P CRとは? わかりやすく解説

PCR

別表記:ピーシーアール

「PCR」とは生物遺伝情報複製して増幅させる技法意味する表現である。

「PCR」とは・「PCR」の意味

「PCR」はPolymerase Chain Reaction省略した言葉で、日本語訳した場合ポリメラーゼ連鎖反応となる。具体的に生物遺伝情報をもつDNAデオキシリボ核酸)を複製して増幅するという意味だ。この「PCR」を利用することで検体少なくて短時間目的配列だけを増殖することが可能となる。その結果目的遺伝子配列存在しているかを簡単に知ることが可能になった。現在「PCR」の用途といえばコロナウィルス検査方法抗原検査などが有名であるが、その用途医療限定されるものではない。「PCR」は応用範囲が広いため、分子生物学研究遺伝子研究だけでなく水質検査DNA鑑定などでも活用されている。

1983年キャリー・マリス博士によって発明された「PCR」の仕組みは、それほど複雑なものではない。試薬混ぜたDNA溶液温度操作することによって、二本鎖DNA乖離プライマー結合・酵素反応によるDNA合成という3つの反応促すことが「PCR」で行われていることだ。この過程を経ることによって、必要とする領域DNA断片大量に複製することができるようになる。ここで使われる試薬とは、プライマー遊離ヌクレオチドDNA合成酵素のことだ。「PCR」のメリットには特定のターゲットのみを短時間大量に増やせということと、実験の再現度が高いということ挙げられる。同じ条件なら世界中のどこでも同じ結果が出ることが、「PCR」が普及していった理由である。「PCR」のデメリットとしては、コンタミ汚染)に極端に弱いことやサンプル事前に知らなければ検査できないことなどが挙げられる。「PCR」には弱点もあるが、現在ではリアルタイムPCRデジタルPCRのような弱点を補う新しい動き生まれている。

「PCR」と同じ略し方をしているが、全く違う意味の言葉複数ある。病理組織学において癌細胞が完全に消失したことを意味する病理学的完全奏効も、略称はpCRである。しかしこちらの方はpathorogical Complete Responseのことを指す。歯科分野でも「PCR」はあるが、こちらはプラークコントロールレコードのことを指す言葉だ。細菌の塊である歯垢プラーク)を赤く染め出してその割合導き出すというものであるリサイクル分野にもPCRという言葉がある。プラスチックリサイクルはその原料によって、ポストコンシュマーリサイクルとポストインダストリアルリサイクルに分けることができるが、前者の略称が「PCR」だ。ポストコンシュマーリサイクルとは、市場使用した製品回収し再生資源化するという意味の言葉である。このように「PCR」という言葉には数多く使われ方があるので、判断するときはしっかり文脈読み取らなければならない

「PCR」の熟語・言い回し

ここでは「PCR」を用いた熟語解説行っていく。

rt-PCR とは


rt-PCRreverse transcription PCR)とはRNAに対してPCRを実施する手法のことを指す言葉だ。rt-PCR逆転写PCRやRNA-PCRと呼ばれることもある。似た言葉リアルタイムPCRというものがあるが、こちらはrt-PCR略されるとがないので、注意しなければならない

nESted PCRとは


nESted PCRはPCRの変法1つであり、一度の「PCR」によって所定結果が出なかった場合第二のプライマーセットをデザインして「PCR」を行っていくことを指す。

PCR検査とは


PCR検査という言葉医療分野で用いられる場合PCR法用いたコロナウィルス検査法のことを指すのが一般的だ。そのやり方はまず鼻や喉などを拭って細胞採取してから、その細胞からウィルス検出していく。PCR検査には他に、リアルタイムPCR法やDNAシークニング法などのやり方がある。PCR検査似たもの抗体検査があるが、その検査目的大きく違う。PCR検査が現在ウィルス感染しているかを検査するに対して抗体検査では過去感染履歴調べる。血液検査行って検出するなど、その方法PCR検査と違う。

PCR(ポリメラーゼ連鎖反応)

PCRがかからない場合に

PCRに必要な要素

PCRの操作は簡単ですが、反応は多段階・多基質複雑な反応です。酵素基質適切な濃度純度存在していることは大切です。

その他のチェック

ダイマーチェック

プライミング部分の安定性

PCRで用いポリメラーゼは、プライマーの3'末端酵素/DNA複合体形成し、鎖延長はじめますプライミング)。3'末端安定性上げるために3'末端GCペアであることが好ましいと言われています。

