ウイルスを対象としたメタゲノム解析とは? わかりやすく解説

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ウイルスを対象としたメタゲノム解析(Virome)

出典: フリー百科事典『ウィキペディア(Wikipedia)』 (2022/05/18 15:26 UTC 版)

メタゲノミクス」の記事における「ウイルスを対象としたメタゲノム解析(Virome)」の解説

詳細は「ウイルスのメタゲノミクス英語版)」を参照 メタゲノム解析バクテリアアーキアといった原微生物ターゲットになることが多いが、ウイルス(特にDNA2本鎖ウイルス)に対して応用することができる。ウイルスには系統間で共通の普遍的なマーカー遺伝子例え細菌古細菌における16S RNAや、真核生物における18S RNAなど)がないため、PCR介した系統解析難しい。そのため、環境サンプルからウイルスコミュニティの遺伝的多様性アクセスする方法として、ウイルスターゲットとしたメタゲノム解析有力な方法となっている。このようなウイルスのメタゲノム解析はVirome(日本語ではビローム、ウイローム、ヴァイローム、などと発音される)と呼ばれウイルスの多様性進化に関して有力な解析手段となっている。たとえば、Giant Virus Finder呼ばれる解析パイプラインでは、塩性砂漠南極巨大ウイルス英語版)が存在する最初証拠示した

※この「ウイルスを対象としたメタゲノム解析(Virome)」の解説は、「メタゲノミクス」の解説の一部です。
「ウイルスを対象としたメタゲノム解析(Virome)」を含む「メタゲノミクス」の記事については、「メタゲノミクス」の概要を参照ください。

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