スフィンゴモナス属
出典: フリー百科事典『ウィキペディア（Wikipedia）』 (2023/09/27 10:22 UTC 版)
| スフィンゴモナス属 | ||||||||||||||||||
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 スフィンゴモナス・ファイロスファエラエ（Sphingomonas phyllosphaerae）のコロニー | ||||||||||||||||||
| 分類 | ||||||||||||||||||
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| 学名 | ||||||||||||||||||
| Sphingomonas 薮内英子ら, 1990[1] (IJSEMリストに掲載 1990[2]) emend. Takeuchi et al. 1993[3] emend. Feng et al. 2017[4] (IJSEMリストに掲載 2017[5]) | ||||||||||||||||||
| タイプ種 | ||||||||||||||||||
| スフィンゴモナス・パウシモビリス Sphingomonas paucimobilis 薮内英子ら, 1990[1] (IJSEMリストに掲載 1990[2]) emend. Hördt et al. 2020[6] (IJSEMリストに掲載 2020[7]) | ||||||||||||||||||
| 下位分類（種） | ||||||||||||||||||
| 本文を参照 |
スフィンゴモナス属（Sphingomonas）はグラム陰性の非芽胞形成好気性桿菌。スフィンゴモナス目スフィンゴモナス科に属し、それらのタイプ属である。タイプ種はスフィンゴモナス・パウシモビリス（Sphingomonas paucimobilis）である。属名は、細胞壁を構成するスフィンゴ脂質に因む。GC含量は59から64。
水中や土壌に生息する。かつてはシュードモナス目シュードモナス科のシュードモナス属に分類されていたが、細胞壁がリポ多糖ではなくスフィンゴ脂質でできていることから細分類されて本属ができた。2001年に発表された系統分析結果によりスフィンゴビウム属（Sphingobium）、ノボスフィンゴビウム属（Novosphingobium）及びスフィンゴピクシス属（Sphingopyxis）が分離された[8]。スフィンゴ脂質の生産のために産業用に培養されるほか、バイオレメディエーションへの利用が研究されている。
種
2023年現在、正式には158種が承認されている[9]。
- スフィンゴモナス・アバシー
Sphingomonas abaci
Busse et al. 2005 - スフィンゴモナス・アドハエシバ
Sphingomonas adhaesiva
Yabuuchi et al. 1990 - スフィンゴモナス・アエロラータ
Sphingomonas aerolata
Busse et al. 2003 - スフィンゴモナス・アエロフィラ
Sphingomonas aerophila
Kim et al. 2014 - スフィンゴモナス・アエスツアリイ
Sphingomonas aestuarii
Roh et al. 2009 - スフィンゴモナス・アグリ
Sphingomonas agri
Siddiqi et al. 2017 - スフィンゴモナス・アルバ
Sphingomonas alba
Siddiqi et al. 2023 - スフィンゴモナス・アルバーテンシス
Sphingomonas albertensis
Tambong et al. 2022 - Sphingomonas aliaeris
Heidler von Heilborn et al. 2021 - Sphingomonas alpina
Margesin et al. 2012 - Sphingomonas anseongensis
Siddiqi et al. 2023 - スフィンゴモナス・アンタルティカ
Sphingomonas antarctica
Huang et al. 2017 - スフィンゴモナス・アクアティカ
Sphingomonas aquatica
Choi et al. 2017 - スフィンゴモナス・アクアティーリス
Sphingomonas aquatilis
Lee et al. 2001 - Sphingomonas aracearum
Wang et al. 2019 - Sphingomonas arantia
Jia et al. 2016 - スフィンゴモナス・アレナエ
Sphingomonas arenae
Dong et al. 2022 - スフィンゴモナス・アサッカロリティカ
Sphingomonas asaccharolytica
Takeuchi et al. 1995 - Sphingomonas astaxanthinifaciens
Asker et al. 2008 - スフィンゴモナス・アウランティアカ
Sphingomonas aurantiaca
Busse et al. 2003 - スフィンゴモナス・アゾティフィゲンス
Sphingomonas azotifigens
Xie and Yokota 2006 - Sphingomonas baiyangensis
Wei et al. 2022 - スフィンゴモナス・ブレビス
Sphingomonas brevis
Siddiqi et al. 2023 - スフィンゴモナス・カナデンシス
Sphingomonas canadensis
Abraham et al. 2013 - スフィンゴモナス・カンナビナ
Sphingomonas cannabina
Jeon et al. 2022 - スフィンゴモナス・カロティニファシエンス
Sphingomonas carotinifaciens
Madhaiyan et al. 2017 - Sphingomonas carri
Lee et al. 2017 - スフィンゴモナス・カベルナエ
Sphingomonas cavernae
Zhu et al. 2022 - Sphingomonas changbaiensis
Zhang et al. 2010 - Sphingomonas changnyeongensis
Park et al. 2020 - Sphingomonas chungangi
Akter and Huq 2020 - スフィンゴモナス・シトリ
Sphingomonas citri
Feng et al. 2022 - Sphingomonas citricola
Feng et al. 2022 - Sphingomonas colocasiae
Lin et al. 2018 - Sphingomonas corticis
Li et al. 2020 - スフィンゴモナス・クレメア
Sphingomonas cremea
