遺伝子発現解析
出典: フリー百科事典『ウィキペディア（Wikipedia）』 (2022/06/03 05:29 UTC 版)
「バイオインフォマティクス」の記事における「遺伝子発現解析」の解説
多くの場合、遺伝子の発現はマイクロアレイ、発現cDNAシーケンスタグ（expressed cDNA sequence tag; EST）シーケンス、遺伝子発現連続分析（serial analysis of gene expression; SAGE）タグシーケンス、超並列シグネチャシーケンス （massively parallel signature sequencing; MPSS）、RNA-Seq（またはWhole Transcriptome Shotgun Sequencing; WTSS）、マルチプレックスin-situハイブリダイゼーション、などの手法でmRNAレベルを測定することで決定する。これらの手法はすべて、ノイズが非常に発生しやすく、生物学的な測定バイアスがかかってくるため、ハイスループットの遺伝子発現研究においてこのようなノイズを除去して信頼できる信号を分離する統計ツールの開発が計算生物学の研究分野で重要になっている。このような遺伝子発現研究は、疾患に関与する遺伝子を特定するためによく使用される。例えば癌性上皮細胞のマイクロアレイデータを非癌性細胞のデータと比較して、特定の癌細胞集団で発現上昇あるいは発現抑制される転写産物を決定することができる。
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