Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeatとは? わかりやすく解説

Weblio 辞書 > 辞書・百科事典 > 百科事典 > Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeatの意味・解説 

CRISPR

(Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeat から転送)

出典: フリー百科事典『ウィキペディア(Wikipedia)』 (2022/11/07 20:30 UTC 版)

CRISPR (: clustered regularly interspaced short palindromic repeat; クリスパー)は数十塩基対の短い反復配列を含み、原核生物における一種の獲得免疫系として働く座位である。配列決定された原核生物のうち真正細菌の4割と古細菌の9割に見出されており[1][2]プラスミドファージといった外来の遺伝性因子に対する抵抗性に寄与している[3][4]


注釈

  1. ^ ゲノム編集技術のこと。従来の遺伝子改変生物の作製法はランダムな変異によるものや、ES細胞の相同組換えによる標的遺伝子の改変に限られており、いずれも効率の低い方法であった。近年のZFNやTALENなどの人工制限酵素の開発により、ゲノム上の標的遺伝子の改変が容易になりつつある[53]en:genome engineering参照。

参考文献

  1. ^ 71/79 Archaea, 463/1008 Bacteria CRISPRdb, Date: 19.6.2010
  2. ^ Grissa I, Vergnaud G, Pourcel C (2007). “The CRISPRdb database and tools to display CRISPRs and to generate dictionaries of spacers and repeats”. BMC Bioinformatics 8: 172. doi:10.1186/1471-2105-8-172. PMC 1892036. PMID 17521438. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC1892036/. 
  3. ^ a b Barrangou R, Fremaux C, Deveau H, et al. (March 2007). “CRISPR provides acquired resistance against viruses in prokaryotes”. Science 315 (5819): 1709–12. doi:10.1126/science.1138140. PMID 17379808. 
  4. ^ Marraffini LA, Sontheimer EJ (December 2008). “CRISPR Interference Limits Horizontal Gene Transfer in Staphylococci by Targeting DNA”. Science 322 (5909): 1843–5. doi:10.1126/science.1165771. PMC 2695655. PMID 19095942. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2695655/. 
  5. ^ Ishino Y, Shinagawa H, Makino K, Amemura M, Nakata A (1987). “Nucleotide sequence of the iap gene, responsible for alkaline phosphatase isozyme conversion in Escherichia coli, and identification of the gene product”. J Bacteriol 169 (12): 5429–33. PMC 213968. PMID 3316184. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC213968/. 
  6. ^ Mojica FJM, Díez-Villaseñor C, Soria E, Juez G (2000). “Biological significance of a family of regularly spaced repeats in the genomes of Archaea, Bacteria and mitochondria”. Mol Microbiol 36 (1): 244–6. doi:10.1046/j.1365-2958.2000.01838.x. PMID 10760181. 
  7. ^ a b Jansen R, Embden JD, Gaastra W, Schouls LM (2002). “Identification of genes that are associated with DNA repeats in prokaryotes”. Mol Microbiol 43 (6): 1565–75. doi:10.1046/j.1365-2958.2002.02839.x. PMID 11952905. 
  8. ^ a b Mojica FJ, Díez-Villaseñor C, García-Martínez J, Soria E (February 2005). “Intervening sequences of regularly spaced prokaryotic repeats derive from foreign genetic elements”. J. Mol. Evol. 60 (2): 174–82. doi:10.1007/s00239-004-0046-3. PMID 15791728. 
  9. ^ a b Bolotin A, Quinquis B, Sorokin A, Ehrlich SD (August 2005). “Clustered regularly interspaced short palindrome repeats (CRISPRs) have spacers of extrachromosomal origin”. Microbiology (Reading, Engl.) 151 (Pt 8): 2551–61. doi:10.1099/mic.0.28048-0. PMID 16079334. 
  10. ^ a b Pourcel C, Salvignol G, Vergnaud G (2005). “CRISPR elements in Yersinia pestis acquire new repeats by preferential uptake of bacteriophage DNA, and provide additional tools for evolutionary studies”. Microbiology 151 (Pt 3): 653–63. doi:10.1099/mic.0.27437-0. PMID 15758212. 
