D-アスパラギン酸リガーゼ

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D-アスパラギン酸リガーゼ

出典: フリー百科事典『ウィキペディア（Wikipedia）』 (2021/02/21 03:45 UTC 版)

D-アスパラギン酸リガーゼ
識別子
EC番号	6.3.1.12
データベース
IntEnz	IntEnz view
BRENDA	BRENDA entry
ExPASy	NiceZyme view
KEGG	KEGG entry
MetaCyc	metabolic pathway
PRIAM	profile
PDB構造	RCSB PDB PDBj PDBe PDBsum
検索 PMC articles PubMed articles NCBI proteins

D-アスパラギン酸リガーゼ(D-aspartate ligase)は、EC 6.3.1.12)は、以下の化学反応を触媒する酵素である。

ATP + D-アスパラギン酸 + [β-GlcNAc-(1->4)-Mur2Ac(oyl-L-Ala-γ-D-Glu-L-Lys-D-Ala-D- Ala)]n $\rightleftharpoons$[β-GlcNAc-(1->4)-Mur2Ac(oyl-L-Ala-γ-D-Glu-6-N-(β-D-Asp)-L- Lys-D-Ala-D-Ala)]n + ADP + リン酸

従って、基質はATP、D-アスパラギン酸、[β-GlcNAc-(1->4)-Mur2Ac(oyl-L-Ala-γ-D-Glu-L-Lys-D-Ala-D-、Ala)]nの4つ、生成物は[β-GlcNAc-(1->4)-Mur2Ac(oyl-L-Ala-γ-D-Glu-6-N-(β-D-Asp)-L-、Lys-D-Ala-D-Ala)]n、ADP、リン酸の4つである。

この酵素はリガーゼ、特に炭素-窒素結合を形成する酸-D-アンモニアリガーゼ（アミドシンターゼ）に分類される。系統名は、D-アスパラギン酸:[β-GlcNAc-(1->4)-Mur2Ac(oyl-L-Ala-γ-D-Glu-L-Lys-D -Ala-D-Ala)]n リガーゼ (ADP生成)(D-aspartate:[beta-GlcNAc-(1->4)-Mur2Ac(oyl-L-Ala-gamma-D-Glu-L-Lys-D -Ala-D-Ala)]n ligase (ADP-forming))である。

出典

• Staudenbauer W, Strominger JL (1972). “Activation of D-aspartic acid for incorporation into peptidoglycan”. J. Biol. Chem. 247 (16): 5095–102. PMID 4262567. 
• Staudenbauer W, Willoughby E, Strominger JL (1972). “Further studies of the D-aspartic acid-activating enzyme of Streptococcus faecalis and its attachment to the membrane”. J. Biol. Chem. 247 (17): 5289–96. PMID 4626717. 
• Galperin MY, Koonin EV (1997). “A diverse superfamily of enzymes with ATP-dependent carboxylate-amine/thiol ligase activity”. Protein. Sci. 6 (12): 2639–43. doi:10.1002/pro.5560061218. PMC: 2143612. PMID 9416615. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2143612/. 
• Heijenoort J, Legrand R, Brouard JP, Rice L, Mainardi JL (2006). “Aslfm, the D-aspartate ligase responsible for the addition of D-aspartic acid onto the peptidoglycan precursor of Enterococcus faecium”. J. Biol. Chem. 281 (17): 11586–94. doi:10.1074/jbc.M600114200. PMID 16510449.