インテインの命名法とは? わかりやすく解説

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インテインの命名法

出典: フリー百科事典『ウィキペディア(Wikipedia)』 (2015/04/15 00:50 UTC 版)

インテイン」の記事における「インテインの命名法」の解説

インテインの名称の最初部分はその見出され生物学名に基づき次の部分遺伝子またはエクステインに基づく。例えThermoplasma acidophilum に見出されVacuolar ATPase subunit A(VMA)の中にあるものは"Tac VMA"と呼ばれる。普通はこのように生物種特定するには3文字充分であるが、バリエーションもある。例え系統を表すためにさらに字を加え場合もある。1つ遺伝子複数インテインコードされている場合、5'から3'の方向、または発見順の添字付けて例えば"Msm dnaB-1"のように表す。遺伝子インテインコードする部分は普通インテインと同じ名で表すが、混乱避けるためにインテインそのものは普通大文字で(例えば"Pfu RIR1-1"のように)表し対応する遺伝子部分斜体で表す。

※この「インテインの命名法」の解説は、「インテイン」の解説の一部です。
「インテインの命名法」を含む「インテイン」の記事については、「インテイン」の概要を参照ください。

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