置換行列とは? わかりやすく解説

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置換速度行列

同義/類義語:アミノ酸の置換行列, 置換行列, 置換速度
英訳・(英)同義/類義語:substitution rate matrix

タンパク質中の特定アミノ酸別のアミノ酸置換する確率速度)の表。BLOSUMやデイホフなど。

置換行列

出典: フリー百科事典『ウィキペディア(Wikipedia)』 (2023/01/15 01:36 UTC 版)

三文字の置換を記述する行列。
二つの置換行列のもまた置換行列である。

六種類それぞれの同じ型の行列が以下のような位置に存在している:

(これらもまた置換行列)

数学の特に行列論における置換行列(ちかんぎょうれつ、: permutation matrix)は、各行各列にちょうど一つだけ 1 の要素を持ち、それ以外は全て 0 となるような二値英語版正方行列を言う。そのような m-次正方行列の各々は、特定の m 文字の置換を表現するもので、右または左からの行列の積によって列または行の置換を引き起こす。

定義

m 文字の置換:


置換行列

出典: フリー百科事典『ウィキペディア(Wikipedia)』 (2022/05/17 07:55 UTC 版)

直交行列」の記事における「置換行列」の解説

2次正方行列において、1行目と2行目を置換させる置換行列は以下で表される。 ( 0 1 1 0 ) {\displaystyle {\begin{pmatrix}0&1\\1&0\end{pmatrix}}}

※この「置換行列」の解説は、「直交行列」の解説の一部です。
「置換行列」を含む「直交行列」の記事については、「直交行列」の概要を参照ください。


置換行列

出典: フリー百科事典『ウィキペディア(Wikipedia)』 (2021/02/24 14:42 UTC 版)

対称群」の記事における「置換行列」の解説

詳細は「置換行列」を参照 n-次の対称群ベクトル空間基底変換として作用させることで置換行列表示することができる。具体的に n-次元ベクトル空間 V とその基底 {e1, e2, …, en} をひとつ固定して置換 σ の V への作用を σ(ei) = eσ(i) (1 ≤ i ≤ n) によって定める。このとき σ の表現行列を Pσ とすると σ(e1, e2, …, en) = (eσ(1), eσ(2), …, eσ(n)) = (e1, e2, …, en)Pσ から、クロネッカーのデルタ δ を用いて Pσ = (δi,σ(j)) となる。この行列 Pσ を、置換 σ に対応する置換行列という。偶置換対応する置換行列の定め線型変換空間向き保ち一方で奇置換対応する線型変換空間向き反転させている。

※この「置換行列」の解説は、「対称群」の解説の一部です。
「置換行列」を含む「対称群」の記事については、「対称群」の概要を参照ください。

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