系統解析
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系統学
系統解析
出典: フリー百科事典『ウィキペディア(Wikipedia)』 (2022/03/24 15:33 UTC 版)
1960年代には核酸研究が進展し、核酸の塩基総量に対するグアニンとシトシンの合計量(GC含量)は同種の生物では一定で、近縁の生物ではよく似ていることが知られるようになった。1974年にLapanとMorowitzはDicyemennea 属ニハイチュウのGC含量の比較による系統解析を行ったところ、ニハイチュウのGC含量は23%で、それまで知られていた他の生物のGC含量は原生動物である繊毛虫類の22-35%、鞭毛虫類の45-60%、縮小条虫 Hymenolepis diminuta (Rudolphi, 1819)では36%、タコの肝臓に寄生する四吻目の条虫では47%であったため、繊毛虫類との類縁性を示唆した。また、1987年には、堀寛と大澤省三による5SrRNAの塩基配列の比較による系統解析が行われ、もっとも原始的な多細胞動物とされ、前者の説を支持した。しかしこれらの手法は今日では系統解析に適さないと考えられており、逆に1995年の片山らによる18SrDNAに基づく研究では扁形動物の一員に位置付けられ、1999年の小林らによるHox遺伝子の分子系統学的解析ではニハイチュウは三胚葉動物の、特に螺旋卵割動物であると示された。2017年のLuらによる解析では、直泳動物門の姉妹群であることが示された。この2門はMesozoaと呼ばれるクレードを構成し、このクレードは吸啜動物(腹毛動物門+扁形動物門)の姉妹群、もしくは側系統の腹毛動物門から分岐していることが示唆された。一方で、2018年のSchifferらによる解析では、直泳動物門は環形動物門の一部であり、二胚動物門の姉妹群ではないことが示唆され、謎は深まるばかりである。
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系統解析
出典: フリー百科事典『ウィキペディア(Wikipedia)』 (2021/09/04 04:20 UTC 版)
以下のクラドグラムは2014年のトルトーサらによるものである。 .mw-parser-output table.clade{border-spacing:0;margin:0;font-size:100%;line-height:100%;border-collapse:separate;width:auto}.mw-parser-output table.clade table.clade{width:100%}.mw-parser-output table.clade td.clade-label{width:0.7em;padding:0 0.15em;vertical-align:bottom;text-align:center;border-left:1px solid;border-bottom:1px solid;white-space:nowrap}.mw-parser-output table.clade td.clade-fixed-width{overflow:hidden;text-overflow:ellipsis}.mw-parser-output table.clade td.clade-fixed-width:hover{overflow:visible}.mw-parser-output table.clade td.clade-label.first{border-left:none;border-right:none}.mw-parser-output table.clade td.clade-label.reverse{border-left:none;border-right:1px solid}.mw-parser-output table.clade td.clade-slabel{padding:0 0.15em;vertical-align:top;text-align:center;border-left:1px solid;white-space:nowrap}.mw-parser-output table.clade td.clade-slabel:hover{overflow:visible}.mw-parser-output table.clade td.clade-slabel.last{border-left:none;border-right:none}.mw-parser-output table.clade td.clade-slabel.reverse{border-left:none;border-right:1px solid}.mw-parser-output table.clade td.clade-bar{vertical-align:middle;text-align:left;padding:0 0.5em;position:relative}.mw-parser-output table.clade td.clade-bar.reverse{text-align:right;position:relative}.mw-parser-output table.clade td.clade-leaf{border:0;padding:0;text-align:left}.mw-parser-output table.clade td.clade-leafR{border:0;padding:0;text-align:right}.mw-parser-output table.clade td.clade-leaf.reverse{text-align:right}.mw-parser-output table.clade:hover span.linkA{background-color:yellow}.mw-parser-output table.clade:hover span.linkB{background-color:green}アベリサウルス科 クリプトプス ルゴプス ゲヌサウルス MCF-PVPH-237 アベリサウルス類 ゼノタルソサウルス タラスコサウルス ラ・ボウンカルデのアベリサウルス類(La Boucharde abelisaurid) マジュンガサウルス亜科 プシューのアベリサウルス類(Pourcieux abelisaurid) アルコヴェナトル マジュンガサウルス インドサウルス ラヒオリサウルス ラジャサウルス ブラキロストラ イロケレシア エクリクシナトサウルス スコルピオヴェナトル カルノタウルス亜科 アベリサウルス アウカサウルス ピクノネモサウルス キルメサウルス カルノタウルス イロケレシアは元々アベリサウルス上科の姉妹群として記載されていた。ただし、セレノは暫定的にノアサウルス類よりもアベリサウルスに近い位置に配置した。この結果は他のいくつかの分析とも合致する。したがって、ステムベースの定義が使用される場合、イロケレシアおよびルゴプスは基盤的アベリサウルス類である。