Park et al. 2023 - スフィンゴモナス・クロコディリ
Sphingomonas crocodyli
Sheu et al. 2019 - スフィンゴモナス・クルスティコーラ
Sphingomonas crusticola
Zhang et al. 2017 - スフィンゴモナス・サイナラエ
Sphingomonas cynarae
Talà et al. 2013 - Sphingomonas daechungensis
Huy et al. 2014 - スフィンゴモナス・デゼルティ
Sphingomonas deserti
Liu et al. 2019 - Sphingomonas desiccabilis
Reddy and Garcia-Pichel 2007 - スフィンゴモナス・ディフィシリス
Sphingomonas difficilis
Feng et al. 2017 - スフィンゴモナス・ドクドンエンシス
Sphingomonas dokdonensis
Yoon et al. 2006 - スフィンゴモナス・エキノイデス
Sphingomonas echinoides
(Heumann 1962) Denner et al. 1999 - スフィンゴモナス・エダフィ
Sphingomonas edaphi
Kim et al. 2020 - Sphingomonas endophytica
Huang et al. 2012 - スフィンゴモナス・ファエニ
Sphingomonas faeni
Busse et al. 2003 - スフィンゴモナス・ファウシウム
Sphingomonas faucium
Liu et al. 2016 - Sphingomonas fennica
Wittich et al. 2007 - スフィンゴモナス・フラバ
Sphingomonas flava
corrig. Du et al. 2015 - Sphingomonas flavalba
Zhou et al. 2019 - Sphingomonas floccifaciens
Fan et al. 2019 - スフィンゴモナス・フォリイ
Sphingomonas folii
Feng et al. 2022 - スフィンゴモナス・フォンティコーラ
Sphingomonas fonticola
Sheu et al. 2015 - スフィンゴモナス・フォモセンシス
Sphingomonas formosensis
Lin et al. 2012 - Sphingomonas frigidaeris
Lee and Jeon 2017 - Sphingomonas gei
Zhu et al. 2015 - Sphingomonas gellani
Madhaiyan et al. 2021 - Sphingomonas gilva
Zhu et al. 2019 - Sphingomonas gimensis
Feng et al. 2014 - Sphingomonas ginkgonis
Cha et al. 2019 - Sphingomonas ginsengisoli
An et al. 2013 - Sphingomonas ginsenosidimutans
Choi et al. 2011 - Sphingomonas glacialis
Zhang et al. 2011 - Sphingomonas gotjawalisoli
Lee et al. 2017 - Sphingomonas guangdongensis
Feng et al. 2014 - Sphingomonas haloaromaticamans
Wittich et al. 2007 - Sphingomonas hankookensis
Yoon et al. 2009 - Sphingomonas hankyongi
Siddiqi et al. 2023 - Sphingomonas hengshuiensis
Wei et al. 2015 - スフィンゴモナス・ホミニス
Sphingomonas hominis
Zhang et al. 2021 - Sphingomonas hylomeconis
Akbar et al. 2015 - スフィンゴモナス・インスラエ
Sphingomonas insulae
Yoon et al. 2008 - スフィンゴモナス・ジャポニカ
Sphingomonas japonica
Romanenko et al. 2009 - Sphingomonas jaspsi
Asker et al. 2007 - Sphingomonas jatrophae
Madhaiyan et al. 2017 - Sphingomonas jeddahensis
Wübbeler et al. 2017 - スフィンゴモナス・ジェジュエンシス
Sphingomonas jejuensis
Park et al. 2012 - スフィンゴモナス・ジンジュエンシス
Sphingomonas jinjuensis
Chung et al. 2011 - Sphingomonas kaistensis
Kim et al. 2007 - スフィンゴモナス・コーリエンシス
Sphingomonas koreensis
Lee et al. 2001 - Sphingomonas kyeonggiensis
corrig. Son et al. 2014 - Sphingomonas kyungheensis
Son et al. 2013 - Sphingomonas lacunae
Sheu et al. 2020 - スフィンゴモナス・ラクス
Sphingomonas lacus
Kim et al. 2015 - Sphingomonas laterariae
Kaur et al. 2012 - スフィンゴモナス・レイデイ
Sphingomonas leidyi
(Poindexter 1964) Chen et al. 2012 - Sphingomonas lenta
Feng et al. 2019 - Sphingomonas limnosediminicola
Lee et al. 2017 - スフィンゴモナス・ルテア
Sphingomonas lutea
Lee et al. 2016 - Sphingomonas lycopersici
Gao et al. 2023 - スフィンゴモナス・マリ
Sphingomonas mali
Takeuchi et al. 1995 - スフィンゴモナス・メロニス
Sphingomonas melonis
Buonaurio et al. 2002 - スフィンゴモナス・メソフィラ
Sphingomonas mesophila
Li et al. 2019 - Sphingomonas metalli
Feng et al. 2016 - スフィンゴモナス・モルスコルム
