構造類似タンパク質ファミリーのデータベース

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構造類似タンパク質ファミリーのデータベース

出典: フリー百科事典『ウィキペディア（Wikipedia）』 (2024/04/07 21:10 UTC 版)

構造類似タンパク質ファミリーのデータベース（英: Families of Structurally Similar Proteins、FSSP）は、距離マトリクスアライメント（英: Distance-matrix ALIgnment、DALI）アルゴリズムを使用して作成された、構造的に重畳したタンパク質のデータベースである^[1]。このデータベースは、タンパク質の構造を比較するのに役立つ。

参照項目

• CATH - タンパク質ドメインの進化的関係に関する情報のデータベース
• SCOP - タンパク質の構造ドメインを分類したデータベース

脚注

1. ^ Holm L, Ouzounis C, Sander C, Tuparev G, Vriend G (1992). “A database of protein structure families with common folding motifs”. Protein Science 1 (12): 1691–1698. doi:10.1002/pro.5560011217. PMC 2142138. PMID 1304898. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2142138/. 

外部リンク

• FSSP Search page at EBI