チミンダイマー

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チミンダイマー

分子式：	C10H12N4O4
その他の名称：	Thymine dimer、Cyclobutadithymine、cis-syn-Thymine dimer、チミンダイマー、シクロブタジチミン、cis-syn-チミンダイマー、1,4a,4b,8,8aα,8bα-Hexahydro-4aα,4bα-dimethylcyclobuta[1,2-d:4,3-d']dipyrimidine-2,4,5,7(3H,6H)-tetrone、4aβ,4bβ-Dimethyl-4a,4b,8aβ,8bβ-tetrahydrocyclobuta[1,2-d:4,3-d']dipyrimidine-2,4,5,7(1H,3H,6H,8H)-tetrone、5β,6β-[2,4(1H,3H)-Dioxo-5,6-dihydro-5-methylpyrimidine-5α,6α-diyl]-5-methyl-5,6-dihydropyrimidine-2,4(1H,3H)-dione、4aα,4bα-Dimethyl-4a,4b,8aα,8bα-tetrahydrocyclobuta[1,2-d:4,3-d']dipyrimidine-2,4,5,7(1H,3H,6H,8H)-tetraone
体系名：	1,4a,4b,8,8aα,8bα-ヘキサヒドロ-4aα,4bα-ジメチルシクロブタ[1,2-d:4,3-d']ジピリミジン-2,4,5,7(3H,6H)-テトラオン、4aβ,4bβ-ジメチル-4a,4b,8aβ,8bβ-テトラヒドロシクロブタ[1,2-d:4,3-d']ジピリミジン-2,4,5,7(1H,3H,6H,8H)-テトラオン、5β,6β-[2,4(1H,3H)-ジオキソ-5,6-ジヒドロ-5-メチルピリミジン-5α,6α-ジイル]-5-メチル-5,6-ジヒドロピリミジン-2,4(1H,3H)-ジオン、4aα,4bα-ジメチル-4a,4b,8aα,8bα-テトラヒドロシクロブタ[1,2-d:4,3-d']ジピリミジン-2,4,5,7(1H,3H,6H,8H)-テトラオン

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分子生物学用語集

チミンダイマー

チミン	シトシン

チミンやシトシンは、紫外線を吸収するとピリミジン環の二重結合が開裂して、DNA2重らせん上の隣の塩基同士で共有結合を形成することがある。特によく見られるのが隣り合うチミン同士が結合する「チミンダイマー」である。

ダイマーが形成されると塩基付近の立体構造が大きく変わるため、酵素が塩基を正しく認識できなくなる。DNAの複製を行うDNAポリメラーゼは、ダイマーとなった塩基CCに対合する塩基として、通常のG(グアニン)ではなく、A(アデニン)を繋いでしまうことがある。そのため、娘細胞には変異した遺伝子が伝えられることになる。もし、このような変異がSrcチロシンキナーゼやp53ガン抑制遺伝子上で起きると、娘細胞がガン化してしまう。

1N4E - Deoxyribonucleic Acid

Crystal Structure Of A Dna Decamer Containing A Thymine- Dimer

1TTD - Deoxyribonucleic Acid

Solution-State Structure Of A Dna Dodecamer Duplex Containing A Cis-Syn Thymine Cyclobutane Dimer

修復機構

細胞には、ダイマーを形成してしまった塩基によって変異が蓄積しないような修復機構が備わっている。

除去 - 1vas

1VAS - HydrolaseDNA

Atomic Model Of A Pyrimidine Dimer Specific Excision Repair Enzyme Complexed With A Dna Substrate: Structural Basis For Damaged Dna Recognition

このエンドヌクレアーゼは、ダイマーとなった塩基を切り出して除去する。除去された後は、正しい塩基がポリメラーゼによって埋められ、リガーゼで繋がれる。この酵素は、チミンダイマー部分を直接認識しているのではなく、水素結合が無くなってふらふらしているアデニン部分を認識して切り出しているらしい。

修正 - 1tez

1TEZ - LyaseDNA

Complex Between Dna And The Dna Photolyase From Anacystis Nidulans

リガンド：C|FAD|G|HDF|MG|TCP

このフォトリアーゼは、紫外光を利用してダイマーになった塩基を直接切り出す。

Reference

• Quality control by DNA repair.
  Lindahl T, Wood RD
  Science286p1897-905(1999 Dec 3)

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