マルチクローニングサイト

プライマーダイマー

分子間ダイマー形成

分子内ヘアピンループ形成

PCR

この場合目的のPCR反応関与できないまた、配列によってはポリメラーゼが3'末端相補ヌクレオチド繋げてしまい、ループ構造がさらに安定化してしまう。

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PCR

【英】: Polymerase Chain Reaction
PCR
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デオキシリボ核酸

プライマー

遺伝子


PCR法

PCR, Polymerase chain reaction

【概要】 ノーベル賞をとった核酸増幅法一つ最初に検体からDNA抽出する。これをDNA分解酵素断片化したあと、高温にして1本鎖にし、次に目的遺伝子特有のプローブ(短い遺伝子)と塩基加えDNAポリメラーゼ反応させるそうすると相補性DNA鎖が合成され2本鎖の割り箸のようなDNAができる。試験管高温にすると割り箸割れるようDNA1本鎖別れる温度下げるとまたプローブとの反応が進む。これを繰り返すと1本の遺伝子断片が、2本、4本、8本、16本、、と倍々で増えて行く。数十繰り返すと、元の遺伝子数十万倍増える。あらかじめ量がわかった遺伝子入れて並行して反応させれば測定検体比較して定量できる。 

問題点感度の高さが逆に弱点になる。つまり実験環境から間違った遺伝子潜り込むことがある。また拾い上げるべき遺伝子配列(プライマー)の設計ポイントになる。目的遺伝子変異激し場合は、複数プライマー組み合わせて見逃し避けなければならない。 

応用ロシュ社ではクラミジアトラコマチス淋菌結核菌、Mアビウム、Mイントラセルラーの診断キット市販しており、ウイルスではHBVHCVHIV-1定量測定キット市販している。HIV感染症における応用としては、(1)HIV抗体ができる前の、急性HIV感染症の診断(2)感染母体からの移行抗体をもつ胎児新生児HIV感染の診断がある。細胞からDNA抽出する場合プロウイルス検出できる

《参照》 HIV抗体サイレントインフェクションHIVRNART-PCR法結核


PCR法

極めて微量遺伝子DNA)を含む溶液の中から自分の望む特定のDNA領域数百から数千塩基対)を短時間効率的に大量に増やすことのできる技術です。原 理は、生体細胞の中で起きている酵素反応です。細胞分裂の際にDNA複製されるときには二本鎖のらせん構造取っているDNAがほどけて1本ずつになり、それぞれの鎖を鋳型にしてペアになるDNA酵素合成されますが、PCRはこのようなDNA複製反応試験官の中で繰り返し行う方法です(1時間程度反応で1千万倍にまで増やすことも可能です)。

PCR

出典: フリー百科事典『ウィキペディア(Wikipedia)』 (2022/02/18 04:18 UTC 版)

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PCR



PCR

出典: フリー百科事典『ウィキペディア(Wikipedia)』 (2021/09/12 22:29 UTC 版)

リ・ジェネシス バイオ犯罪捜査班」の記事における「PCR」の解説

普通、実験犯罪捜査のために手に入るDNAはごく微量である。しかし、実験には大量DNAが必要である。そこで、PCR(ポリメラーゼ連鎖反応の略)という技術DNA大量にコピーして増やす。このPCRは仕事コピー機を使うような感覚日常茶飯事使われるため、リ・ジェネシスはじめとする科学系の話ではよく出てくる。

※この「PCR」の解説は、「リ・ジェネシス バイオ犯罪捜査班」の解説の一部です。
「PCR」を含む「リ・ジェネシス バイオ犯罪捜査班」の記事については、「リ・ジェネシス バイオ犯罪捜査班」の概要を参照ください。


PCR

出典: フリー百科事典『ウィキペディア(Wikipedia)』 (2022/05/13 02:20 UTC 版)

クロストリジウム・ディフィシル腸炎」の記事における「PCR」の解説

糞便試料リアルタイムPCR分析すると、検出率90%程度偽陽性4%程度検査することができる。マルチステップPCR検査アルゴリズム全般的なパフォーマンス改善できる

※この「PCR」の解説は、「クロストリジウム・ディフィシル腸炎」の解説の一部です。
「PCR」を含む「クロストリジウム・ディフィシル腸炎」の記事については、「クロストリジウム・ディフィシル腸炎」の概要を参照ください。

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