タンパク質-リガンドドッキング
出典: フリー百科事典『ウィキペディア（Wikipedia）』 (2020/07/26 04:52 UTC 版)
タンパク質-リガンドドッキング（タンパクしつ-リガンドドッキング、英: Protein-ligand docking）は、分子モデリング技術である。タンパク質-リガンドドッキングの目的は、リガンド（低分子）がタンパク質受容体や酵素に結合したときの位置や配向を予測することである[1]。製薬研究では、様々な目的のためにドッキング技術を採用していて、特に薬剤候補を選択するために、利用可能な化学物質の大規模データベースのバーチャルスクリーニングで顕著である。
- ^ Taylor, R.D.; Jewsbury, P.J.; Essex, J.W. (2002-03-01). “A review of protein-small molecule docking methods” (英語). Journal of Computer-Aided Molecular Design 16 (3): 151–166. doi:10.1023/A:1020155510718. ISSN 1573-4951. PMID 12363215.
- ^ a b Antunes, Dinler A; Devaurs, Didier; Kavraki, Lydia E (2015-09-28). “Understanding the challenges of protein flexibility in drug design” (英語). Expert Opinion on Drug Discovery 10 (12): 1301–1313. doi:10.1517/17460441.2015.1094458. ISSN 1746-0441. PMID 26414598.
- ^ Cerqueira, N. M. F. S. A.; Bras, N. F.; Fernandes, P. A.; Ramos, M. J. (2009-07-10). “MADAMM: A multistaged docking with an automated molecular modeling protocol” (英語). Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics 74 (1): 192–206. doi:10.1002/prot.22146. PMID 18618708.
- ^ Ciemny, Maciej; Kurcinski, Mateusz; Kamel, Karol; Kolinski, Andrzej; Alam, Nawsad; Schueler-Furman, Ora; Kmiecik, Sebastian (2018-05-04). “Protein–peptide docking: opportunities and challenges” (英語). Drug Discovery Today 23 (8): 1530–1537. doi:10.1016/j.drudis.2018.05.006. ISSN 1359-6446. PMID 29733895.
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