RAD50とは? わかりやすく解説

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RAD50

出典: フリー百科事典『ウィキペディア(Wikipedia)』 (2022/08/19 04:22 UTC 版)

RAD50
識別子
記号 RAD50, NBSLD, RAD502, hRad50, Rad50, RAD50 double strand break repair protein
外部ID OMIM: 604040、613078 MGI: 109292 HomoloGene: 38092 GeneCards: RAD50
遺伝子の位置 (ヒト)
染色体 5番染色体 (ヒト)[1]
バンド データ無し 開始点 132,556,019 bp[1]
終点 132,646,349 bp[1]
遺伝子の位置 (マウス)
染色体 11番染色体 (マウス)[2]
バンド データ無し 開始点 53,540,346 bp[2]
終点 53,598,146 bp[2]
RNA発現パターン


さらなる参照発現データ
遺伝子オントロジー
分子機能 • DNA結合
• protein-macromolecule adaptor activity
• ヌクレオチド結合
• DNA helicase activity
• 金属イオン結合
• single-stranded DNA endodeoxyribonuclease activity
• ATPアーゼ活性
• 血漿タンパク結合
• 3'-5' exonuclease activity
• 加水分解酵素活性
• ATP binding
• double-stranded telomeric DNA binding
• adenylate kinase activity
• G-quadruplex DNA binding
• single-stranded telomeric DNA binding
細胞の構成要素 • site of double-strand break
• 膜
• 核質
• 染色体
• テロメア
• 細胞核
• condensed nuclear chromosome
• MRX複合体
生物学的プロセス • reciprocal meiotic recombination
• DNA recombination
• telomere maintenance via telomerase
• positive regulation of kinase activity
• telomeric 3' overhang formation
• cellular response to DNA damage stimulus
• positive regulation of telomere maintenance
• negative regulation of telomere capping
• DNA duplex unwinding
• 減数分裂
• double-strand break repair
• positive regulation of protein autophosphorylation
• 細胞周期
• viral process
• double-strand break repair via nonhomologous end joining
• telomere maintenance
• regulation of mitotic recombination
• 核酸ホスホジエステル結合の加水分解
• DNA複製
• DNA double-strand break processing
• telomere maintenance via recombination
• DNA synthesis involved in DNA repair
• chromosome organization involved in meiotic cell cycle
• regulation of signal transduction by p53 class mediator
• nucleotide phosphorylation
• DNA修復
• double-strand break repair via homologous recombination
• strand displacement
• telomere capping
• ヌクレオシド一リン酸リン酸化
出典:Amigo / QuickGO
オルソログ
種 ヒト マウス
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq
(mRNA)

NM_133482
NM_005732

NM_009012

RefSeq
(タンパク質)

NP_005723

n/a

場所
(UCSC)
Chr 5: 132.56 – 132.65 Mb Chr 5: 53.54 – 53.6 Mb
PubMed検索 [3] [4]
ウィキデータ
閲覧/編集 ヒト 閲覧/編集 マウス

RAD50は、ヒトではRAD50遺伝子にコードされるタンパク質である[5]。

機能

RAD50遺伝子にコードされるRAD50タンパク質は、DNA二本鎖切断修復に関与するタンパク質である、出芽酵母Saccharomyces cerevisiaeのRad50タンパク質と高度に類似している。このタンパク質はMRE11、NBS1(英語版)(酵母ではXrs2)と複合体を形成する。このMRN複合体(酵母ではMRX複合体)は損傷DNA末端に結合し、非相同末端結合または相同組換えによる二本鎖切断修復に必要な多数の酵素活性を示す。Rad50のマウスホモログの遺伝子ノックアウト研究からは、このタンパク質が細胞成長と生存に必要不可欠であることが示唆されている[5]。

構造

RAD50はSMCタンパク質ファミリーの一員である[6]。他のSMCタンパク質と同様に、RAD50の内部には長いコイルドコイルドメインが存在し、このドメインによって折り返されることでN末端とC末端は共に球状のABC型ATPアーゼヘッドドメインを形成する。RAD50はヘッドドメイン、そしてコイルドコイルの反対側に位置する亜鉛結合二量体化モチーフ(“zinc-hook”と呼ばれる)を介して二量体化することができる[7]。原子間力顕微鏡用いた研究からは、遊離したMRN複合体中ではRAD59二量体中のzinc-hookどうしが結合して閉じたループを形成しているが、DNAへの結合に伴ってzinc-hookは切り離され、zinc-hookを介したDNA損傷末端の係留を可能にするコンフォメーションをとるようになることが示唆されている[8]。

