CATHデータベース
出典: フリー百科事典『ウィキペディア(Wikipedia)』 (2021/05/01 07:31 UTC 版)
CATHタンパク質構造分類データベース(英: CATH Protein Structure Classification database)は、タンパク質ドメインの進化的関係に関する情報を提供する、無料の公開オンラインリソースである。これは1990年代半ばにChristine Orengo教授と同僚のJanet Thornton、David Jonesらによって開発され[2]、現在もユニヴァーシティ・カレッジ・ロンドンのOrengoグループによって開発が続けられている。CATHは、SCOPリソースと大くの幅広い特徴を共有しているが、詳細な分類が大きく異なる領域も多くある[3][4][5][6]。
- ^ a b c d e Dawson, NL; Lewis, TE; Das, S; Lees, JG; Lee, D; Ashford, P; Orengo, CA; Sillitoe, I (28 November 2016). “CATH: an expanded resource to predict protein function through structure and sequence.”. Nucleic Acids Research 45 (D1): D289–D295. doi:10.1093/nar/gkw1098. PMC: 5210570. PMID 27899584 .
- ^ a b Orengo, CA; Michie, AD; Jones, S; Jones, DT; Swindells, MB; Thornton, JM (1997). “CATH – a hierarchic classification of protein domain structures”. Structure 5 (8): 1093–1109. doi:10.1016/S0969-2126(97)00260-8. ISSN 0969-2126. PMID 9309224.
- ^ “CATH: Protein Structure Classification Database at UCL”. Cathdb.info. 2017年3月9日閲覧。
- ^ “CATH”. Cathdb.info. 2017年3月9日閲覧。
- ^ “CATH Database (@CATHDatabase)”. Twitter. 2017年3月9日閲覧。
- ^ Pearl, F. M. G. (2003). “The CATH database: an extended protein family resource for structural and functional genomics”. Nucleic Acids Research 31 (1): 452–455. doi:10.1093/nar/gkg062. ISSN 1362-4962. PMC: 165509. PMID 12520050 .
- ^ “Tools”. cathdb.info. 2016年12月18日閲覧。
- 1 CATHデータベースとは
- 2 CATHデータベースの概要
- 3 オープンソースソフトウェア
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