非加重結合法
(UPGMA から転送)
出典: フリー百科事典『ウィキペディア(Wikipedia)』 (2021/10/31 16:54 UTC 版)
非加重結合法(Unweighted Pair Group Method with Arithmetic mean、UPGMAと略す)は系統樹を作製するためのボトムアップ式のクラスタ解析法である。入力データは対象の各ペア間の距離であり、有根系統樹が作製される。進化速度が一定(分子時計仮説)と仮定して有根系統樹を作成する際に用いられる[1]。
- ^ a b c d 隈啓一、加藤和貴「実践的系統樹推定方法」『化学と生物』第44巻第3号、2006年、 185-191頁、 doi:10.1271/kagakutoseibutsu1962.44.185。
- ^ a b c d e 松井求「分子系統解析の最前線」『JSBi Bioinformatics Review』第2巻第1号、2021年、 30-57頁、 doi:10.11234/jsbibr.2021.7。
- ^ 三中信宏「分子系統学:最近の進歩と今後の展望」『植物防疫』第63巻第3号、2009年、 192-196頁。
- 1 非加重結合法とは
- 2 非加重結合法の概要
- 非加重結合法のページへのリンク