16S rRNA配列データベース
出典: フリー百科事典『ウィキペディア（Wikipedia）』 (2021/10/16 22:38 UTC 版)
「16SリボソームRNA」の記事における「16S rRNA配列データベース」の解説
16S rRNA遺伝子はほぼ全ての微生物に存在し、適当に配列変化が起きるため、微生物の系統分類と同定に利用されてきた。ほとんどの細菌および古細菌のタイプ株が持つ16S rRNA遺伝子の配列情報は、NCBIなどの公共データベースから入手できる。ただし、これらのデータベースに格納された配列は、品質が検証されていないことがよくある。そのため、16S rRNA配列のみを収集する2次データベースが広く使用されている。使用されるケースが多い有名なデータベースは以下のとおりである。
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