia）』 (2021/02/20 00:56 UTC 版)
「スプライセオソーム」の記事における「選択的スプライシング」の解説
選択的スプライシングは真核生物にとって遺伝的多様性を高めるための重要な手段である。このようにしてできたスプライシングバリアントは、ヒトゲノムの中の遺伝子がタンパク質数と比べて少ないことを説明できる。長年の間ヒトには10万個ほどの遺伝子があると見積もられてきたが、ヒトゲノム計画によって実際には2万個程度の遺伝子しかないことが明らかとなっている。1つの遺伝子が3万8000通りもの異なるmRNAにスプライシングされることがあると言われている。
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