系統解析とは? わかりやすく解説

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系統学

(系統解析 から転送)

出典: フリー百科事典『ウィキペディア(Wikipedia)』 (2024/01/31 14:09 UTC 版)

系統学(けいとうがく、英語:phylogenetics)とは、生物の系統的な発生、つまり生物の進化による系統分化の歴史を研究する学問。種や系統群の分化と進化を研究目的とする。





系統解析

出典: フリー百科事典『ウィキペディア(Wikipedia)』 (2022/03/24 15:33 UTC 版)

二胚動物」の記事における「系統解析」の解説

1960年代には核酸研究進展し核酸塩基総量対すグアニンシトシン合計量(GC含量)は同種の生物では一定で、近縁の生物ではよく似ていることが知られるようになった1974年LapanとMorowitzはDicyemennea 属ニハイチュウGC含量比較による系統解析を行ったところ、ニハイチュウGC含量23%で、それまで知られていた他の生物GC含量原生動物である繊毛虫類の22-35%、鞭毛虫類の45-60%、縮小条虫 Hymenolepis diminuta (Rudolphi, 1819)では36%、タコ肝臓寄生する四吻目の条虫では47%であったため、繊毛虫類との類縁性を示唆したまた、1987年には、堀寛大澤省三による5SrRNA塩基配列比較による系統解析が行われ、もっとも原始的な多細胞動物とされ、前者の説を支持した。しかしこれらの手法は今日では系統解析に適さない考えられており、逆に1995年片山らによる18SrDNAに基づく研究では扁形動物一員位置付けられ1999年小林らによるHox遺伝子分子系統学解析ではニハイチュウ三胚葉動物の、特に螺旋卵割動物であると示された。2017年Luらによる解析では、直泳動物門姉妹群であることが示された。この2門はMesozoa呼ばれるクレード構成し、このクレード吸啜動物腹毛動物門+扁形動物門)の姉妹群もしくは側系統腹毛動物門から分岐していることが示唆された。一方で2018年のSchifferらによる解析では、直泳動物門環形動物門一部であり、二胚動物門姉妹群ではないことが示唆され、謎は深まるばかりである。

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系統解析

出典: フリー百科事典『ウィキペディア(Wikipedia)』 (2021/09/04 04:20 UTC 版)

アベリサウルス科」の記事における「系統解析」の解説

以下のクラドグラム2014年トルトーサらによるものである。 .mw-parser-output table.clade{border-spacing:0;margin:0;font-size:100%;line-height:100%;border-collapse:separate;width:auto}.mw-parser-output table.clade table.clade{width:100%}.mw-parser-output table.clade td.clade-label{width:0.7em;padding:0 0.15em;vertical-align:bottom;text-align:center;border-left:1px solid;border-bottom:1px solid;white-space:nowrap}.mw-parser-output table.clade td.clade-fixed-width{overflow:hidden;text-overflow:ellipsis}.mw-parser-output table.clade td.clade-fixed-width:hover{overflow:visible}.mw-parser-output table.clade td.clade-label.first{border-left:none;border-right:none}.mw-parser-output table.clade td.clade-label.reverse{border-left:none;border-right:1px solid}.mw-parser-output table.clade td.clade-slabel{padding:0 0.15em;vertical-align:top;text-align:center;border-left:1px solid;white-space:nowrap}.mw-parser-output table.clade td.clade-slabel:hover{overflow:visible}.mw-parser-output table.clade td.clade-slabel.last{border-left:none;border-right:none}.mw-parser-output table.clade td.clade-slabel.reverse{border-left:none;border-right:1px solid}.mw-parser-output table.clade td.clade-bar{vertical-align:middle;text-align:left;padding:0 0.5em;position:relative}.mw-parser-output table.clade td.clade-bar.reverse{text-align:right;position:relative}.mw-parser-output table.clade td.clade-leaf{border:0;padding:0;text-align:left}.mw-parser-output table.clade td.clade-leafR{border:0;padding:0;text-align:right}.mw-parser-output table.clade td.clade-leaf.reverse{text-align:right}.mw-parser-output table.clade:hover span.linkA{background-color:yellow}.mw-parser-output table.clade:hover span.linkB{background-color:green}アベリサウルス科クリプトプス     ルゴプス     ゲヌサウルス     MCF-PVPH-237 アベリサウルス類     ゼノタルソサウルス     タラスコサウルス     ラ・ボウンカルデのアベリサウルス類(La Boucharde abelisaurid)   マジュンガサウルス亜科   プシューのアベリサウルス類(Pourcieux abelisaurid)     アルコヴェナトル     マジュンガサウルス     インドサウルス     ラヒオリサウルス     ラジャサウルス     ブラキロストラ   イロケレシア     エクリクシナトサウルス     スコルピオヴェナトルカルノタウルス亜科アベリサウルス     アウカサウルス     ピクノネモサウルス     キルメサウルス     カルノタウルス                 イロケレシアは元々アベリサウルス上科姉妹群として記載されていた。ただし、セレノは暫定的にノアサウルス類よりもアベリサウルスに近い位置配置した。この結果は他のいくつかの分析とも合致する。したがって、ステムベースの定義が使用される場合イロケレシアおよびルゴプス基盤的アベリサウルス類である。ただし、アベリサウルスよりも基盤的であるため、ノードベースの定義が採用されている場合、それらはアベリサウルス科の外に位置付けられる。エクリクシナトサウルスも2004年報告されたため、セレノの分析には含まれていなかった。しかし、ホルヘ・カルボらによって行われた独立した分析は、エクリクシナトサウルスがアベリサウルス類であることを示している。 何人かの科学者アルゼンチンゼノタルソサウルスインドコンプソスクス基盤的アベリサウルス類含める。しかし他の研究者は、それらはアベリサウルス上科外部位置付けている。フランスのゲヌサウルスとタラスコサウルスもまたアベリサウルス類と言われるが、 どちらも断片的であり恐らく基盤的ケラトサウリアであると思われる2008年スコルピオヴェナトル記載伴って南米のアベリサウルスル類にフォーカスした別の系統解析が発表された。その結果イロケレシアを含む全ての南米アベリサウルス類(アベリサウルスを除く)がカルノタウルス亜科のサブクレードとしてグループ化され、ブラキロストラと名付けられた。同年サンプソンらは新しく広範なケラトサウリアの系統解析を発表した。エオアベリサウルスの説明で、これらの分析組み合わせて10個の新し特徴追加された。以下のクラドグラムその分析に基づく。 ケラトサウリア   ベルベロサウルス     デルタドロメウス         スピノストロフェウス       リムサウルス     エラフロサウルス       ネオケラトサウリア ケラトサウルス科   ケラトサウルス     ゲニオデクテス     アベリサウルス上科 ノアサウルス科   ラエヴィスクス     マシアカサウルス     ノアサウルス     ヴェロキサウルス     アベリサウルス科   エオアベリサウルス       ルゴプス       アベリサウルスカルノタウルス亜科     マジュンガサウルス     インドサウルス     ラジャサウルス     ブラキロストラ     イロケレシア     エクリクシナトサウルス     スコルピオヴェナトル     カルノタウルス族   カルノタウルス     アウカサウルス                       Timeline of descriptions of genera

