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Gabedit

出典: フリー百科事典『ウィキペディア（Wikipedia）』 (2020/01/11 15:24 UTC 版)

Gabeditは、計算化学パッケージGAMESS (US)、GAUSSIAN、MOLCAS（英語版）、MOLPRO（英語版）、MPQC（英語版）、OpenMopac、PC GAMESS、ORCA（英語版）、Q-Chem（英語版）に対するグラフィカルユーザーインターフェースである。

計算化学ソフトウェア

オープンソース	Avalon Cheminformatics Toolkit Bioclipse Blue Obelisk Chemistry Development Kit ECCE JOELib OELib Open Babel RDKit
プロプリエタリ	Canvas Chemicalize Discovery Studio

オープンソース	APBS Cantera KPP
プロプリエタリ	Autochem Chemical WorkBench CHEMKIN COSILAB DelPhi Khimera

分子グラフィックスシステムの一覧

オープンソース	Ascalaph Designer Avogadro BALL Biskit CPMD Gabedit Ghemical Jmol Molekel PyMOL QuteMol RasMol
プロプリエタリ	Abalone ACD/ChemSketch Atomistix ToolKit ChemDraw EzMol Gaussian HyperChem Maestro MarvinSketch MarvinView MODELLER Molecular Operating Environment Spartan UCSF Chimera VMD

分子ドッキング

タンパク質-リガンドドッキングソフトウェアの一覧

オープンソース	AutoDock AutoDock Vina FlexAID rDock
プロプリエタリ	Glide Molecular Operating Environment

オープンソース	GROMACS LAMMPS OpenMM PLUMED
プロプリエタリ	Abalone AMBER CHARMM Desmond GROMOS NAMD

オープンソース	ABINIT ACES (CFOUR) AIMAll BigDFT CP2K DACAPO Dalton DP code FreeON HORTON MADNESS MPQC NWChem Octopus PSI PyQuante PySCF Quantum ESPRESSO (PWscf) RMG SAMSON SIESTA VB2000 YAMBO code
Proprietary	ADF AMPAC DMol3 CADPAC CASINO CASTEP COLUMBUS CONQUEST CPMD CRUNCH CRYSTAL DIRAC Firefly GAMESS (UK) GAMESS (US) Gaussian Jaguar MOLCAS MOLPRO MOPAC ONETEP OpenAtom ORCA PARSEC PLATO PQS Q-Chem Quantemol Scigress Spartan TeraChem TURBOMOLE VASP WIEN2k XMVB

構造式エディタ

オープンソース	BKChem JChemPaint JME Molecule Editor Molsketch XDrawChem
プロプリエタリ	ACD/ChemSketch ChemDoodle ChemDraw MarvinSketch

その他

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