ラビリンチュラ綱とは - わかりやすく解説 Weblio辞書

ラビリンチュラ綱

出典: フリー百科事典『ウィキペディア（Wikipedia）』 (2022/09/18 15:21 UTC 版)

ラビリンチュラ綱、ラビリンツラ綱 (学名: Labyrinthulea^{[注 1]})、ラビリンチュラ菌綱、ラビリンツラ菌綱 (学名: Labyrinthulomycetes^{[注 2]}) は、ストラメノパイル (不等毛類) に属する菌類様の原生生物の1群である。栄養体は基本的に単細胞性であるが、ラビリンチュラ属 (ラビリンツラ属^[1]、ラビリンスラ属^[2]) は特異な網状の群体を形成する。ふつう細胞は薄い鱗片が重なった外被で覆われ、また外質ネットとよばれる仮根または糸状仮足様の構造を伸ばしている (右図)。ラビリンチュラ綱の中で、細胞の1または数箇所から仮根状の外質ネットを伸ばしている種は、しばしばヤブレツボカビ類 (英: thraustochytrids) とよばれる^[3]^[4]。海産種が多く知られるが、淡水や陸上に生育する種もいる。基本的に吸収栄養性であり、植物遺骸などを細胞外消化・吸収する腐生性、または生きた生物から栄養を吸収する共生性 (寄生性を含む) である。多価不飽和脂肪酸 (DHAなど) や炭化水素 (スクアレンなど) を多く産生する種が知られており、応用研究が盛んで一部は実用化されている。

脚注

注釈

^ ^a ^b ^c 国際動物命名規約における学名である。
^ ^a ^b ^c 国際藻類・菌類・植物命名規約における学名である。
^ ソロディプロフリス属はウシやウマの糞から単離されている^[9]。
^ 広義の変形菌門の中の水生変形菌綱 (Hydromyxomycetes) やラビリンチュラ菌綱 (Labyrinthulomycetes) に分類されていた^[6]^[53]。
^ サゲニスタ門が提唱された当初はビコソエカ類など他の生物群も含んでいた^[69]。
^ Labyrinthulea Levine & Corliss, 1963 としている例もある^[56]。
^ "アプラノキトリウム目" ("Aplanochytriales"; 非正式名) として独立目としている例もある^[44]。
^ 外質ネットを全く欠くことから他と分けられている。DNAデータが得られておらず、その系統的位置は明らかではない^[10]。ヤブレツボカビ科に含めることもある^[16]。
^ ソロディプロフリス科に分類している例もある^[44]。
^ ステラルキトリウム科をラビリンチュラ目に分類している例もある^[10]^[70]。
^ 環境DNAのみが知られていた LAB 1/6/8 とよばれる系統群に相当する^[75]^[77]。

出典

^ ^a ^b ^c ^d ^e ^f ^g ^h ⁱ ^j 徳増征二 (2005). “ラビリンツラ菌門”. In 杉山純多 (編). バイオディバーシティ・シリーズ (4) 菌類・細菌・ウイルスの多様性と系統. 裳華房. pp. 188–189. ISBN 978-4785358273
^ “ラビリンスラ”. ブリタニカ国際大百科事典コトバンク. 2020年11月11日閲覧。
^ ^a ^b ^c ^d ^e ^f ^g ^h ⁱ ^j ^k ^l ^m ⁿ ^o ^p ^q 本多大輔 (2012). “ラビリンチュラ類”. In 渡邉信 (監). 藻類ハンドブック. 株式会社エヌ・ティー・エス. pp. 73-76. ISBN 978-4864690027
^ ^a ^b ^c ^d ^e ^f ^g 巌佐庸, 倉谷滋, 斎藤成也 & 塚谷裕一 (編) (2013). “ラビリンツラ類”. 岩波生物学辞典第5版. 岩波書店. p. 1437. ISBN 978-4000803144
^ ^a ^b ^c ^d ^e ^f ^g ^h ⁱ ^j ^k ^l ^m ⁿ ^o ^p ^q ^r ^s ^t ^u ^v ^w ^x ^y ^z ^aa ^ab ^ac ^ad Marchan, L. F., Chang, K. J. L., Nichols, P. D., Mitchell, W. J., Polglase, J. L. & Gutierrez, T. (2018). “Taxonomy, ecology and biotechnological applications of thraustochytrids: A review”. Biotechnology Advances 36: 26-46. doi:10.1016/j.biotechadv.2017.09.003.