相互作用

RAD50は次に挙げる因子と相互作用することが示されている。

進化的祖先

Rad50タンパク質の研究は主に真核生物で行われている。しかしながら、Rad50タンパク質のオルソログは現存する古細菌にも保存されており、相同組換え修復に機能している可能性が高いことが示されている[20]。超高熱性古細菌Sulfolobus acidocaldariusでは、Rad50とMre11タンパク質は相互作用し、ガンマ線照射によって導入されたDNA損傷の修復に活発な役割を有しているようである[21]。こうした知見は、真核生物のRad50が祖先型古細菌においてDNA損傷の相同組換え修復に役割を果たしていたRad50タンパク質の子孫である可能性を示唆している。

疾患

ヒトのRAD50欠損症は、小頭症と低身長の患者で報告される常染色体劣性症候群である。その臨床的表現型はナイミーヘン染色体不安定症候群(英語版)と類似している。患者由来の細胞は、染色体切断応答の機能不全を伴う放射線感受性の増大を示す[22][23][24]。

出典

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000113522 - Ensembl, May 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000020380 - Ensembl, May 2017
  3. ^ Human PubMed Reference:
  4. ^ Mouse PubMed Reference:
  5. ^ a b “Entrez Gene: RAD50 RAD50 homolog (S. cerevisiae)”. 2022年7月5日閲覧。
  6. ^ “RAD50, an SMC family member with multiple roles in DNA break repair: how does ATP affect function?”. Chromosome Res. 17 (2): 277–88. (2009). doi:10.1007/s10577-008-9018-6. PMC 4494100. PMID 19308707. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4494100/. 
  7. ^ “The Rad50 zinc-hook is a structure joining Mre11 complexes in DNA recombination and repair”. Nature 418 (6897): 562–6. (August 2002). Bibcode: 2002Natur.418..562H. doi:10.1038/nature00922. PMID 12152085. 
  8. ^ “Mesoscale conformational changes in the DNA-repair complex Rad50/Mre11/Nbs1 upon binding DNA”. Nature 437 (7057): 440–3. (September 2005). Bibcode: 2005Natur.437..440M. doi:10.1038/nature03927. PMID 16163361. 
  9. ^ a b c “BASC, a super complex of BRCA1-associated proteins involved in the recognition and repair of aberrant DNA structures”. Genes Dev. 14 (8): 927–39. (2000). doi:10.1101/gad.14.8.927. PMC 316544. PMID 10783165. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC316544/. 
  10. ^ a b “Redistribution of BRCA1 among four different protein complexes following replication blockage”. J. Biol. Chem. 276 (42): 38549–54. (2001). doi:10.1074/jbc.M105227200. PMID 11504724. 
  11. ^ “Association of BRCA1 with the hRad50-hMre11-p95 complex and the DNA damage response”. Science 285 (5428): 747–50. (1999). doi:10.1126/science.285.5428.747. PMID 10426999. 
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  16. ^ “Distinct functional domains of nibrin mediate Mre11 binding, focus formation, and nuclear localization”. Mol. Cell. Biol. 21 (6): 2184–91. (2001). doi:10.1128/MCB.21.6.2184-2191.2001. PMC 86852. PMID 11238951. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC86852/. 
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  20. ^ White MF (January 2011). “Homologous recombination in the archaea: the means justify the ends”. Biochem. Soc. Trans. 39 (1): 15–9. doi:10.1042/BST0390015. PMID 21265740. https://semanticscholar.org/paper/0da16a4a80020789c4630b6bb0a1949eef4a52a1. 
  21. ^ “The Mre11 protein interacts with both Rad50 and the HerA bipolar helicase and is recruited to DNA following gamma irradiation in the archaeon Sulfolobus acidocaldarius”. BMC Mol. Biol. 9: 25. (2008). doi:10.1186/1471-2199-9-25. PMC 2288612. PMID 18294364. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2288612/. 
  22. ^ “Human RAD50 deficiency in a Nijmegen Breakage Syndrome-like disorder”. Am. J. Hum. Genet. 84 (5): 605–16. (2009). doi:10.1016/j.ajhg.2009.04.010. PMC 2681000. PMID 19409520. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2681000/. 
  23. ^ “Human RAD50 deficiency: Confirmation of a distinctive phenotype”. Am. J. Med. Genet. 182 (6): 1378–86. (2020). doi:10.1002/ajmg.a.61570. PMC 7318339. PMID 32212377. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7318339/. 
  24. ^ “A Disease-Causing Single Amino Acid Deletion in the Coiled-Coil Domain of RAD50 Impairs MRE11 Complex Functions in Yeast and Humans”. Cell Rep. 33 (13): 108559. (2020). doi:10.1016/j.celrep.2020.108559. PMC 7788285. PMID 33378670. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7788285/. 

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