発現配列タグとは? わかりやすく解説

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発現配列タグ

同義/類義語:EST配列, EST, ESTデータベース
英訳・(英)同義/類義語:expressed sequence tag

特定の細胞組織から精製したmRNAから作成したcDNA部分配列大量に収集し、その組織細胞遺伝子発現特徴付けをしたり、ゲノム上の遺伝子領域推定使われる配列読み取り一度か行わないことがいい多いため、個々配列精度は低い。

発現配列タグ

出典: フリー百科事典『ウィキペディア(Wikipedia)』 (2020/04/13 14:29 UTC 版)

発現配列タグ(はつげんはいれつタグ、: expressed sequence tag、略称: EST)とはcDNA配列の一部からなる短い断片であり[1]遺伝学において遺伝子転写産物の同定に用いられ、遺伝子の発見や配列決定に有用である[2]。ESTの同定は迅速に進行しており、公共データベースで約7420万種類のESTが利用可能である(GenBank、全生物種、2013年1月1日段階)。


  1. ^ ESTs Factsheet. National Center for Biotechnology Information.
  2. ^ a b “Complementary DNA sequencing: expressed sequence tags and human genome project”. Science 252 (5013): 1651–6. (Jun 1991). doi:10.1126/science.2047873. PMID 2047873. 
  3. ^ What is dbEST?”. www.ncbi.nlm.nih.gov. 2020年3月31日閲覧。
  4. ^ “Use of a cDNA library for studies on evolution and developmental expression of the chorion multigene families”. Cell 18 (4): 1303–16. (December 1979). doi:10.1016/0092-8674(79)90241-1. PMID 519770. 
  5. ^ “Common 82-nucleotide sequence unique to brain RNA”. Proc Natl Acad Sci U S A 79 (16): 4942–6. (August 1982). doi:10.1073/pnas.79.16.4942. PMC: 346801. PMID 6956902. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC346801/. 
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  10. ^ “TissueInfo: high-throughput identification of tissue expression profiles and specificity”. Nucleic Acids Res. 29 (21): E102–2. (Nov 2001). doi:10.1093/nar/29.21.e102. PMC: 60201. PMID 11691939. http://nar.oxfordjournals.org/cgi/pmidlookup?view=long&pmid=11691939. 
  11. ^ “Mining expressed sequence tags identifies cancer markers of clinical interest”. BMC Bioinformatics 7: 481. (2006). doi:10.1186/1471-2105-7-481. PMC: 1635568. PMID 17078886. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC1635568/. 
  12. ^ :institute for computational biomedicine::TissueInfo Archived June 4, 2008, at the Wayback Machine.


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