ドッキングの機構
出典: フリー百科事典『ウィキペディア(Wikipedia)』 (2021/06/14 09:30 UTC 版)
「ドッキング (分子)」の記事における「ドッキングの機構」の解説
ドッキング・スクリーン (docking screen) を実行するために、最初の要件は、関心のあるタンパク質の構造である。通常、構造は、X線結晶構造解析、NMR分光法、低温電子顕微鏡法(クライオEM)などの生物物理学的手法を用いて決定されているが、ホモロジーモデル(英語版)構築からも導き出すことができる。このタンパク質構造と潜在的なリガンドのデータベースは、ドッキングプログラムの入力として機能する。ドッキングプログラムが成功するかどうかは、検索アルゴリズムとスコアリング関数の2つの要素に依存する。
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