^ ^a ^b ^c ^d ^e ^f ^g ^h ⁱ ^j ^k ジョン・ウェブスター (著) 椿啓介・三浦宏一郎・山本昌木 (訳) (1985). “水生変形菌綱”. ウェブスター菌類概論. 講談社サイエンティフィク. pp. 20–23. ISBN 978-4061396098
^ ^a ^b ^c ^d ^e ^f ^g ^h ⁱ ^j ^k ^l Beakes, G. W., Honda, D. & Thines, M. (2014). “Systematics of the Straminipila: Labyrinthulomycota, Hyphochytriomycota, and Oomycota”. In McLaughlin, D. J. & Spatafora, J. W.. THE MYCOTA, volume 7A. Systematics and Evolution Part A. Springer. pp. 39-97. doi:10.1007/978-3-642-55318-9_3
^ ^a ^b ^c Dykstra, M. J. & Olive, L. S. (1975). “Sorodiplophrys: an unusual sorocarp-producing protist”. Mycologia 67: 873-879. doi:10.2307/3758346.
^ ^a ^b ^c Tice, A. K., Silberman, J. D., Walthall, A. C., Le, K. N., Spiegel, F. W. & Brown, M. W. (2016). “Sorodiplophrys stercorea: another novel lineage of sorocarpic multicellularity”. Journal of Eukaryotic Microbiology 63: 623-628. doi:10.1111/jeu.12311.
^ ^a ^b ^c ^d ^e ^f ^g ^h ⁱ ^j ^k ^l ^m ⁿ ^o ^p ^q ^r ^s ^t ^u ^v ^w ^x ^y ^z ^aa ^ab ^ac ^ad ^ae ^af ^ag ^ah ^ai ^aj ^ak ^al ^am Bennett, R. M., Honda, D., Beakes, G. W. & Thines, M. (2017). “Labyrinthulomycota”. In Archibald, J. M., Simpson, A. G. B. & Slamovits, C. H.. Handbook of the Protists. Springer. pp. 507-542. ISBN 978-3319281476
^ ^a ^b ^c ^d Honda, D., Yokochi, T., Nakahara, T., Raghukumar, S., Nakagiri, A., Schaumann, K. & Higashihara, T. (1999). “Molecular phylogeny of labyrinthulids and thraustochytrids based on the sequencing of 18S RNA gene”. Journal of Eukaryotic Microbiology 46: 637-646. doi:10.1111/j.1550-7408.1999.tb05141.x.
^ ^a ^b ^c ^d Moss, S. (1986). “Biology and phylogeny of the Labyrinthulales and Thraustochytriales”. The Biology of Marine Fungi. Cambridge University Press. pp. 105-129. ISBN 978-0521308991
^ ^a ^b ^c ^d ^e ^f Gomaa, F., Mitchell, E. A. & Lara, E. (2013). “Amphitremida (Poche, 1913) is a new major, ubiquitous labyrinthulomycete clade”. PLoS One 8: e53046. doi:10.1371/journal.pone.0053046.
^ Lee, J. J., Leedale, G. F. & Bradbury, P., ed (2000). An Illustrated Guide to the Protozoa, Organisms Traditionally Referred to as Protozoa, or Newly Discovered Groups. Blackwell Publishers. p. 1064. ISBN 978-1891276224
^ Jain, R., Raghukumar, S., Tharanathan, R. & Bhosle, N.B. (2005). “Extracellular polysaccharide production by thraustochytrid protists”. Mar. Biotechnol. 7: 184–192. doi:10.1007/s10126-004-4025-x.
^ ^a ^b ^c ^d ^e ^f ^g ^h ⁱ 本多大輔 (2013). “1.8.5 ラビリンチュラ菌門”. In 日本菌学会 (編). 菌類の事典. 朝倉書店. pp. 39–41. ISBN 978-4254171471
^ ^a ^b ^c ^d 白山義久 (編) (2000). “ラビリンツラ門”. バイオディバーシティ・シリーズ (5) 無脊椎動物の多様性と系統. 裳華房. pp. 80–81. ISBN 978-4785358273
^ ^a ^b ^c 高尾祥丈, 長崎慶三 & 本多大輔 (2007). “ウイルス研究から見た海産原生生物ラビリンチュラ類の生態学的多様性”. 極限環境微生物学会誌 6: 68-73. doi:10.3118/jjse.6.68.
