ペプチドマスフィンガープリンティングとは? わかりやすく解説

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ペプチドマスフィンガープリンティング

出典: フリー百科事典『ウィキペディア(Wikipedia)』 (2016/01/01 16:54 UTC 版)

ペプチドマスフィンガープリンティング(peptide mass fingerprinting; PMF)は、1993年に開発されたタンパク質同定方法である。この技術は同年にいくつかの研究グループによって独立に発案された[1] [2][3][4][5]


  1. ^ Pappin DJ, Hojrup P, Bleasby AJ (1993). “Rapid identification of proteins by peptide-mass fingerprinting”. Curr. Biol. 3 (6): 327–32. doi:10.1016/0960-9822(93)90195-T. PMID 15335725. 
  2. ^ Henzel WJ, Billeci TM, Stults JT, Wong SC, Grimley C, Watanabe C (1993). “Identifying proteins from two-dimensional gels by molecular mass searching of peptide fragments in protein sequence databases”. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 90 (11): 5011–5. doi:10.1073/pnas.90.11.5011. PMID 8506346. 
  3. ^ Mann M, Højrup P, Roepstorff P (1993). “Use of mass spectrometric molecular weight information to identify proteins in sequence databases”. Biol. Mass Spectrom. 22 (6): 338–45. doi:10.1002/bms.1200220605. PMID 8329463. 
  4. ^ James P, Quadroni M, Carafoli E, Gonnet G (1993). “Protein identification by mass profile fingerprinting”. Biochem. Biophys. Res. Commun. 195 (1): 58–64. doi:10.1006/bbrc.1993.2009. PMID 8363627. 
  5. ^ Yates JR, Speicher S, Griffin PR, Hunkapiller T (1993). “Peptide mass maps: a highly informative approach to protein identification”. Anal. Biochem. 214 (2): 397–408. doi:10.1006/abio.1993.1514. PMID 8109726. 
  6. ^ Clauser KR, Baker P, Burlingame AL (1999). “Role of accurate mass measurement (+/- 10 ppm) in protein identification strategies employing MS or MS/MS and database searching”. Anal. Chem. 71 (14): 2871–82. doi:10.1021/ac9810516. PMID 10424174. 
  7. ^ a b c Shevchenko A, Jensen ON, Podtelejnikov AV, Sagliocco F, Wilm M, Vorm O, Mortensen P, Shevchenko A, Boucherie H, Mann M (1996). “Linking genome and proteome by mass spectrometry: large-scale identification of yeast proteins from two dimensional gels”. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 93 (25): 14440–5. doi:10.1073/pnas.93.25.14440. PMID 8962070. 
  8. ^ 訳注:MASCOT などのプログラムは数種類のタンパク質の混在に対応している。
  9. ^ Wang W, Sun J, Nimtz M, Deckwer WD, Zeng AP (2003). “Protein identification from two-dimensional gel electrophoresis analysis of Klebsiella pneumoniae by combined use of mass spectrometry data and raw genome sequences”. Proteome Science 1 (1): 6. doi:10.1186/1477-5956-1-6. PMID 14653859. 
  10. ^ a b Hufnagel P, Rabus R (2006). “Mass spectrometric identification of proteins in complex post-genomic projects. Soluble proteins of the metabolically versatile, denitrifying 'Aromatoleum' sp. strain EbN1”. J. Mol. Microbiol. Biotechnol. 11 (1-2): 53–81. doi:10.1159/000092819. PMID 16825790. 
  11. ^ 訳注:アクリルアミド化(プロピオンアミド化)は PAGE の際に未重合アクリルアミドによって自然に引き起こされ得る。しかし泳動中の修飾だけでは不十分なため、システイン残基をアクリルアミド処理する場合には泳動後に改めて処理が行われる。


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