  11. ^ a b Jinek, M; Chylinski K, Fonfara I, Hauer M, Doudna JA, Charpentier E. (2012). “A programmable dual-RNA-guided DNA endonuclease in adaptive bacterial immunity”. Science. PMID 22745249. 
  12. ^ a b Cong, Le; Ran FA, Cox D, Lin S, Barretto R, Habib N, Hsu PD, Wu X, Jiang W, Marraffini LA, Zhang F. (2013). “Multiplex genome engineering using CRISPR/Cas systems.”. Science. PMID 23287718. 
  13. ^ Adli, Mazhar (2018). “The CRISPR tool kit for genome editing and beyond”. Nature Communications 9 (1). doi:10.1038/s41467-018-04252-2. ISSN 2041-1723. 
  14. ^ a b Gootenberg, Jonathan S.; Abudayyeh, Omar O.; Lee, Jeong Wook; Essletzbichler, Patrick; Dy, Aaron J.; Joung, Julia; Verdine, Vanessa; Donghia, Nina et al. (2017). “Nucleic acid detection with CRISPR-Cas13a/C2c2”. Science 356 (6336): 438–442. doi:10.1126/science.aam9321. ISSN 0036-8075. 
  15. ^ ノーベル化学賞に米仏の女性2氏 ゲノム編集技術を開発:朝日新聞デジタル” (日本語). 朝日新聞デジタル. 2021年11月6日閲覧。
  16. ^ 2020年ノーベル化学賞、仏米の女性研究者2氏に ゲノム編集技術研究” (日本語). www.afpbb.com. 2021年11月6日閲覧。
  17. ^ “Cpf1 Is a Single RNA-Guided Endonuclease of a Class 2 CRISPR-Cas System” (英語). Cell 163 (3): 759–771. (2015-10-22). doi:10.1016/j.cell.2015.09.038. ISSN 0092-8674. https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0092867415012003. 
  18. ^ Abudayyeh, Omar O.; Gootenberg, Jonathan S.; Konermann, Silvana; Joung, Julia; Slaymaker, Ian M.; Cox, David B. T.; Shmakov, Sergey; Makarova, Kira S. et al. (2016-08-05). “C2c2 is a single-component programmable RNA-guided RNA-targeting CRISPR effector” (英語). Science 353 (6299). doi:10.1126/science.aaf5573. ISSN 0036-8075. PMID 27256883. https://science.sciencemag.org/content/353/6299/aaf5573. 
  19. ^ 阿部裕 (2020年11月). “[https://www.mitsui.com/mgssi/ja/report/detail/__icsFiles/afieldfile/2020/11/10/2011pm_abe.pdf CRISPRフリーのゲノム編集時代の幕開け ―ゲノム編集技術の展開―]”. 三井物産戦略研究所. p. 6. 2021年11月7日閲覧。
  20. ^ Myhrvold, Cameron; Freije, Catherine A.; Gootenberg, Jonathan S.; Abudayyeh, Omar O.; Metsky, Hayden C.; Durbin, Ann F.; Kellner, Max J.; Tan, Amanda L. et al. (2018-04-27). “Field-deployable viral diagnostics using CRISPR-Cas13”. Science (New York, N.Y.) 360 (6387): 444–448. doi:10.1126/science.aas8836. ISSN 1095-9203. PMC 6197056. PMID 29700266. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/29700266/. 
  21. ^ Freije, Catherine A.; Myhrvold, Cameron; Boehm, Chloe K.; Lin, Aaron E.; Welch, Nicole L.; Carter, Amber; Metsky, Hayden C.; Luo, Cynthia Y. et al. (2019-12-05). “Programmable Inhibition and Detection of RNA Viruses Using Cas13”. Molecular Cell 76 (5): 826–837.e11. doi:10.1016/j.molcel.2019.09.013. ISSN 1097-4164. PMC 7422627. PMID 31607545. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31607545/. 
  22. ^ 氣駕恒太朗. “【演題 4】バクテリオファージを用いた疾患治療法の開発”. 公益財団法人千里ライフサイエンス振興財団. 2021年11月7日閲覧。
  23. ^ 狙った細菌を選択的に殺菌できる遺伝子標的型抗菌薬を創出―薬剤耐性菌問題の解決へ― | 国立研究開発法人日本医療研究開発機構” (日本語). www.amed.go.jp. 2021年11月6日閲覧。
  24. ^ Kiga, Kotaro; Tan, Xin-Ee; Ibarra-Chávez, Rodrigo; Watanabe, Shinya; Aiba, Yoshifumi; Sato’o, Yusuke; Li, Feng-Yu; Sasahara, Teppei et al. (2020-06-10). “Development of CRISPR-Cas13a-based antimicrobials capable of sequence-specific killing of target bacteria” (英語). Nature Communications 11 (1): 2934. doi:10.1038/s41467-020-16731-6. ISSN 2041-1723. https://www.nature.com/articles/s41467-020-16731-6. 
  25. ^ 田中真二. “令和元年度学術研究動向等に関する調査研究 報告概要(医歯薬学専門調査班)”. 日本学術振興会. p. 2. 2021年11月7日閲覧。
