GRIN (データベース)とは？わかりやすく解説

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GRINは、米農務省の管轄下の植物データベースのひとつ。「Germplasm Resources Information Network」の頭文字の略。「遺伝資源情報網」^[1]や「生殖質資源インフォーメーションネットワーク」などと意訳されている。

その情報はオンライン公開されており、作物など利用価値のある植物^[2]も野生種を含め、約1万種^[3]、全500,000 アクセション件数（別個の品種数）^[4]について、その分類学的情報（学名）や一般名をデータ化する^[2]。さらに外来種や地域外来種でとくに「有害雑草（noxious weed）」の指定を受けたものや^[2]、希少または絶滅危惧種^[2]にも触れる。各種が自生する生息地の情報（世界分布）も充実しており^[2]、輸出入や入管手続的な「パスポート情報」も記載する^[5]。 GRIN の一部に経済利用植物データベースがある^[2]。

対象品種は、米農務省の機構 National Plant Germplasm System (NPGS) において「ジャームプラズム（遺伝資源）」（種子やその他部位）の採集・保管がおこなっている品種である^[6]。

GRIN は、本来の植物のみから、昆虫など無脊椎動物、細菌、動物一般の遺伝資源のデータ管理へとその役割を拡張させている（#子プロジェクトを参照）^[7]。

情報網の管理の作業は、GRIN/データベース管理班(GRIN/DBMU)が担当する^[7]。米メリーランド州のベルツビル（英語版）に拠をおく米国立生殖質資源研究所（英語版）の監督下に現在はおかれている（1990年まではその前身であるGermplasm Services Laboratory (GSL) 監督下であった）^[7]^[8]。

子プロジェクト

GRIN は、以下プロジェクトへの技術支援をおこなっている^[9]：

en:National Plant Germplasm System (NPGS)
en:National Animal Germplasm Program (NAGP)
National Microbial Germplasm Program (NMGP)
National Invertebrate Germplasm Program (NIGP)

出典

^ Volk, Gayle M.; Richards, Christopher M. (2008年11月). “Availability of Genotypic Data for USDA-ARS National Plant Germplasm System Accessions Using the Genetic Resources Information Network (GRIN) Database” (J-Global). HorScience 43: 1365-1366. (和文タイトル：遺伝資源情報網（ＧＲＩＮ）データベースを用いたＵＳＤＡ‐ＡＲＳ全国植物生殖質システムのアクセッションのための遺伝子型データの利用性)
^ ^a ^b ^c ^d ^e ^f Lipscomb, Barney L.; Pipoly, John James; Sanders, Roger William (2000). Floristics in the New Millennium: Proceedings of the Flora of the Southeast US Symposium. 18. BRIT Press. ISBN 9781889878041. , p.90
^ Miller, William; Pellen, Rita M. (2006). Evolving Internet Reference Resources. 1. Psychology Press,. ISBN 9780789030252. , p.386 （ただし450,000アクセション件数とあり、情報が古い)
^ “Accession Area Queries”. Germplasm Resources Information Network. 2012年6月閲覧。, gives 500,000 accessions
^ Ullrich, Steven E. (2011). Barley: Production, Improvement, and Uses. NJohn Wiley & Sons. ISBN 9780813801230. , p.149
^ National Research Council (U.S.); Committee on Managing Global Genetic Resources: Agricultural Imperatives (1991). The U.S. National Plant Germplasm System. National Academies Press. ISBN 9780309043908. , p.139-
^ ^a ^b ^c “About us”. Agricultural Resource Service (11/05/2009). 2012年6月閲覧。
^ National Research Council (U.S.).; Committee on Managing Global Genetic Resources: Agricultural Imperatives (1991). The U.S. National Plant Germplasm System. National Academies Press. ISBN 9780309043908. , p.6, 96
^ “About GRIN”. Germplasm Resources Information Network. 2012年6月閲覧。

外部サイト

Germplasm Resources Information Network 政府系サイト

[1] Volk, Gayle M.; Richards, Christopher M. (2008年11月). “Availability of Genotypic Data for USDA-ARS National Plant Germplasm System Accessions Using the Genetic Resources Information Network (GRIN) Database” (J-Global). HorScience 43: 1365-1366. (和文タイトル：遺伝資源情報網（ＧＲＩＮ）データベースを用いたＵＳＤＡ‐ＡＲＳ全国植物生殖質システムのアクセッションのための遺伝子型データの利用性)

[floristic-2] ^ ^a ^b ^c ^d ^e ^f Lipscomb, Barney L.; Pipoly, John James; Sanders, Roger William (2000). Floristics in the New Millennium: Proceedings of the Flora of the Southeast US Symposium. 18. BRIT Press. ISBN 9781889878041. , p.90

[evolving-3] Miller, William; Pellen, Rita M. (2006). Evolving Internet Reference Resources. 1. Psychology Press,. ISBN 9780789030252. , p.386 （ただし450,000アクセション件数とあり、情報が古い)

[4] “Accession Area Queries”. Germplasm Resources Information Network. 2012年6月閲覧。, gives 500,000 accessions

[barley-5] Ullrich, Steven E. (2011). Barley: Production, Improvement, and Uses. NJohn Wiley & Sons. ISBN 9780813801230. , p.149

[usnpgs-6] National Research Council (U.S.); Committee on Managing Global Genetic Resources: Agricultural Imperatives (1991). The U.S. National Plant Germplasm System. National Academies Press. ISBN 9780309043908. , p.139-

[ars-aboutus-7] “About us”. Agricultural Resource Service (11/05/2009). 2012年6月閲覧。

[8] National Research Council (U.S.).; Committee on Managing Global Genetic Resources: Agricultural Imperatives (1991). The U.S. National Plant Germplasm System. National Academies Press. ISBN 9780309043908. , p.6, 96

[9] “About GRIN”. Germplasm Resources Information Network. 2012年6月閲覧。

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GRIN (データベース)とは？わかりやすく解説