タンパク質ファミリー

生物学用語辞典

ファミリー

同義/類義語：遺伝子族, タンパク質ファミリー
英訳・(英)同義/類義語：family

構造上も機能上も相互によく似た遺伝子の一群。免疫グロブリンファミリー、Gタンパクファミリーなど。

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タンパク質ファミリー

出典: フリー百科事典『ウィキペディア（Wikipedia）』 (2022/06/10 09:41 UTC 版)

タンパク質ファミリー（タンパクしつファミリー、英: protein family）とは、進化上の共通祖先に由来すると推定されるタンパク質をまとめたグループである。生物を進化系統により分類するように、タンパク質を進化の観点から分類する意味がある。同様の概念で遺伝子をまとめた「遺伝子ファミリー」（遺伝子族）もあるが、これもタンパク質ファミリーにほぼ対応する（タンパク質をコードしないncRNA遺伝子を除く）。

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タンパク質ファミリー

出典: フリー百科事典『ウィキペディア（Wikipedia）』 (2022/06/13 13:42 UTC 版)

「タンパク質ドメイン」の記事における「タンパク質ファミリー」の解説

分子進化の研究により、似たような配列、構造を持つタンパク質のファミリーという概念が生まれた。しかし配列の相同性は同じ構造を持つタンパク質同士でも著しく低いこともある。共通の祖先から分岐したためにタンパク質の構造が似る場合もあるが、二次構造の安定化の仕方が共通だったり、進化の過程でたまたま同じような構造を取ることも少なくない。現在では4万5000を超えるタンパク質の三次元構造が実験的に解かれ、蛋白質構造データバンクに登録されている。しかしここには全く同じかほとんど同じ構造も多数含まれている。全てのタンパク質は進化的な関係を考慮してファミリーに分類されるべきである。しかしドメインレベルでは構造の比較が最も上手くいくため、タンパク質をドメインの三次元構造で分類する多くのアルゴリズムが開発された。