^ ^a ^b ^c ^d Porter, D. (1990). “Phylum Labyrinthulomycota”. In Margulis, L., Corliss, J. O., Melkonian, M. & Chapman, D. J.. Handbook of Protoctista. Jones and Bartlett. pp. 388–398. ISBN 978-0867200522
^ ^a ^b ^c ^d ^e ^f Alexopoulos, C. J., Mims, C. W. & Blackwell, M. (1996). “Phylum Labyrinthulomycota”. Introductory Mycology. John Wiley & Sons. Inc., New York. pp. 743–750. ISBN 978-0-471-52229-4
^ Moss, S. T. (1985). “An ultrastructural study of taxonomically significant characters of the Thraustochytriales and Labyrinthulales”. Bot. J. Linn. Soc. 91: 329–357. doi:10.1111/j.1095-8339.1985.tb01154.x.
^ Dykstra, M. J. & Porter, D. (1984). “Diplophrys marina, a new scale-forming marine protist with labyrinthulid affinities”. Mycologia 76 (4): 626-632. doi:10.1080/00275514.1984.12023892.
^ ^a ^b Lara, E. & Gomaa, F. (2017). “Symbiosis between testate amoebae and photosynthetic organisms”. Algal and Cyanobacteria Symbioses. pp. 399-419. doi:10.1142/9781786340580_0013
^ 本多大輔 (2009年). “Laby Base”. 甲南大学. 2020年11月5日閲覧。
^ Perkins, F. O. & Amon, J. P. (1969). “Zoosporulation in Labyrinthula sp.; an electron microscope study”. The Journal of Protozoology 16: 235-257. doi:10.1111/j.1550-7408.1969.tb02265.x.
^ Barr, D. J. & Allan, P. M. (1985). “A comparison of the flagellar apparatus in Phytophthora, Saprolegnia, Thraustochytrium, and Rhizidiomyces”. Canadian Journal of Botany 63 (1): 138-154. doi:10.1139/b85-017.
^ Moens, P. B. & Perkins, F. O. (1969). “Chromosome number of a small protist: accurate determination”. Science 166 (3910): 1289-1291. doi:10.1126/science.166.3910.1289.
^ Ganuza, E., Yang, S., Amezquita, M., Giraldo-Silva, A. & Andersen, R. A. (2019). “Genomics, biology and phylogeny Aurantiochytrium acetophilum sp. nov.(Thraustrochytriaceae), including first evidence of sexual reproduction”. Protist 170: 209-232. doi:10.1016/j.protis.2019.02.004.
^ ^a ^b 月井雄二 (2010). 淡水微生物図鑑　原生生物ビジュアルガイドブック. 誠文堂新光社. p. 50. ISBN 978-4416210048
^ 中山剛 & 山口晴代 (2018). プランクトンハンドブック淡水編. 文一総合出版. p. 96. ISBN 978-4829981542
^ Bongiorni, L. (2012). “Thraustochytrids, a neglected component of organic matter decomposition and food webs in marine sediments”. In Raghukuma, C.. Biology of Marine Fungi. Prog. Mol. Subcell. Biol. 53.. Springer. pp. 1–13. ISBN 978-3-642-23342-5
^ ^a ^b ^c 中村慶子 & 長沼毅 (2007). “海洋環境におけるラビリンチュラ類の生態学的役割”. 日本海水学会誌 61: 316-320. doi:10.11457/swsj1965.61.316.
^ Bigelow, D. M., Olsen, M. W. & Gilbertson, R. L. (2005). “Labyrinthula terrestris sp. nov., a new pathogen of turf grass”. Mycologia 97: 185-190. doi:10.1080/15572536.2006.11832852.
^ ^a ^b Douhan, G. W., Olsen, M. W., Herrell, A., Winder, C., Wong, F. & Entwistle, K. (2009). “Genetic diversity in Labyrinthula terrestris, a newly emergent plant pathogen, and the discovery of new Labyrinthulid organism”. Mycol. Res. 113: 1192–1199. doi:10.1016/j.mycres.2009.08.002.