Sphingomonas molluscorum
Romanenko et al. 2007 - Sphingomonas montana
Manandhar et al. 2018 - Sphingomonas montanisoli
Xu et al. 2020 - Sphingomonas montis
Chaudhary et al. 2019 - Sphingomonas morindae
Liu et al. 2015 - Sphingomonas mucosissima
Reddy and Garcia-Pichel 2007 - Sphingomonas naasensis
Kim et al. 2014 - Sphingomonas naphthae
Chaudhary and Kim 2016 - スフィンゴモナス・オレイ
Sphingomonas olei
Chaudhary and Kim 2017 - スフィンゴモナス・オレイボランス
Sphingomonas oleivorans
Chen et al. 2018 - Sphingomonas oligoaromativorans
Han et al. 2014 - スフィンゴモナス・オリゴフェノリカ
Sphingomonas oligophenolica
Ohta et al. 2004 - Sphingomonas oryziterrae
Chung et al. 2011 - Sphingomonas paeninsulae
Geng et al. 2019 - スフィンゴモナス・パルマエ
Sphingomonas palmae
Madhaiyan et al. 2021 - スフィンゴモナス・パルストリス
Sphingomonas palustris
Lee et al. 2017 - スフィンゴモナス・パナシス
Sphingomonas panacis
Singh et al. 2017 - Sphingomonas panacisoli
Maeng et al. 2021 - Sphingomonas panaciterrae
Sukweenadhi et al. 2017 - スフィンゴモナス・パニー
Sphingomonas panni
Busse et al. 2005 - スフィンゴモナス・パラパウシモビリス
Sphingomonas parapaucimobilis
Yabuuchi et al. 1990 - スフィンゴモナス・パウシモビリス
Sphingomonas paucimobilis
(Holmes et al. 1977) Yabuuchi et al. 1990 - スフィンゴモナス・ファイロスファエラエ
Sphingomonas phyllosphaerae
Rivas et al. 2004 - Sphingomonas piscinae
Chen et al. 2016 - Sphingomonas piscis
Hyun et al. 2022 - スフィンゴモナス・ピテュイトサ
Sphingomonas pituitosa
Denner et al. 2001 - Sphingomonas pokkalii
Menon et al. 2021 - Sphingomonas polyaromaticivorans
Luo et al. 2012 - スフィンゴモナス・ポプリ
Sphingomonas populi
Li et al. 2020 - Sphingomonas prati
Manandhar et al. 2016 - Sphingomonas profundi
Yang et al. 2020 - スフィンゴモナス・プルーニ
Sphingomonas pruni
Takeuchi et al. 1995 - Sphingomonas pseudosanguinis
Kämpfer et al. 2007 - Sphingomonas psychrolutea
Liu et al. 2015 - Sphingomonas psychrotolerans
Luo et al. 2022 - Sphingomonas qilianensis
Piao et al. 2016 - Sphingomonas quercus
Shen et al. 2022 - Sphingomonas radiodurans
Liu et al. 2022 - スフィンゴモナス・リゾフィラ
Sphingomonas rhizophila
Yan et al. 2018 - スフィンゴモナス・ロセイフラバ
Sphingomonas roseiflava
corrig. Yun et al. 2000 - スフィンゴモナス・ルブラ
Sphingomonas rubra
Huo et al. 2011 - Sphingomonas sabuli
Kang et al. 2021 - スフィンゴモナス・サングイニス
Sphingomonas sanguinis
corrig. Takeuchi et al. 1993 - Sphingomonas sanxanigenens
Huang et al. 2009 - Sphingomonas sediminicola
An et al. 2013 - Sphingomonas segetis
Lee and Whang 2020 - Sphingomonas silvisoli
Ko et al. 2017 - Sphingomonas sinipercae
Hyun et al. 2022 - Sphingomonas solaris
Tanner et al. 2020 - スフィンゴモナス・ソリ
Sphingomonas soli
Yang et al. 2006 - Sphingomonas spermidinifaciens
Feng et al. 2017 - Sphingomonas suaedae
Zhang et al. 2020 - Sphingomonas tabacisoli
Zhou et al. 2018 - スフィンゴモナス・テゥルエペリ
Sphingomonas trueperi
Kämpfer et al. 1997 - Sphingomonas turrisvirgatae
Thaller et al. 2018 - Sphingomonas vulcanisoli
Lee et al. 2015 - スフィンゴモナス・シンジャンゲンシス
Sphingomonas xinjiangensis
An et al. 2011 - スフィンゴモナス・ヤブウチアエ
Sphingomonas yabuuchiae
Li et al. 2004 - Sphingomonas yantingensis
Huang et al. 2014 - スフィンゴモナス・ユンナンエンシス
Sphingomonas yunnanensis
Zhang et al. 2005 - スフィンゴモナス・ジアエ
Sphingomonas zeae