  26. ^ Shihong Gao, David; Zhu, Xiaodong; Lu, Binfeng (2021-07). “Development and application of sensitive, specific, and rapid CRISPR-Cas13-based diagnosis”. Journal of Medical Virology 93 (7): 4198–4204. doi:10.1002/jmv.26889. ISSN 1096-9071. PMC 8014745. PMID 33599292. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33599292/. 
  27. ^ a b Shinoda, Hajime; Taguchi, Yuya; Nakagawa, Ryoya; Makino, Asami; Okazaki, Sae; Nakano, Masahiro; Muramoto, Yukiko; Takahashi, Chiharu et al. (2021-04-19). “Amplification-free RNA detection with CRISPR–Cas13” (英語). Communications Biology 4 (1): 1–7. doi:10.1038/s42003-021-02001-8. ISSN 2399-3642. https://www.nature.com/articles/s42003-021-02001-8. 
  28. ^ 新型コロナウイルスの超高感度・世界最速検出技術を開発” (日本語). www.riken.jp. 2021年11月6日閲覧。
  29. ^ 【新型コロナ】新型コロナウイルスを5分以内に検出 超高感度・世界最速で検出する革新的技術を開発 理研・東京大・京都大” (日本語). 糖尿病リソースガイド. 2021年11月6日閲覧。
  30. ^ 新型コロナウイルスの超高感度・世界最速検出技術を開発-汎用的な感染症診断技術としての応用展開に期待-”. 科学技術振興機構. 2021年11月7日閲覧。
  31. ^ Yoshimi, Kazuto; Takeshita, Kohei; Yamayoshi, Seiya; Shibumura, Satomi; Yamauchi, Yuko; Yamamoto, Masaki; Yotsuyanagi, Hiroshi; Kawaoka, Yoshihiro et al. (2020-06-02) (英語). Rapid and accurate detection of novel coronavirus SARS-CoV-2 using CRISPR-Cas3. pp. 2020.06.02.20119875. doi:10.1101/2020.06.02.20119875v1. https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.06.02.20119875v1. 
  32. ^ 日経バイオテクONLINE. “東大医科研、国産ゲノム編集技術で迅速安価なコロナ検出法を開発” (日本語). 日経バイオテクONLINE. 2021年11月6日閲覧。
  33. ^ 真下知士. “ゲノム編集治療とCRISPR診断薬の開発研究”. ゲノム編集 2020. フナコシ株式会社. 2021年11月7日閲覧。
  34. ^ 日経バイオテクONLINE. “米Sherlock社、ゲノム編集技術用いた新型コロナの診断薬が緊急使用許可” (日本語). 日経バイオテクONLINE. 2021年11月6日閲覧。
  35. ^ 日経バイオテクONLINE. “米Mammoth社と英GSK社、CRISPR技術用いた新型コロナの迅速診断検査を共同開発” (日本語). 日経バイオテクONLINE. 2021年11月6日閲覧。
  36. ^ SARS-CoV-2 DETECTR Reagent Kit - Letter of Authorization”. FDA (2020年8月31日). 2021年11月7日閲覧。
  37. ^ “[https://www.fda.gov/media/139937/download ACCELERATED EMERGENCY USE AUTHORIZATION (EUA) SUMMARY SARS-COV-2 RNA DETECTR ASSAY (UCSF Health Clinical Laboratories, UCSF Clinical Labs at China Basin)]”. FDA. 2021年11月7日閲覧。
  38. ^ FDA Grants EUAs for MiraDx, Mammoth Biosciences, BayCare Laboratories Molecular Coronavirus Tests” (英語). Genomeweb (2020年9月2日). 2021年11月6日閲覧。
  39. ^ FDA Grants EUAs for Mammoth Biosciences Coronavirus Tests | IPIRA”. ipira.berkeley.edu. 2021年11月6日閲覧。
  40. ^ a b c d e Horvath P, Barrangou R (January 2010). “CRISPR/Cas, the immune system of bacteria and archaea”. Science 327 (5962): 167–70. doi:10.1126/science.1179555. PMID 20056882. 
  41. ^ a b Marraffini LA, Sontheimer EJ (February 2010). “CRISPR interference: RNA-directed adaptive immunity in bacteria and archaea”. Nat Rev Genet 11 (3): 181–190. doi:10.1038/nrg2749. PMC 2928866. PMID 20125085. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2928866/. 
  42. ^ “CRISPR-Casシステムの構造と機能”. 生物物理 54 (5): 247–252. (2014). doi:10.2142/biophys.54.247. ISSN 0582-4052. https://doi.org/10.2142/biophys.54.247. 
  43. ^ a b c d Haft DH, Selengut J, Mongodin EF, Nelson KE (2005). “A Guild of 45 CRISPR-Associated (Cas) Protein Families and Multiple CRISPR/Cas Subtypes Exist in Prokaryotic Genomes”. PLoS Comput Biol. 1 (6): e60. doi:10.1371/journal.pcbi.0010060. PMC 1282333. PMID 16292354. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC1282333/. 
