プログラムの歴史

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プログラムの歴史

出典: フリー百科事典『ウィキペディア（Wikipedia）』 (2021/01/26 10:10 UTC 版)

「OpenMM」の記事における「プログラムの歴史」の解説

プログラムの最初のバージョンであるプレビューリリース1は2008年9月にリリースされ、最初の安定版である1.0は2010年1月にリリースされ、すでにOpenCLとCUDA GPU言語のサポートが含まれている。最終公開バージョンは2020年5月の7.4.2である。

プログラムの歴史

出典: フリー百科事典『ウィキペディア（Wikipedia）』 (2019/10/09 15:40 UTC 版)

「CHARMM」の記事における「プログラムの歴史」の解説

1969年頃、小分子のためのポテンシャルエネルギー関数の開発に大きな関心が持たれていた。CHARMMはハーバード大学のマーティン・カープラスのグループに起源がある。カープラスと彼の当時の大学院生Bruce Gelinは任意のアミノ酸配列と一連の座標（例えばX線構造から）を扱うことができ、この情報を原子の位置の関数としての系のエネルギーを計算するために使うことを可能とするプログラムの開発の機が熟したと判断した。カープラスは ワイツマン科学研究所のSchneior Lifsonのグループ、特にハーバード大学にポスドクとして赴き、自身のconsistent force field（CFF）プログラムをもたらしたアリー・ウォーシェル コーネル大学のHarold Scheragaのグループ タンパク質についてのマイケル・レヴィットの先駆的なエネルギー計算 を含むCHARMMプログラムの開発における主要なアイデアの提供の重要性を認めている。 1980年代、最終的に論文が発表され、CHARMMが公開された。その時までにはGelinのプログラムは大幅に再構築されていた。発表のため、Bob BruccoleriはHARMM（HARvard Macromolecular Mechanics）という名称を思い付いたが、これは適切ではないように見えた。そこで、彼らは先頭に化学（Chemistry）のCを加えた。 2016年現在の最新版はc40b2（2015年）である。