^ Hassett, B. T. (2020). “A widely distributed thraustochytrid parasite of diatoms isolated from the Arctic represents a gen. and sp. nov.”. The Journal of Eukaryotic Microbiology. doi:10.1111/jeu.12796.
^ Koske, R. E. (1981). “Labyrinthula inside the spores of a vesicular—arbuscular mycorrhizal fungus”. Mycologia 73 (6): 1175-1180. doi:10.1080/00275514.1981.12021451.
^ Dyková, I., Fiala, I., Dvořáková, H. & Pecková, H. (2008). “Living together: The marine amoeba Thecamoeba hilla Schaeffer, 1926 and its endosymbiont Labyrinthula sp”. European Journal of Protistology 44: 308-316. doi:10.1016/j.ejop.2008.04.001.
^ Azevedo, C. & Corral, L. (1997). “Some ultrastructural observations of a thraustochytrid (Protoctista, Labyrinthulomycota) from the clam Ruditapes decussatus (Mollusca, Bivalvia)”. Diseases of Aquatic Organisms 31: 73-78. doi:10.3354/dao031073.
^ Jones, G. M. & O’Dor, R. K. (1983). “Ultrastructural observations on a thraustochytrid fungus parasitic in the gills of squid (Illex illecebrosus Lesueur)”. J. Parasitol. 69: 903–911. doi:10.2307/3281055.
^ Raghukumar, S. (2002). “Bacterivory: a novel dual role for thraustochytrids in the sea”. Marine Biology 113: 165-169. doi:10.1007/BF00367650.
^ Gomaa, F., Kosakyan, A., Heger, T. J., Corsaro, D., Mitchell, E. A. & Lara, E. (2014). “One alga to rule them all: unrelated mixotrophic testate amoebae (Amoebozoa, Rhizaria and Stramenopiles) share the same symbiont (Trebouxiophyceae)”. Protist 165 (2): 161-176. doi:10.1016/j.protis.2014.01.002.
^ Muehlstein, L., Porter, D. & Short, F. (1991). “Labyrinthula zosterae sp. nov., the causative agent of wasting disease of eelgrass, Zostera marina”. Mycologia 83: 180–191. doi:10.1080/00275514.1991.12025994.
^ Brakel, J., Werner, F.J., Tams, V., Reusch, T.B.H. & Bockelmann, A.C. (2014). “Current European Labyrinthula zosterae are not virulent and modulate seagrass (Zostera marina) defense gene expression”. PLoS One 9. doi:10.1371/journal.pone.0092448.
^ ^a ^b ^c Preisfeld, A. (2012). “Labyrinthulomycota”. In Frey, W. (eds.). Syllabus of Plant Families. A. Engler's Syllabus der Pflanzenfamilien Part 1/1. Borntraeger. pp. 94-97. ISBN 978-3-443-01061-4
^ Bassim, S. & Allam, B. (2018). “SNP hot-spots in the clam parasite QPX”. BMC Genomics 19: 486. doi:10.1186/s12864-018-4866-8.
^ Geraci-Yee, S., Brianik, C. J., Rubin, E., Collier, J. L. & Allam, B. (2021). “Erection of a new genus and species for the pathogen of hard clams ‘Quahog Parasite Unknown’(QPX): Mucochytrium quahogii gen. nov., sp. nov.”. Protist 172 (1): 125793. doi:10.1016/j.protis.2021.125793.
^ Bower, S. M., McLean, N. & Whitaker, D. J. (1989). “Mechanism of infection by Labyrinthuloides haliotidis (Protozoa, Labyrinthomorpha), a parasite of abalone (Haliotis kamtschatka) (Mollusca, Gastropoda)”. Journal of Invertebrate Pathology 53: 401–409. doi:10.1016/0022-2011(89)90106-7.
^ ^a ^b ^c Aasen, I. M., Ertesvåg, H., Heggeset, T. M. B., Liu, B., Brautaset, T., Vadstein, O. & Ellingsen, T. E. (2016). “Thraustochytrids as production organisms for docosahexaenoic acid (DHA), squalene, and carotenoids”. Applied Microbiology and Biotechnology 100: 4309-4321. doi:10.1007/s00253-016-7498-4.