  44. ^ Kunin V, Sorek R, Hugenholtz P (2007). “Evolutionary conservation of sequence and secondary structures in CRISPR repeats”. Genome Biol 8 (4): R61. doi:10.1186/gb-2007-8-4-r61. PMC 1896005. PMID 17442114. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC1896005/. 
  45. ^ a b Stern A, Keren L, Wurtzel O, Amitai G, Sorek R (August 2010). “Self-targeting by CRISPR: gene regulation or autoimmunity?”. Trends Genet. 26 (8): 335–40. doi:10.1016/j.tig.2010.05.008. PMC 2910793. PMID 20598393. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2910793/. 
  46. ^ Tyson GW, Banfield JF (January 2008). “Rapidly evolving CRISPRs implicated in acquired resistance of microorganisms to viruses”. Environ. Microbiol. 10 (1): 200–7. doi:10.1111/j.1462-2920.2007.01444.x. PMID 17894817. 
  47. ^ Makarova, Kira S.; Haft, Daniel H.; Barrangou, Rodolphe; Brouns, Stan J. J.; Charpentier, Emmanuelle; Horvath, Philippe; Moineau, Sylvain; Mojica, Francisco J. M. et al. (2011-6). “Evolution and classification of the CRISPR–Cas systems” (英語). Nature Reviews Microbiology 9 (6): 467–477. doi:10.1038/nrmicro2577. ISSN 1740-1526. http://www.nature.com/articles/nrmicro2577. 
  48. ^ Makarova KS, Grishin NV, Shabalina SA, Wolf YI, Koonin EV (2006). “A putative RNA-interference-based immune system in prokaryotes: computational analysis of the predicted enzymatic machinery, functional analogies with eukaryotic RNAi, and hypothetical mechanisms of action”. Biol Direct 1: 7. doi:10.1186/1745-6150-1-7. PMC 1462988. PMID 16545108. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC1462988/. 
  49. ^ Brouns SJ, Jore MM, Lundgren M, et al. (August 2008). “Small CRISPR RNAs guide antiviral defense in prokaryotes”. Science 321 (5891): 960–4. doi:10.1126/science.1159689. PMID 18703739. 
  50. ^ Timothy R. Sampson, Sunil D. Saroj, Anna C. Llewellyn, Yih-Ling Tzeng & David S. Weiss (2013). “A CRISPR/Cas system mediates bacterial innate immune evasion and virulence”. Nature 497: 254-257. PMID 23584588. 
  51. ^ Koonin EV, Wolf YI (2009). “Is evolution Darwinian or/and Lamarckian?”. Biol Direct 4: 42. doi:10.1186/1745-6150-4-42. PMC 2781790. PMID 19906303. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2781790/. 
  52. ^ Sorek R, Kunin V, Hugenholtz P (2008). “CRISPR--a widespread system that provides acquired resistance against phages in bacteria and archaea”. Nat Rev Microbiol 6 (3): 181–6. doi:10.1038/nrmicro1793. PMID 18157154. 
  53. ^ TALエフェクターヌクレアーゼ(TALEN)を用いた効率的な遺伝子改変ラットの作製技術”. 2013年6月29日閲覧。
  54. ^ Mali, P; Yang L, Esvelt KM, Aach J, Guell M, DiCarlo JE, Norville JE, Church GM. (2013). “RNA-guided human genome engineering via Cas9.”. Science. PMID 23287722. 


「CRISPR」の続きの解説一覧



英和和英テキスト翻訳>> Weblio翻訳
英語⇒日本語日本語⇒英語
  

辞書ショートカット

すべての辞書の索引

「Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeat」の関連用語

Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeatのお隣キーワード
検索ランキング

   

英語⇒日本語
日本語⇒英語
   



Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeatのページの著作権
Weblio 辞書 情報提供元は 参加元一覧 にて確認できます。

   
ウィキペディアウィキペディア
All text is available under the terms of the GNU Free Documentation License.
この記事は、ウィキペディアのCRISPR (改訂履歴)の記事を複製、再配布したものにあたり、GNU Free Documentation Licenseというライセンスの下で提供されています。 Weblio辞書に掲載されているウィキペディアの記事も、全てGNU Free Documentation Licenseの元に提供されております。

©2024 GRAS Group, Inc.RSS