フランキア属
出典: フリー百科事典『ウィキペディア(Wikipedia)』 (2023/06/18 02:28 UTC 版)
分類
フランキアは放線菌門に属する高GC含量のグラム陽性細菌である。Frankiaという属名は、非マメ科植物の根粒中に見出された共生菌に対して、1886年Brunchorstにより提唱された[4]。この属名は、彼の師であるスイスの微生物学者A. B. Frankに由来する。その後、Beckingが1970年にFrankiaceae科の代表属として記載したことをきっかけに、Frankiaの属名は広く定着した[5]。同時に彼は根粒破砕液を用いた接種試験により決定した宿主範囲にもとづいて、Frankia属のメンバーとして10の種を提案した。しかし、現在ではFrankia alni以外の種名はほとんど用いられることはない。再接種しても単離元の植物を含むどの植物とも共生しないケースや、単離元以外の植物としか共生しないケース、例外的な宿主範囲を示すケース等があり、宿主範囲による種の命名が混乱を招くことがその理由だ。このため「Frankia sp. 株名」 の形式で記載されることがほとんどだ。これまで株名のつけ方の規則がいくつか提唱されたが、広く定着したものはない。単離元の植物の種名や属名、単離地などの頭文字や単離された順番を適当に組み合わせることにより、単離者が任意に命名していることが多い。ただし、上記の理由で株名が宿主植物に対応しないケースがあることは注意する必要がある(例えば、PtI株はPurshinia tridentateから単離されたが、この植物を含めテストしたどの植物とも共生しなかった)。
Frankia属はFrankiaceae科に含まれる唯一の属であり、16S rRNA遺伝子の系統解析ではセルロース分解細菌Acidothermus属と最も近縁だ。Acidothermusの生息場所はフランキアとはまったく異なり、イエローストーン国立公園で単離され、高温(55℃)・酸性条件下(pH5.2)が最適な培養条件だ。しかし、両者はホパノイド脂質を多く含む、セルロースを分解する(一部のフランキア)という共通点を持つ。
- ^ Euzéby JP, Parte AC.. “Genus Frankia”. List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN). 2023年2月16日閲覧。
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- ^ Silvester, W. B., Berg, R. H., Schwintzer, C. R. and Tjepkema, J. D. Oxygen responses, hemoglobin, and the structure and function of vesicles. In: Pawlowski, K. and Newton, W. E. (eds) Nitrogen-fixing Actinorhizal Symbioses. Springer, Dordrecht, Netherlands, pp 105-146
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- ^ Sasakura, F., Uchiumi, T., Shimoda, Y., Suzuki, A., Takenouchi, K., Higashi, S. and Abe, M. A class 1 hemoglobin gene from Alnus firma functions in symbiotic and nonsymbiotic tissues to detoxify nitric oxide. Mol. Plant Microbe. Interact., 19, 441-450 (2006)
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