KHDRBS3とは? わかりやすく解説

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KHDRBS3

(T-STAR から転送)

出典: フリー百科事典『ウィキペディア(Wikipedia)』 (2023/07/09 06:54 UTC 版)

KHDRBS3
PDBに登録されている構造
PDB オルソログ検索: RCSB PDBe PDBj
PDBのIDコード一覧

5ELR, 5ELS, 5EMO, 5ELT, 5EL3

識別子
記号 KHDRBS3, Etle, SALP, SLM-2, SLM2, T-STAR, TSTAR, etoile, KH domain containing, RNA binding, signal transduction associated 3, KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3
外部ID OMIM: 610421 MGI: 1313312 HomoloGene: 4780 GeneCards: KHDRBS3
遺伝子の位置 (マウス)
染色体 15番染色体 (マウス)[1]
バンド データ無し 開始点 68,800,269 bp[1]
終点 68,973,060 bp[1]
RNA発現パターン
さらなる参照発現データ
遺伝子オントロジー
分子機能 SH3 domain binding
血漿タンパク結合
RNA結合
核酸結合
protein domain specific binding
identical protein binding
細胞の構成要素 細胞核
核質
生物学的プロセス regulation of transcription, DNA-templated
transcription, DNA-templated
mRNA processing
regulation of mRNA splicing, via spliceosome
protein complex oligomerization
出典:Amigo / QuickGO
オルソログ
ヒト マウス
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq
(mRNA)

NM_006558

NM_010158

RefSeq
(タンパク質)

NP_006549

NP_034288

場所
(UCSC)
n/a Chr : 68.8 – 68.97 Mb
PubMed検索 [2] [3]
ウィキデータ
閲覧/編集 ヒト 閲覧/編集 マウス

KHDRBS3(KH domain containing, RNA binding, signal transduction associated 3)またはT-STARは、ヒトではKHDRBS3遺伝子にコードされるタンパク質である[4][5][6]

相互作用

KHDRBS3はSIAH1英語版と相互作用することが示されている[7][8]

またKHDRBS3は前立腺がん細胞において、スプライシングタンパク質Sam68やがんタンパク質メタドヘリン英語版と相互作用している[9]

臨床的意義

KHDRBS3(T-STAR)は、前立腺がん組織で周囲の良性組織よりも発現が増加していることが示されている[9]。KHDRBS3の発現は、Likert scaleによって測定されるマルチパラメトリックMRI(mpMRI)シグナルと相関している。Likert scaleは、PI-RADS英語版と類似したシステムである[9]。いまだ議論はあるものの、mpMRIシグナルはグリソンスコアの高さや腫瘍サイズ、臨床的にアグレッシブな前立腺がんと関係した組織病理学的特徴と相関している[10][11]。KHDRBS3の発現は心不全患者の不全部位の心筋で増加しており、そこでKHDRBS3はACTG1英語版MYL2英語版RYR2英語版TNNI3英語版TNNT2TPM1英語版TPM2英語版TTNなど、サルコメア英語版の構成要素をコードするいくつかの重要なmRNAと相互作用している[12]

前立腺がん細胞株ではKHDRBS3はアンドロゲンによって調節されているようであり、合成アンドロゲンR1881英語版の投与後にmRNAの発現が低下する[9]

機能

KHDRBS3はサルコメアタンパク質であるチチンのmRNAの選択的スプライシングを調節しており、イントロンが保持される。iPS細胞由来心筋細胞におけるKHDRBS3の過剰発現はカルシウムトランジェントを増加させ、Fmaxの増加をもたらす[12]

出典

  1. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000022332 - Ensembl, May 2017
  2. ^ Human PubMed Reference:
  3. ^ Mouse PubMed Reference:
  4. ^ “T-STAR/ETOILE: a novel relative of SAM68 that interacts with an RNA-binding protein implicated in spermatogenesis”. Human Molecular Genetics 8 (6): 959–69. (June 1999). doi:10.1093/hmg/8.6.959. PMID 10332027. 
  5. ^ “Salpalpha and Salpbeta, growth-arresting homologs of Sam68”. Gene 240 (1): 133–47. (November 1999). doi:10.1016/S0378-1119(99)00421-7. PMID 10564820. 
  6. ^ Entrez Gene: KHDRBS3 KH domain containing, RNA binding, signal transduction associated 3”. 2023年7月1日閲覧。
  7. ^ “Towards a proteome-scale map of the human protein-protein interaction network”. Nature 437 (7062): 1173–8. (October 2005). Bibcode2005Natur.437.1173R. doi:10.1038/nature04209. PMID 16189514. 
  8. ^ “SIAH1 targets the alternative splicing factor T-STAR for degradation by the proteasome”. Human Molecular Genetics 13 (14): 1525–34. (July 2004). doi:10.1093/hmg/ddh165. PMID 15163637. 
  9. ^ a b c d “The Oncogene Metadherin Interacts with the Known Splicing Proteins YTHDC1, Sam68 and T-STAR and Plays a Novel Role in Alternative mRNA Splicing”. Cancers 11 (9): 1233. (August 2019). doi:10.3390/cancers11091233. PMC 6770463. PMID 31450747. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6770463/. 
  10. ^ “What Type of Prostate Cancer Is Systematically Overlooked by Multiparametric Magnetic Resonance Imaging? An Analysis from the PROMIS Cohort”. European Urology 78 (2): 163–170. (May 2020). doi:10.1016/j.eururo.2020.04.029. PMC 7397509. PMID 32370911. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7397509/. 
  11. ^ “Prostate cancer visibility on multiparametric magnetic resonance imaging: high Gleason grade and increased tumour volume are not the only important histopathological features”. BJU International 126 (2): 237–239. (April 2020). doi:10.1111/bju.15085. PMID 32319152. 
  12. ^ a b Boeckel, Jes-Niels; Möbius-Winkler, Maximilian; Müller, Marion; Rebs, Sabine; Eger, Nicole; Schoppe, Laura; Tappu, Rewati; Kokot, Karoline E. et al. (2021-07-15). “SLM2 Is A Novel Cardiac Splicing Factor Involved in Heart Failure due to Dilated Cardiomyopathy” (英語). Genomics, Proteomics & Bioinformatics 20 (1): 129–146. doi:10.1016/j.gpb.2021.01.006. ISSN 1672-0229. PMC 9510876. PMID 34273561. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC9510876/. 

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