機能注釈精密評価
出典: フリー百科事典『ウィキペディア（Wikipedia）』 (2022/10/14 04:15 UTC 版)
機能注釈精密評価 (Critical Assessment of Functional Annotation、CAFA) は、タンパク質の機能予測に特化した計算手法を大規模に評価するために設計された実験である[1]。各アルゴリズムは、分子機能、生物学的プロセス、細胞成分のカテゴリにおける遺伝子オントロジー (GO) 用語の予測能力によって評価される。
- ^ Predrag, Radivojac (2013). “A large-scale evaluation of computational protein function prediction”. Nature Methods 10 (3): 221–227. doi:10.1038/nmeth.2340. PMC 3584181. PMID 23353650.
- ^ Bernal, Axel; Uy Ear; Nikos Kyrpides (2001). “Genomes OnLine Database (GOLD): a monitor of genome projects world-wide”. Nucleic Acids Research 29 (1): 126–127. doi:10.1093/nar/29.1.126. PMC 29859. PMID 11125068.
- ^ Rodrigues, Ana; Barry Grant; Adam Godzik; Iddo Friedberg (2007). “The 2006 Automated Function Prediction Meeting”. Bioinformatics 8 (Suppl 4): S1–4. doi:10.1186/1471-2105-8-s4-s1. PMC 1892079. PMID 17570143.
- ^ Friedberg, Iddo; Martin Jambon; Adam Godzik (June 2006). “New avenues in protein function prediction”. Protein Science 15 (6): 1527–1529. doi:10.1110/ps.062158406. PMC 2242544. PMID 16731984.
- ^ Gillis, Jesse; Paul Pavlidis (April 2013). “Characterizing the state of the art in the computational assignment of gene function: lessons from the first critical assessment of functional annotation (CAFA)”. BMC Bioinformatics 14 (Suppl 3): S15. doi:10.1186/1471-2105-14-s3-s15. PMC 3633048. PMID 23630983.
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