^ Winwood, R. J. (2013). “Recent developments in the commercial production of DHA and EPA rich oils from micro-algae”. OCL 20 (6): D604. doi:10.1051/ocl/2013030.
^ “なぜlife's製品なのか？”. life'sDHA. 2020年8月15日閲覧。
^ Aki, T., Hachida, K., Yoshinaga, M., Katai, Y., Yamasaki, T., Kawamoto, S., ... & Ono, K. (2003). “Thraustochytrid as a potential source of carotenoids”. Journal of the American Oil Chemists' Society 80: 789-794.
^ Kaya, K., Nakazawa, A., Matsuura, H., Honda, D., Inouye, I. & Watanabe, M.M. (2011). “Thraustochytrid Aurantiochytrium sp. 18W-13a accummulates high amounts of squalene”. Biosci. Biotechnol. Biochem. 75: 2246–2248. doi:10.1271/bbb.110430.
^ ^a ^b ^c 杉山純多 (2005). “菌類の多様性と分類体系”. In 杉山純多 (編). バイオディバーシティ・シリーズ (4) 菌類・細菌・ウイルスの多様性と系統. 裳華房. pp. 38–39. ISBN 978-4785358273
^ 井上浩, 岩槻邦男, 柏谷博之, 田村道夫, 堀田満, 三浦宏一郎 & 山岸高旺 (1983). 植物系統分類の基礎. 北隆館. p. 20
^ David, J.C. (2002年). “A Preliminary Catalogue of the Names of Fungi above the Rank of Order”. Constancea, University and Jepson Herbaria. 2020年10月18日閲覧。
^ ^a ^b Levine, N. D., Corliss, J. O., Cox, F. E. G., Deroux, G., Grain, J., Honigberg, B. M., ... & Merinfeld, E. G. (1980). “A Newly Revised Classification of the Protozoa”. The Journal of Protozoology 27 (1): 37-58.. doi:10.1111/j.1550-7408.1980.tb04228.x.
^ 井上浩, 岩槻邦男, 柏谷博之, 田村道夫, 堀田満, 三浦宏一郎 & 山岸高旺 (1983). 植物系統分類の基礎. 北隆館. p. 33
^ Perkins, F. O. (1972). “The ultrastructure of holdfasts,“rhizoids”, and “slime tracks” in thraustochytriaceous fungi and Labyrinthula spp”. Archiv für Mikrobiologie 84 (2): 95-118. doi:10.1007/BF00412431.
^ Alderman, D. J., Harrison, J. L., Bremer, G. B. & Jones, E. B. G. (1974). “Taxonomic revisions in the marine biflagellate fungi: the ultrastructural evidence”. Marine Biology 25: 345-357. doi:10.1007/BF00404978.
^ ^a ^b Tsui, C. K., Marshall, W., Yokoyama, R., Honda, D., Lippmeier, J. C., Craven, K. D., ... & Berbee, M. L. (2009). “Labyrinthulomycetes phylogeny and its implications for the evolutionary loss of chloroplasts and gain of ectoplasmic gliding”. Molecular Phylogenetics and Evolution 50 (1): 129-140. doi:10.1016/j.ympev.2008.09.027.
^ Patterson, D. J. (1989). “Chromophytes from a protistan perspective”. In Green, J. P. Leadbeater, B. S. C. & Diver, W. L.. The Chromophyte Algae, Problems and Perspectives. Clarendon Press. pp. 357–379. ISBN 978-0198577133
^ ^a ^b ^c Anderson, O.R. & Cavalier-Smith, T. (2012). “Ultrastructure of Diplophrys parva, a new small freshwater species, and a revised analysis of Labyrinthulea (Heterokonta)”. Acta Protozool. 51: 291–304. doi:10.4467/16890027AP.12.023.0783.
