大量に配列が登録され続けていることによる不整合の問題とは? わかりやすく解説

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大量に配列が登録され続けていることによる不整合の問題

出典: フリー百科事典『ウィキペディア(Wikipedia)』 (2021/05/02 23:37 UTC 版)

配列データベース」の記事における「大量に配列が登録され続けていることによる不整合の問題」の解説

遺伝子配列データ蓄積している大規模な配列データベース直面している大きな問題は、個人研究者から大規模ゲノムシーケンシングセンターまで、さまざまな登録者から配列データ登録されていることである。このことはデータベースに高い網羅性をもたらしたが、一方で配列データおよび配列付され生物学的なアノテーション注釈)のデータ品質ばらつきが非常に大きい(品質の高いデータ品質の低いデータ混在する)という問題出てきている。 さらに冗長性問題がある。複数研究機関が、既に配列データベース登録されている配列と完全に同一な配列や、ほとんど同一な配列を、重複して登録してしまうということが、しばしば起きている。このことに気がつかずに複数情報源からの情報不用意にまとめてしまうと、結果として整合性欠け解析をしてしまうことになり、非常に問題である。

※この「大量に配列が登録され続けていることによる不整合の問題」の解説は、「配列データベース」の解説の一部です。
「大量に配列が登録され続けていることによる不整合の問題」を含む「配列データベース」の記事については、「配列データベース」の概要を参照ください。

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