OpenMM
出典: フリー百科事典『ウィキペディア（Wikipedia）』 (2021/01/26 10:10 UTC 版)
OpenMMは、分子動力学シミュレーションのためのオープンソースのライブラリであり[1]、パンデ研究室[2]によって管理されている[3]。Python、C++、Fortranなどの言語に対応しており、GPUで高速化する機能を持っている。また、AMOEBA、GROMACS、AMBERなどの他の分子シミュレーションツールとのインタフェースも可能である。スタンフォード大学の研究者ビジェイ・S・パンデが作成したこのプロジェクトは、GitHubで自由に利用できるようになっている[4]。
- ^ P. Eastman, J. Swails, J. D. Chodera, R. T. McGibbon, Y. Zhao, K. A. Beauchamp, L.-P. Wang, A. C. Simmonett, M. P. Harrigan, C. D. Stern, R. P. Wiewiora, B. R. Brooks, and V. S. Pande. (2017). “OpenMM 7: Rapid development of high performance algorithms for molecular dynamics.”. PLOS Comp. Biol. 13(7): e1005659. doi:10.1371/journal.pcbi.1005659.
- ^ “Pande Lab - Vijay Pande's Lab at Stanford University”. 2017年9月11日時点のオリジナルよりアーカイブ。2020年7月19日閲覧。
- ^ “OpenMM”. 2020年7月18日閲覧。
- ^ “OpenMM GitHub repo”. 2020年7月19日閲覧。
- ^ “OpenMM Preview Release Now Available” (2008年9月9日). 2020年7月19日閲覧。
- ^ “Major Milestone for OpenMM: v1.0 Released” (2010年1月21日). 2020年7月19日閲覧。
- ^ “OpenMM Developer Guide”. 2020年7月19日閲覧。
- ^ “OpenMM 7.4.2” (2020年5月26日). 2020年7月19日閲覧。
- ^ “Papers & Results”. 2020年7月19日閲覧。 “Here are our peer-reviewed results from Folding@home. (Folding@homeによるピアレビューの結果)”
- ^ “OpenMM” (2007年11月6日). 2020年7月19日閲覧。
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