^ ^a ^b 巌佐庸, 倉谷滋, 斎藤成也 & 塚谷裕一 (編) (2013). “分類表”. 岩波生物学辞典第5版. 岩波書店. p. 1653. ISBN 978-4000803144
^ ^a ^b 白山義久 (編) (2000). “分類表”. バイオディバーシティ・シリーズ (5) 無脊椎動物の多様性と系統. 裳華房. p. 265. ISBN 978-4785358273
^ ^a ^b 杉山純多 (編), ed (2005). “分類表”. バイオディバーシティ・シリーズ (4) 菌類・細菌・ウイルスの多様性と系統. 裳華房. p. 397. ISBN 978-4785358273
^ ^a ^b “The MycoBank engine and related databases”. Robert, V., Stegehuis, G. & Stalpers, J.. 2020年10月25日閲覧。
^ ^a ^b Cavalier-Smith, T. (2018). “Kingdom Chromista and its eight phyla: a new synthesis emphasising periplastid protein targeting, cytoskeletal and periplastid evolution, and ancient divergences”. Protoplasma 255: 297–357. doi:10.1007/s00709-017-1147-3.
^ Thakur, R., Shiratori, T. & Ishida, K. I. (2019). “Taxon-rich multigene phylogenetic analyses resolve the phylogenetic relationship among deep-branching stramenopiles”. Protist 170 (5): 125682. doi:10.1016/j.protis.2019.125682.
^ Cavalier-Smith, T. (1997). “Sagenista and Bigyra, two phyla of heterotrophic heterokont chromists”. Archiv für Protistenkunde 148 (3): 253-267. doi:10.1016/S0003-9365(97)80006-1.
^ ^a ^b Adl, S. M., Bass, D., Lane, C. E., Lukeš, J., Schoch, C. L., Smirnov, A., ... & Cárdenas, P. (2019). “Revisions to the classification, nomenclature, and diversity of eukaryotes”. Journal of Eukaryotic Microbiology 66 (1): 4-119. doi:10.1111/jeu.12691.
^ ^a ^b Yokoyama, R. & Honda, D. (2007). “Taxonomic rearrangement of the genus Schizochytrium sensu lato based on morphology, chemotaxonomic characteristics, and 18S rRNA gene phylogeny (Thraustochytriaceae, Labyrinthulomycetes): emendation for Schizochytrium and erection of Aurantiochytrium and Oblongichytrium gen. nov”. Mycoscience 48: 199–211. doi:10.1007/s10267-006-0362-0.
^ ^a ^b Yokoyama, R., Salleh, B. & Honda, D. (2007). “Taxonomic rearrangement of the genus Ulkenia sensu lato based on morphology, chemotaxonomical characteristics, and 18S rRNA gene phylogeny (Thraustochytriaceae, Labyrinthulomycetes): Emendation for Ulkenia and erection of Botryochytrium, Parietichytrium, Sicyoidochytrium gen. nov.”. Mycoscience 48: 329–341. doi:10.1007/s10267-007-0377-1.
^ Doi, K. & Honda, D. (2017). “Proposal of Monorhizochytrium globosum gen. nov., comb. nov.(Stramenopiles, Labyrinthulomycetes) for former Thraustochytrium globosum based on morphological features and phylogenetic relationships”. Phycological Research 65 (3): 188-201. doi:10.1111/pre.12175.
^ ^a ^b Takahashi, Y., Yoshida, M., Inouye, I. & Watanabe, M. M. (2016). “Fibrophrys columna gen. nov., sp. nov: A member of the family Amphifilidae”. European Journal of Protistology 56: 41-50. doi:10.1016/j.ejop.2016.06.003.
^ ^a ^b Pan, J., del Campo, J. & Keeling, P. J. (2017). “Reference tree and environmental sequence diversity of Labyrinthulomycetes”. Journal of Eukaryotic Microbiology 64: 88–96. doi:10.1111/jeu.12342.
^ ^a ^b ^c ^d Wijayawardene, N. N., Hyde, K. D., Al-Ani, L. K. T., Tedersoo, L., Haelewaters, D., Rajeshkumar, K. C. ... & Tokarev, Y. S. (2020). “Outline of Fungi and fungus-like taxa”. Mycosphere 11 (1): 1060-1456. doi:10.5943/mycosphere/11/1/8.
^ ^a ^b FioRito, R., Leander, C. & Leander, B. (2016). “Characterization of three novel species of Labyrinthulomycota isolated from ochre sea stars (Pisaster ochraceus)”. Marine Biology 163 (8): 170. doi:10.1007/s00227-016-2944-5.