VMD
Visual Molecular Dynamics
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出典: フリー百科事典『ウィキペディア（Wikipedia）』 (2018/06/08 02:40 UTC 版)
Visual molecular dynamics（ビジュアル・モレキュラー・ダイナミクス、略称: VMD）は、分子モデリングならびに可視化コンピュータプログラムである。VMDは分子動力学シミュレーションの結果を眺め、解析するためのツールとして主に開発されたが、容積データや配列データ、任意のグラフィックオブジェクトを扱うためのツールも含まれている。分子の光景はPOV-RayやRenderMan、Tachyon、VRML、その他多くの外部レンダリングツールへ出力できる。VMDは組み込みTclおよびPythonインタプリタを含んでいるため、利用者はVMD内で自身のTClおよびPythonスクリプトを走らせることができる。VMDは無償で入手可能であり、ソースコードを含むが、ライセンスは非フリーである。
- ^ a b “VMD Release History”. 2015年7月16日閲覧。
- ^ Humphrey, W.; Dalke, A.; Schulten, K. (1996). “VMD: Visual molecular dynamics”. J. Mol. Graph. 14 (1): 33–38. doi:10.1016/0263-7855(96)00018-5.
- ^ Stone, J. E.; Gullingsrud, J.; Schulten, K. (2001). “A system for interactive molecular dynamics simulation”. I3D '01 Proceedings of the 2001 symposium on Interactive 3D graphics: 191-194. doi:10.1145/364338.364398.
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- 2 Visual Molecular Dynamicsの概要
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