アンブレラサンプリング法
出典: フリー百科事典『ウィキペディア(Wikipedia)』 (2024/02/13 06:20 UTC 版)
アンブレラサンプリング法(アンブレラサンプリングほう 英: Umbrella sampling、傘サンプリングとも[1])は、計算物理学および計算化学の手法の一つであり、エネルギー地形の形状によってエルゴード性が妨げられる系のサンプリングを改善するために用いられる。1977年に、TorrieおよびValleauによって初めて提案された[2]。アンブレラサンプリング法は統計学においてより一般的な重点サンプリング法の特別な物理学的応用である。
- ^ 政宏, 清水、祐幸, 岡本「レプリカ交換傘サンプリング法による陽溶媒中のモルテングロビュール状態球状タンパク質の構造探索」『日本物理学会講演概要集』第73.1巻第0号、2018年、3136–3136頁、doi:10.11316/jpsgaiyo.73.1.0_3136。
- ^ Torrie, G. M.; Valleau, J. P. (1977). “Nonphysical sampling distributions in Monte Carlo free-energy estimation: Umbrella sampling”. J. Comput. Phys. 23 (2): 187-199. doi:10.1016/0021-9991(77)90121-8.
- ^ Kumar, Shankar; Rosenberg, John M.; Bouzida, Djamal; Swendsen, Robert H.; Kollman, Peter A. (30 September 1992). “THE weighted histogram analysis method for free-energy calculations on biomolecules. I. The method”. Journal of Computational Chemistry 13 (8): 1011–1021. doi:10.1002/jcc.540130812.
- ^ Bartels, C (7 December 2000). “Analyzing biased Monte Carlo and molecular dynamics simulations”. Chemical Physics Letters 331 (5-6): 446–454. Bibcode: 2000CPL...331..446B. doi:10.1016/S0009-2614(00)01215-X.
- 1 アンブレラサンプリング法とは
- 2 アンブレラサンプリング法の概要
- 3 関連項目
- アンブレラサンプリング法のページへのリンク