フォークヘッドドメインとは? わかりやすく解説

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フォークヘッドドメイン

(fork head domain から転送)

出典: フリー百科事典『ウィキペディア(Wikipedia)』 (2025/12/30 14:08 UTC 版)

Fork head domain
識別子
略号 Fork_head
Pfam PF00250
InterPro IPR001766
SMART SM00339
PROSITE PDOC00564
SCOP 2hfh
SUPERFAMILY 2hfh
CDD cd00059
利用可能な蛋白質構造:
Pfam structures
PDB RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum structure summary
PDB 1d5v​, 1e17​, 1jxs​, 1kq8​, 2a3s​, 2c6y​, 2d2w​, 2hdc​, 2hfh
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フォークヘッドドメイン: fork head domain)またはウィングドヘリックスドメイン: winged helix domain)は、転写因子に多くみられるタンパク質ドメインの1つであり、DNAに結合する目的で利用されている[1][2]

機能

キイロショウジョウバエDrosophila melanogasterのfork headタンパク質は胚の末端部の形成に関わっている転写因子であるが、他の転写因子に特徴的なホメオドメインジンクフィンガーのいずれも持っていない[3]。その代わりに、このタンパク質には約100アミノ酸からなる、異なったタイプのDNA結合領域が存在している。その後これに類似した領域は他の多くの転写因子でも同定され(キイロショウジョウバエのFD1-5、哺乳類のHNF3、ヒトのHTLF、出芽酵母のHCM1など)、フォークヘッドドメインもしくはウィングドヘリックスドメインと呼ばれるようになった[2][3][4]。このドメインは3本のαヘリックス、3本のストランドからなる逆平行βシート、そして2つの翼状のループから構成され、DNAの軸に直交するような形で主溝に結合する[5]。このドメインを持つ転写因子は初期胚発生段階における細胞運命の決定に関わる機能を有している[4]。これらの転写因子はフォークヘッドボックス(FOX)転写因子と呼ばれ、配列保存性に基づいてサブクラスAからSへの分類がなされている[6]。一例として、サブクラスOのメンバー(FOXO)は、代謝、細胞増殖、ストレス耐性、そしておそらく寿命に重要な役割を果たしている[7]

出典

  1. ^ Kaufmann E, Knöchel W (June 1996). “Five years on the wings of fork head”. Mech. Dev. 57 (1): 3–20. doi:10.1016/0925-4773(96)00539-4. PMID 8817449. 
  2. ^ a b Clark KL, Halay ED, Lai E, Burley SK (July 1993). “Co-crystal structure of the HNF-3/fork head DNA-recognition motif resembles histone H5”. Nature 364 (6436): 412–20. doi:10.1038/364412a0. PMID 8332212. 
  3. ^ a b Weigel D, Jürgens G, Küttner F, Seifert E, Jäckle H (May 1989). “The homeotic gene fork head encodes a nuclear protein and is expressed in the terminal regions of the Drosophila embryo”. Cell 57 (4): 645–58. doi:10.1016/0092-8674(89)90133-5. PMID 2566386. 
  4. ^ a b Häcker U, Grossniklaus U, Gehring WJ, Jäckle H (September 1992). “Developmentally regulated Drosophila gene family encoding the fork head domain”. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 89 (18): 8754–8. doi:10.1073/pnas.89.18.8754. PMC 49999. PMID 1356269. https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC49999/. 
  5. ^ Psenakova, Katarina; Kohoutova, Klara; Obsilova, Veronika; Ausserlechner, Michael J.; Veverka, Vaclav; Obsil, Tomas (2019-08-24). “Forkhead Domains of FOXO Transcription Factors Differ in both Overall Conformation and Dynamics”. Cells 8 (9): 966. doi:10.3390/cells8090966. ISSN 2073-4409. PMC 6770010. PMID 31450545. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31450545. 
  6. ^ Kaestner, K. H.; Knochel, W.; Martinez, D. E. (2000-01-15). “Unified nomenclature for the winged helix/forkhead transcription factors”. Genes & Development 14 (2): 142–146. ISSN 0890-9369. PMID 10702024. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/10702024. 
  7. ^ van der Horst A, Burgering BM (June 2007). “Stressing the role of FoxO proteins in lifespan and disease”. Nature Reviews Molecular Cell Biology 8 (6): 440–50. doi:10.1038/nrm2190. PMID 17522590. 

関連項目




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