立体配座選択
(conformational proofreading から転送)
出典: フリー百科事典『ウィキペディア（Wikipedia）』 (2024/04/07 08:29 UTC 版)
立体配座選択（りったいはいざせんたく、英: conformational selection）または立体構造校正（英: conformational proofreading）は、分子認識系の一般的な機構であり、分子認識系とその標的との間に構造的不一致またはエネルギー的障壁を導入することによって、認識の特異性と質を向上させる[1][2][3][4][5][6]。立体配座選択はエネルギーを消費しないので、どのような分子認識系でも利用することができる。立体配座選択は、認識系が多くの類似した競合相手から適切な標的を選択しなければならない場合に特に有効である。
- ^ Savir Y & Tlusty T (2007). Scalas, Enrico. ed. “Conformational Proofreading: The Impact of Conformational Changes on the Specificity of Molecular Recognition”. PLOS ONE 2 (5): e468. Bibcode: 2007PLoSO...2..468S. doi:10.1371/journal.pone.0000468. PMC 1868595. PMID 17520027.
- ^ Savir Y, Tlusty T (2008). “Optimal Design of a Molecular Recognizer : Molecular Recognition as a Bayesian Signal Detection Problem”. IEEE J Sel Topics Signal Process 2 (3): 390–399. arXiv:1007.4527. Bibcode: 2008ISTSP...2..390S. doi:10.1109/JSTSP.2008.923859.
- ^ a b c Savir Y, Tlusty T (2010). “RecA-mediated homology search as a nearly optimal signal detection system”. Molecular Cell 40 (3): 388–96. arXiv:1011.4382. doi:10.1016/j.molcel.2010.10.020. PMID 21070965.
- ^ a b c Rambo RP, Williams GJ, Tainer JA (2010). “Achieving Fidelity in Homologous Recombination Despite Extreme Complexity: Informed Decisions by Molecular Profiling”. Molecular Cell 40 (3): 347–48. doi:10.1016/j.molcel.2010.10.032. PMC 3003302. PMID 21070960.
- ^ a b c Savir, Yonatan; Tlusty, Tsvi (Apr 11, 2013). “The ribosome as an optimal decoder: a lesson in molecular recognition.”. Cell 153 (2): 471–9. Bibcode: 2013APS..MARY46006T. doi:10.1016/j.cell.2013.03.032. PMID 23582332.
- ^ Alon U (2008). “Journal Club”. Nature 453 (7196): 701. Bibcode: 2008Natur.453..701A. doi:10.1038/453701e.
- ^ Koshland, D. E. (1958). “Application of a Theory of Enzyme Specificity to Protein Synthesis”. Proc Natl Acad Sci U S A 44 (2): 98–104. Bibcode: 1958PNAS...44...98K. doi:10.1073/pnas.44.2.98. PMC 335371. PMID 16590179.
- ^ Chen Z, Yang H, Pavletich NP (2008). “Mechanism of homologous recombination from the RecA-ssDNA/dsDNA structures”. Nature 453 (7194): 489–4. Bibcode: 2008Natur.453..489C. doi:10.1038/nature06971. PMID 18497818.
- ^ De Vlaminck I, van Loenhout MT, Zweifel L, den Blanken J, Hooning K, Hage S, Kerssemakers J, Dekker C (2012). “Mechanism of Homology Recognition in DNA Recombination from Dual-Molecule Experiments”. Molecular Cell 46 (5): 616–624. doi:10.1016/j.molcel.2012.03.029. PMID 22560720.
- ^ Ghodke H, Wang H, Hsieh CL, Woldemeskel S, Watkins SC, Rapić-Otrin V, Van Houten B (May 6, 2014). “Single-molecule analysis reveals human UV-damaged DNA-binding protein (UV-DDB) dimerizes on DNA via multiple kinetic intermediates.”. Proc Natl Acad Sci U S A 111 (18): 1862–71. Bibcode: 2014PNAS..111E1862G. doi:10.1073/pnas.1323856111. PMC 4020048. PMID 24760829.
- ^ Hopfield JJ (1974). “Kinetic Proofreading: A New Mechanism for Reducing Errors in Biosynthetic Processes Requiring High Specificity”. Proc Natl Acad Sci U S A 71 (10): 4135–4139. Bibcode: 1974PNAS...71.4135H. doi:10.1073/pnas.71.10.4135. PMC 434344. PMID 4530290.
- ^ Ninio J (1975). “Kinetic amplification of enzyme discrimination Biochimie”. Biochimie 57 (5): 587–595. doi:10.1016/S0300-9084(75)80139-8. PMID 1182215.
[続きの解説]
「立体配座選択」の続きの解説一覧
- 1 立体配座選択とは
- 2 立体配座選択の概要
- 3 その他の生物系
- 4 外部リンク
- 立体配座選択のページへのリンク
