全ゲノムショットガン法
【英】: Whole-genome Shotgun Sequencing, Whole Genome Shotgun Sequencing
ゲノムの長鎖DNAの塩基配列決定法のことで、ホールゲノム・ショットガン法ともいわれる。
すべてのDNAを制限酵素(DNAを切断する酵素)で適当な断片に切断する。各々のDNA断片の両端の塩基配列を読んで、わずかな配列の重なりをコンピュータでつなぎ合わせていく。解読の精度の点では、階層化ショットガン法に比べ劣っているが、短時間でのゲノム解読を可能にする方法である。
自動DNAシーケンサー(塩基配列読み取り装置)の登場により、短期間に大量の塩基配列データが得られるようになった現在、微生物のゲノム塩基配列決定では主流の方法になっている。最近ではショウジョウバエのゲノム解析をホールゲノム・ショットガン法によって達成したと報告されている。
すべてのDNAを制限酵素(DNAを切断する酵素)で適当な断片に切断する。各々のDNA断片の両端の塩基配列を読んで、わずかな配列の重なりをコンピュータでつなぎ合わせていく。解読の精度の点では、階層化ショットガン法に比べ劣っているが、短時間でのゲノム解読を可能にする方法である。
自動DNAシーケンサー(塩基配列読み取り装置)の登場により、短期間に大量の塩基配列データが得られるようになった現在、微生物のゲノム塩基配列決定では主流の方法になっている。最近ではショウジョウバエのゲノム解析をホールゲノム・ショットガン法によって達成したと報告されている。
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