ベクター選択の例
出典: フリー百科事典『ウィキペディア(Wikipedia)』 (2021/08/20 16:22 UTC 版)
「ゲノムライブラリー」の記事における「ベクター選択の例」の解説
上記の式を用いて、2万塩基対のインサートサイズを有するベクター(例:ファージラムダベクター)を用いて、ゲノム中の全ての配列が表現される99%信頼水準を決定することができる。この例では、生物のゲノムサイズは30億塩基対である。 N = l n ( 1 − 0.99 ) l n [ 1 − 2.0 × 10 4 b a s e p a i r s 3.0 × 10 9 b a s e p a i r s ] {\displaystyle N={\frac {ln(1-0.99)}{ln[1-{\frac {2.0\times 10^{4}basepairs}{3.0\times 10^{9}basepairs}}]}}} N = − 4.61 − 6.7 × 10 − 6 {\displaystyle N={\frac {-4.61}{-6.7\times 10^{-6}}}} N = 688 , 060 {\displaystyle N=688,060} clones したがって、この30億塩基対のゲノムからの所定のDNA配列が、2万塩基対のインサートサイズのベクターを用いて、99%の確率でライブラリーに存在することを保証するためには、約688,060個のクローンが必要である。
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