自己スプライシング型イントロンとは? わかりやすく解説

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自己スプライシング型イントロン

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自己スプライシング型イントロン

出典: フリー百科事典『ウィキペディア(Wikipedia)』 (2021/02/20 00:37 UTC 版)

Pre-mRNA スプライシング」の記事における「自己スプライシング型イントロン」の解説

上記核内mRNA前駆体のスプライシング全ての真核生物見られる一般的な生命現象であるが、まれにスプライソソームを必要としない自己スプライシング型イントロンも存在する自己スプライシングとは、前駆体中のイントロン自身特定の構造折りたたみ自身切り出す触媒反応である。様式グループⅠグループⅡ2つ確認されている。平均的な自己スプライシング型イントロンは400から1000bpであるとされるグループⅡイントロンmRNA前駆体と同様、分岐部位のA残基5'-スプライス部位反応して第一エステル転移ラリアット形成成される。そのため結果だけを見ればスプライソソーム介したスプライシング反応変わらないラリアット構造形成されたばかり第二スプライシング反応前にスプライシング重要なドメインmRNA前駆体内で形成されるドメインⅠDは5'-スプライス部位3'-スプライス部位接近させる。ドメインⅠCは5'-スプライス部位とその上部位との塩基対である。ドメインⅤドメインⅠDとドメインⅥの間で形成されるステムループである。そのドメインⅥ分岐部位を含む部位上流部位とのステムループである。 グループⅠイントロンmRNA前駆体とは異なり分岐部位のA残基ではなく遊離のGヌクレオチドまたはヌクレオシド用いる。mRNAはGを捕まえて巧みに変形することで、Gの水酸基5'-スプライス部位へと近づくラリアット構造形成と同じタイプエステル転移反応でGは5'-スプライス部位結合し代わりに5'側エクソン3'末端切り離す第二反応は書くないmRNA前駆体同様に遊離したエクソン3'末端3'側エクソン5'末端攻撃する。こうしてスプライシング反応終了するが、5'-スプライス部位分岐部位への結合がないため、排出されるイントロンラリアット構造ならないこのためグループⅠイントロンスプライシング線状イントロン観測されるのが特徴である。 グループⅠイントロングループⅡそれよりも小さく特別な二次構造を持つ。それはエステル転移反応主役となるリボース型のGヌクレオチドヌクレオシド化学結合捕まえ収容するポケットである。このほか、エステル転移反応補助する内部ガイド配列があることも知られている。この配列は、5'-スプライス部位塩基対形成することで、Gによる求核攻撃正確に行われるようにするものであるグループⅠグループⅡも、自己スプライシング型イントロンはスプライシング反応成功させるために特定の構造自身正確に折りたたむ必要があるこのためスプライソソームがある場合異なりイントロン内の配列大部分重大な意味を持つ。塩基配列同士塩基対形成高次構造構築するからである。それだけではなく、自己スプライシング型イントロンは多くタンパク質複合体形成できることもin vitro明らかになっている。これは、RNA折り畳み必要な主鎖同士接近による、主鎖中のリン酸負電荷同士反発遮蔽により防ぐためである。また、in vitro研究から遮蔽タンパク質がなくとも、プラスイオンである塩が高濃度あればよいことが示された。

※この「自己スプライシング型イントロン」の解説は、「Pre-mRNA スプライシング」の解説の一部です。
「自己スプライシング型イントロン」を含む「Pre-mRNA スプライシング」の記事については、「Pre-mRNA スプライシング」の概要を参照ください。

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