Kämpfer et al. 2015 - Sphingomonas zeicaulis
Gao et al. 2016
脚注
- ^ a b Eiko Yabuuchi, Ikuya Yano, Hiroshi Oyaizu, Yasuhiro Hashimoto, Takayuki Ezaki, Hiroyuki Yamamoto (February 1990). “Proposals of Sphingomonas paucimobilis gen. nov. and comb. nov., Sphingomonas parapaucimobilis sp. nov., Sphingomonas yanoikuyae sp. nov., Sphingomonas adhaesiva sp. nov., Sphingomonas capsulata comb, nov., and Two Genospecies of the Genus Sphingomonas”. Microbiology and Immunology 34 (2): 99-119. doi:10.1111/j.1348-0421.1990.tb00996.x.
- ^ a b “Validation of the Publication of New Names and New Combinations Previously Effectively Published Outside the IJSB”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 40 (3): 320-321. (01 July 1990). doi:10.1099/00207713-40-3-320.
- ^ M. Takeuchi, F. Kawai, Y. Shimada, A. Yokota (July 1993). “Taxonomic Study of Polyethylene Glycol-Utilizing Bacteria: Emended Description of the Genus Sphingomonas and New Descriptions of Sphingomonas macrogoltabidus sp. nov., Sphingomonas sanguis sp. nov. and Sphingomonas terrae sp. nov.”. Systematic and Applied Microbiology 16 (2): 227-238. doi:10.1016/S0723-2020(11)80473-X.
- ^ Guang-Da Feng, Song-Zhen Yang, Xiong Xiong, Hua-Ping Li, Hong-Hui Zhu (01 July 201). “Sphingomonas spermidinifaciens sp. nov., a novel bacterium containing spermidine as the major polyamine, isolated from an abandoned lead–zinc mine and emended descriptions of the genus Sphingomonas and the species Sphingomonas yantingensis and Sphingomonas japonica”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 67 (7): 2160-2165. doi:10.1099/ijsem.0.001905. PMID 28691655.
- ^ Aharon Oren, George Garrity (01 October 2017). “Notification that new names of prokaryotes, new combinations, and new taxonomic opinions have appeared in volume 67, part 7, of the IJSEM”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 67 (10): 3689-3691. doi:10.1099/ijsem.0.002285.
- ^ Anton Hördt Marina García López, Jan P. Meier-Kolthoff, Marcel Schleuning, Lisa-Maria Weinhold, Brian J. Tindall, Sabine Gronow, Nikos C. Kyrpides, Tanja Woyke, Markus Göker (07 April 2020). “Analysis of 1,000+ Type-Strain Genomes Substantially Improves Taxonomic Classification of Alphaproteobacteria”. Frontiers in Microbiology 11: 468. doi:10.3389/fmicb.2020.00468.
- ^ Aharon Oren, George Garrity (30 July 2020). “Notification of changes in taxonomic opinion previously published outside the IJSEM”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 70 (7): 4061-4090. doi:10.1099/ijsem.0.004245.
- ^ M Takeuchi, K Hamana, A Hiraishi (01 July 2001). “Proposal of the genus Sphingomonas sensu stricto and three new genera, Sphingobium, Novosphingobium and Sphingopyxis, on the basis of phylogenetic and chemotaxonomic analyses”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 51 (4): 1405-17. doi:10.1099/00207713-51-4-1405. PMID 11491340.
- ^ Jean P. Euzéby, Aidan C. Parte. “Genus Sphingomonas”. List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature. 2023年8月26日閲覧。
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