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系統解析

出典: フリー百科事典『ウィキペディア(Wikipedia)』 (2017/07/16 01:28 UTC 版)

シトクロムb」の記事における「系統解析」の解説

真核生物シトクロムb遺伝子ミトコンドリアDNAコードされており、その配列差異利用して生物間の系統解析を行うことができる。科や属の内部での系統関係求めるのに有効だ考えられている。

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系統解析

出典: フリー百科事典『ウィキペディア(Wikipedia)』 (2021/08/13 06:23 UTC 版)

アカイナケファルス」の記事における「系統解析」の解説

系統解析によってアカイナケファルスララミディアアンキロサウルス類ノドケファロサウルス単系統を成すことがわかった。また分岐分析ら、アカイナケファルスノドケファロサウルスエウオプロケファルスアンキロサウルスのような北方系のアンキロサウルス類よりも、サイカニアタルキアのようなアジアアンキロサウルス類との近縁性が高いことも明らかになった。この発見は、北部と南部ララミディア大陸アンキロサウルス類個体群の間に地方性が存在していたことを示している。さらにアカイナケファルス発見は、海面低下によってベーリング陸橋を介経して大陸間の移動可能になったアジア北米の間で、少なくとも2つ動物相遷移があったことを示している。

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系統解析

出典: フリー百科事典『ウィキペディア(Wikipedia)』 (2022/05/02 03:07 UTC 版)

エウトレタウラノスクス」の記事における「系統解析」の解説

E. delfsi はエウトレタウラノスクス属で唯一認められている種である。ゴニオフォリス科他の属には、アンフィコティルスゴニオフォリススノスクス、カルソヤスクス(英語版)がいる。 エウトレタウラノスクス正確な系統的位置曖昧なまであるSmith et al., 2010 の系統解析では、エウトレタウラノスクスとカルソヤスクスとスノスクス近縁である証拠提示された。しかし、多く論文エウトレタウラノスクスゴニオフォリス科内に位置付けることを支持する一方でゴニオフォリススノスクスのどちらにより近縁なのかという点については議論がある。これとは別に、J.R. Foster, 2006 では、エウトレタウラノスクスはフォリドサウルス(英語版)やディロサウルス科(英語版)と最も近縁であるとされ、ゴニオフォリスベルニサルティア正鰐類を含むより包括的な系統群属するとされた。 三畳紀末の大量絶滅事変関連する進化史再評価する研究もある。当該研究では、ゴニオフォリス科ワニ形類である Calsoyasuchus valliceps が基盤的系統的位置に就いていることから、ワニ形上目基底となる数多くのゴーストリネージが存在するはずであると結論付けられている。 以下は、Marco Brandalise de Andrade et al., 2011 に基づくクラドグラム新鰐類 アトポサウルス科(英語版)   Theriosuchus pusillus     Theriosuchus guimarotae           Rugosuchus       Bernissartia     正鰐類           Stolokrosuchus         テティスクス亜目英語版)     タラットスクス亜目     ゴニオフォリス科   Calsoyasuchus valliceps         "Goniopholis" phuwiangensis       Eutretauranosuchus delfi     "Sunosuchus" junggarensis         Sunosuchus miaoi     Chalawan thailandicus           Siamosuchus phuphokensis       Amphicotylus lucasii       Denazinosuchus kirtlandicus     Nannosuchus gracilidens         Hulkepholis willetti       Anteophthalmosuchus     Dollo’s goniopholidid       ゴニオフォリス属   Goniopholis baryglyphaeus       Goniopholis kiplingi     Goniopholis simus                          

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系統解析

出典: フリー百科事典『ウィキペディア(Wikipedia)』 (2020/04/15 02:53 UTC 版)

Clustal」の記事における「系統解析」の解説

多重整列を行う目的1つ分子系統解析があるが、Clustalで系統解析を行うことも可能である。ただし近隣結合法用いたきわめてシンプルな解析限られる多重整列の際に作成される樹形図 (.dnd) は系統樹ではないことに注意が必要である。

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