配座エントロピー

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配座エントロピー

出典: フリー百科事典『ウィキペディア（Wikipedia）』 (2020/06/01 02:29 UTC 版)

配座エントロピー（はいざエントロピー、英: conformational entropy）は、分子の配座（コンホメーション）の数に関連するエントロピーである。この概念は、タンパク質やDNAといった生体高分子に最も一般的に適用されるが、多糖やその他の分子に対しても用いられる。配座エントロピーを計算するためには、まず分子の可能な配座を有限な状態数へと離散化する。状態数は通常、任意の構造パラメータの固有の組合せによって特徴付けられ、それぞれにエネルギーが割り当てられる。タンパク質では、主鎖の二面角および側鎖の回転異性体がパラメータとして一般的に用いられ、RNAでは塩基対パターンが用いられる。これらの特徴が（可能な微視的状態の統計力学的意味での）自由度を定義するために用いられる。αヘリックスや折り畳み、非折り畳み構造といった特定の構造（状態）に関連する配座エントロピーは、次にその構造の確率あるいは占有率によって決まる。