pmemd (Particle Mesh Ewald Molecular Dynamics)
出典: フリー百科事典『ウィキペディア（Wikipedia）』 (2021/09/02 00:44 UTC 版)
「AMBER (分子動力学)」の記事における「pmemd (Particle Mesh Ewald Molecular Dynamics)」の解説
Bob Dukeによるsanderのより機能を限定した再実装である。並列処理を念頭に置いて設計されており、8から16個よりも多いプロセッサで動作させた時は、sanderよりも優れたパフォーマンスを示す。
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