BACコンティグの構築
出典: フリー百科事典『ウィキペディア（Wikipedia）』 (2020/05/13 15:55 UTC 版)
「コンティグ」の記事における「BACコンティグの構築」の解説
BACコンティグは、既知のオーバーラップのBAC領域をさまざまな方法で整列させることによって構築される。1つの一般的な戦略は、 シーケンスタグ付きサイト （STS）コンテンツマッピングを使用して、BAC間で共通の一意のDNAサイトを検出することである。オーバーラップの程度は、2つのクローン間で共通のSTSマーカーの数によって概算できる。共通するマーカーが多いほど、オーバーラップが大きくなる 。この戦略はオーバーラップの非常に大まかな見積もりしか提供しないため、クローンオーバーラップをより正確に測定するため、制限酵素処理による切断断片分析がよく使用される 。この戦略では、クローンを1種または2種の制限酵素で処理し、得られたフラグメントをゲル電気泳動で分離する。2つのクローンの場合、制限サイトが共通している可能性が高いため、いくつかのフラグメントを共有することが期待される 。共通のフラグメントの数とこれらのフラグメントの長さがわかるため、オーバーラップの程度を高い精度で推定できる。
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