ただし、アベリサウルスよりも基盤的であるため、ノードベースの定義が採用されている場合、それらはアベリサウルス科の外に位置付けられる。エクリクシナトサウルスも2004年に報告されたため、セレノの分析には含まれていなかった。しかし、ホルヘ・カルボらによって行われた独立した分析は、エクリクシナトサウルスがアベリサウルス類であることを示している。 何人かの科学者はアルゼンチンのゼノタルソサウルスとインドのコンプソスクスを基盤的アベリサウルス類に含める。しかし他の研究者は、それらはアベリサウルス上科の外部に位置付けている。フランスのゲヌサウルスとタラスコサウルスもまたアベリサウルス類と言われるが、 どちらも断片的であり恐らく基盤的ケラトサウリアであると思われる。 2008年のスコルピオヴェナトルの記載に伴って、南米のアベリサウルスル類にフォーカスした別の系統解析が発表された。その結果、イロケレシアを含む全ての南米のアベリサウルス類(アベリサウルスを除く)がカルノタウルス亜科のサブクレードとしてグループ化され、ブラキロストラと名付けられた。同年、サンプソンらは新しく広範なケラトサウリアの系統解析を発表した。エオアベリサウルスの説明で、これらの分析を組み合わせて、10個の新しい特徴を追加された。以下のクラドグラムはその分析に基づく。 ケラトサウリア ベルベロサウルス デルタドロメウス スピノストロフェウス リムサウルス エラフロサウルス ネオケラトサウリア ケラトサウルス科 ケラトサウルス ゲニオデクテス アベリサウルス上科 ノアサウルス科 ラエヴィスクス マシアカサウルス ノアサウルス ヴェロキサウルス アベリサウルス科 エオアベリサウルス ルゴプス アベリサウルス カルノタウルス亜科 マジュンガサウルス インドサウルス ラジャサウルス ブラキロストラ イロケレシア エクリクシナトサウルス スコルピオヴェナトル カルノタウルス族 カルノタウルス アウカサウルス Timeline of descriptions of genera
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出典: フリー百科事典『ウィキペディア(Wikipedia)』 (2017/07/16 01:28 UTC 版)
真核生物のシトクロムb遺伝子はミトコンドリアDNAにコードされており、その配列の差異を利用して生物間の系統解析を行うことができる。科や属の内部での系統関係を求めるのに有効だと考えられている。
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出典: フリー百科事典『ウィキペディア(Wikipedia)』 (2021/08/13 06:23 UTC 版)
系統解析によってアカイナケファルスはララミディアのアンキロサウルス類ノドケファロサウルスと単系統を成すことがわかった。また分岐分析ら、アカイナケファルスとノドケファロサウルスはエウオプロケファルスやアンキロサウルスのような北方系のアンキロサウルス類よりも、サイカニアやタルキアのようなアジアのアンキロサウルス類との近縁性が高いことも明らかになった。この発見は、北部と南部のララミディア大陸のアンキロサウルス類の個体群の間に地方性が存在していたことを示している。さらにアカイナケファルスの発見は、海面低下によってベーリング陸橋を介経して大陸間の移動が可能になったアジアと北米の間で、少なくとも2つの動物相の遷移があったことを示している。
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出典: フリー百科事典『ウィキペディア(Wikipedia)』 (2022/05/02 03:07 UTC 版)
「エウトレタウラノスクス」の記事における「系統解析」の解説
E. delfsi はエウトレタウラノスクス属で唯一認められている種である。ゴニオフォリス科の他の属には、アンフィコティルス、ゴニオフォリス、スノスクス、カルソヤスクス(英語版)がいる。 エウトレタウラノスクスの正確な系統的位置は曖昧なままである。Smith et al., 2010 の系統解析では、エウトレタウラノスクスとカルソヤスクスとスノスクスが近縁である証拠が提示された。しかし、多くの論文がエウトレタウラノスクスをゴニオフォリス科内に位置付けることを支持する一方で、ゴニオフォリスとスノスクスのどちらにより近縁なのかという点については議論がある。これとは別に、J.R. Foster, 2006 では、エウトレタウラノスクスはフォリドサウルス(英語版)やディロサウルス科(英語版)と最も近縁であるとされ、ゴニオフォリスやベルニサルティアや正鰐類を含むより包括的な系統群に属するとされた。 三畳紀末の大量絶滅事変と関連する進化史を再評価する研究もある。当該の研究では、ゴニオフォリス科のワニ形類である Calsoyasuchus valliceps が基盤的な系統的位置に就いていることから、ワニ形上目の基底となる数多くのゴーストリネージが存在するはずであると結論付けられている。 以下は、Marco Brandalise de Andrade et al., 2011 に基づくクラドグラム。 新鰐類 アトポサウルス科(英語版) Theriosuchus pusillus Theriosuchus guimarotae Rugosuchus Bernissartia 正鰐類 Stolokrosuchus テティスクス亜目(英語版) タラットスクス亜目 ゴニオフォリス科 Calsoyasuchus valliceps "Goniopholis" phuwiangensis Eutretauranosuchus delfi "Sunosuchus" junggarensis Sunosuchus miaoi Chalawan thailandicus Siamosuchus phuphokensis Amphicotylus lucasii Denazinosuchus kirtlandicus Nannosuchus gracilidens Hulkepholis willetti Anteophthalmosuchus Dollo’s goniopholidid ゴニオフォリス属 Goniopholis baryglyphaeus Goniopholis kiplingi Goniopholis simus
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出典: フリー百科事典『ウィキペディア(Wikipedia)』 (2020/04/15 02:53 UTC 版)
多重整列を行う目的の1つに分子系統解析があるが、Clustalで系統解析を行うことも可能である。ただし近隣結合法を用いたきわめてシンプルな解析に限られる。多重整列の際に作成される樹形図 (.dnd) は系統樹ではないことに注意が必要である。
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