【概要】 ウイルスが与えられた環境の元で複製に適応した状態にあることを「フィットネスが良い」と言う。抗HIV薬で治療を受けた患者では、体内にその薬剤が効いて抑えられたウイルスと、耐性になって抑えきれないウイルスが居る。薬があるという条件では耐性HIVの方がフィットネスが良い。さらに薬が与えられた状態では、副次的な変異が起こって増殖力も高まることがある。ウイルスとしては、さらにフィットネスが良くなったことになる。
【詳しく】 変異によってフィットネスが低下したらウイルスの産生量が低下する。例えばM184V(逆転写酵素の184番目のメチオニンがバリンに変わったもの)ではラミブジンに耐性でHIV RNA量が検出できながら、CD4数があまり低下しないという「共存共栄」の状態がみられることがある。同様なことはL74VとK65Rでもみられる。
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