スレッディング (タンパク質) スレッディング (タンパク質)の概要

スレッディング (タンパク質)

出典: フリー百科事典『ウィキペディア(Wikipedia)』 (2024/04/07 21:12 UTC 版)

予測は、ターゲット配列の各アミノ酸をテンプレート構造内の位置に「スレッド化」し(つまり、配置、整列)、ターゲットがテンプレートにどの程度適合するかを評価することで行われる。最適なテンプレートが選択された後、選択されたテンプレートとのアライメント(整列)に基づいて、配列の構造モデルが構築される。タンパク質スレッディングは、「自然界に存在するさまざまなフォールドの数はかなり少ない(約1300)」ということと、「過去3年間にPDBに提出された新規構造の90%は、すでにPDBに登録されている構造と類似したフォールドを持つ」という2つの基本的な観察に基づいている。


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